29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2566 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2566  extracellular repeat protein, HAF family  100 
 
 		 516 aa  1019    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  42.01 
 
 		 1193 aa  106  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1424  extracellular repeat protein, HAF family  28.98 
 
 		 386 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371296 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1986  extracellular HAF  32.87 
 
 		 489 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0338613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0987  hypothetical protein  33.05 
 
 		 358 aa  97.8  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779307  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4152  hypothetical protein  33.92 
 
 		 363 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3422  twin-arginine translocation pathway signal  35.74 
 
 		 388 aa  93.2  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0067  extracellular repeat protein, HAF family  33.55 
 
 		 391 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.899594  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  29.63 
 
 		 833 aa  90.5  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  37.7 
 
 		 3802 aa  89.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1232  PKD domain-containing protein  36.63 
 
 		 2706 aa  84.3  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0068  extracellular repeat protein, HAF family  28.49 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00675708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4831  extracellular HAF  32.04 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0943414  normal  0.0197145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1981  extracellular HAF  31.87 
 
 		 344 aa  72.8  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1849  extracellular HAF  35.93 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6689  extracellular HAF  33.99 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0743  hypothetical protein  32.11 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.890074  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2669  integral membrane protein  32.74 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.652758  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1677  hypothetical protein  54.22 
 
 		 288 aa  66.6  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0790  hypothetical protein  28.57 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4330  extracellular HAF  48.53 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0114765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2382  extracellular repeat protein, HAF family  31.28 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  31.3 
 
 		 468 aa  57  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5044  hypothetical protein  33.83 
 
 		 378 aa  54.7  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.438034  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2020  hypothetical protein  46.15 
 
 		 260 aa  53.9  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2651  hypothetical protein  38.37 
 
 		 433 aa  51.6  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  26.9 
 
 		 2169 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1923  hypothetical protein  30.7 
 
 		 294 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2200  hypothetical protein  32.14 
 
 		 454 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>