More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3310 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3310  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 236 aa  484  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1793  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  54.78 
 
 		 231 aa  263  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2346  ABC transporter-related protein  52.17 
 
 		 221 aa  245  4e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0523662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2802  ABC transporter related  54.11 
 
 		 225 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1748  ABC transporter related  50.43 
 
 		 276 aa  238  8e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00373907  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1544  ABC transporter related  49.13 
 
 		 225 aa  230  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.75811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1769  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  56.99 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0632527  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1898  ABC transporter related  52.5 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2484  ABC transporter related  58.76 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2744  ABC transporter related  45.81 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.600258  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1447  ABC transporter related  42 
 
 		 216 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3493  ABC transporter related  40.7 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1497  ABC transporter related  38.19 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07291  putative phosphonate ABC transporter  33.2 
 
 		 244 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305194  hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0104  ATPase  32.5 
 
 		 244 aa  118  6e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2784  ABC transporter related  32.48 
 
 		 242 aa  118  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.197707 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1184  ATPase  36.57 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.795417  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4361  ABC transporter related  33.33 
 
 		 264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0829786  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0825  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.91 
 
 		 269 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  0.0442115 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07851  putative phosphonate ABC transporter  34.67 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0866  ABC transporter related  33.48 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1293  ATPase  33.91 
 
 		 234 aa  108  5e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.484642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0694  ABC transporter  32.9 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.109577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1594  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.05 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5876  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  28.24 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14301  putative phosphonate ABC transporter  33.19 
 
 		 247 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3919  ABC transporter related protein  30.56 
 
 		 275 aa  104  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2247  ABC transporter  31.38 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3516  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  27.8 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4994  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  28.94 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2299  ABC phosphate/phosphonate transport system ATPase  27.93 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0829  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.7 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1805  ABC transporter ATP-binding protein  29.69 
 
 		 267 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1649  ABC transporter related protein  31.48 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.09 
 
 		 237 aa  101  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4668  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.74 
 
 		 300 aa  101  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  decreased coverage  0.000827837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1745  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  30.17 
 
 		 278 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21160  ABC transporter ATP-binding protein  29.69 
 
 		 267 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.511735  normal  0.707952 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0790  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.47 
 
 		 265 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3324  ATPase  28.45 
 
 		 275 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1447  ABC transporter related  34.42 
 
 		 346 aa  99.4  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.450122 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  34.1 
 
 		 242 aa  99.8  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  31.56 
 
 		 351 aa  99.4  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2433  ABC transporter-like  29 
 
 		 265 aa  99  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814206  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4117  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.2 
 
 		 282 aa  99.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2156  phosphonate ABC transporter ATP-binding  29.79 
 
 		 253 aa  98.6  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0335  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  29.87 
 
 		 246 aa  98.6  7e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20300  ATP-binding component of ABC phosphonate transporter  29.75 
 
 		 278 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.540657  normal  0.410183 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl572  phosphonate ABC transporter ATP-binding component  29.61 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1097  ATPase  31.28 
 
 		 254 aa  97.4  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1758  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  29.02 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.228695  normal  0.0130766 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3963  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  28.57 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.704771 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3350  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  31.2 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3338  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  31.2 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2890  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.46 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0336941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0839  ABC phophonates transporter, ATPase subunit PhnC  29.61 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0851593 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  32.02 
 
 		 364 aa  97.1  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1433  ABC transporter related  36.04 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3304  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  31.2 
 
 		 307 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296205  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2367  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.24 
 
 		 277 aa  96.7  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4431  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.8 
 
 		 284 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0393  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  27.73 
 
 		 264 aa  96.7  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0349  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  33.48 
 
 		 240 aa  96.3  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1152  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  35.29 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4432  phosphonate ABC transporter ATP-binding  31 
 
 		 271 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0528  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  29.87 
 
 		 258 aa  96.3  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191469  normal  0.015863 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  30.53 
 
 		 246 aa  95.9  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2555  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  29.88 
 
 		 277 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3091  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  29.84 
 
 		 330 aa  95.5  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  31.86 
 
 		 353 aa  95.5  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  32.06 
 
 		 246 aa  95.5  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0385  ABC transporter ATP-binding protein  33.64 
 
 		 240 aa  95.5  7e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0323  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 307 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.558714  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2407  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 307 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02560  ABC transporter  29.91 
 
 		 249 aa  95.5  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.092761  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19780  Phosphonate ABC transporter, ATP binding component  29.83 
 
 		 266 aa  95.5  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211931  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1184  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 307 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2593  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 307 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07271  putative phosphonate ABC transporter  27.71 
 
 		 246 aa  95.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0413071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  30.49 
 
 		 242 aa  95.1  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0309  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  27.83 
 
 		 262 aa  95.1  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.053951 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3865  phosphonate ABC transporter ATP-binding  28.89 
 
 		 272 aa  95.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3019  ABC transporter related  27.73 
 
 		 507 aa  95.1  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00068  thiamin transporter subunit  33.33 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3533  ABC transporter, ATPase subunit, ThiQ subfamily  32.68 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  31.11 
 
 		 351 aa  94.7  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0068  thiamine transporter ATP-binding subunit  33.33 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0768  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.4 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3198  ABC transporter related  27.56 
 
 		 266 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3591  thiamine transporter ATP-binding subunit  33.33 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.205746  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0058  thiamine transporter ATP-binding subunit  31.9 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1616  ABC transporter related  28.03 
 
 		 277 aa  94.4  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0070  thiamine transporter ATP-binding subunit  33.33 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4373  ABC transporter related  32.02 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1000  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  28.69 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1231  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.37 
 
 		 265 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.353455 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5579  ABC transporter related  33.17 
 
 		 361 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.157659 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0489  ABC transporter-related protein  26.34 
 
 		 498 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.878745  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  31.98 
 
 		 248 aa  94.4  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0071  thiamine transporter ATP-binding subunit  32.52 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>