More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0656 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0656  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  100 
 
 
368 aa  765    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1477  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.44 
 
 
386 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.748261  normal  0.0218016 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0222  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.25 
 
 
391 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2660  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.58 
 
 
383 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0893732  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2593  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.43 
 
 
382 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000406118 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1681  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  45.31 
 
 
383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.6 
 
 
389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2767  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.31 
 
 
383 aa  306  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2852  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.04 
 
 
383 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000148188 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1607  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  41.65 
 
 
390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.04 
 
 
383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2130  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.46 
 
 
361 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0313318  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1499  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.77 
 
 
383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.74062  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1493  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.04 
 
 
383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1379  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  45.38 
 
 
368 aa  298  9e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1671  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.4 
 
 
376 aa  295  9e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.819283  hitchhiker  0.00169193 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1939  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.4 
 
 
374 aa  295  1e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3198  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.57 
 
 
381 aa  294  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.716218  hitchhiker  0.0056417 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2779  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.48 
 
 
392 aa  292  8e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.701645  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1342  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.09 
 
 
372 aa  291  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.757907  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01906  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  43.16 
 
 
376 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.668457  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000371  enoyl-CoA hydratase [valine degradation]/enoyl-CoA hydratase (isoleucine degradation)  43.49 
 
 
394 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01706  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 
390 aa  282  8.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.676708  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.71 
 
 
371 aa  269  7e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2472  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.91 
 
 
369 aa  269  7e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0119935 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0950  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.48 
 
 
376 aa  265  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.133891  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1373  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 
367 aa  257  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.502408  normal  0.0715263 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1348  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.14 
 
 
370 aa  256  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18532  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2064  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.62 
 
 
367 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1732  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.42 
 
 
350 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.942683  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2322  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.12 
 
 
351 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2163  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.94 
 
 
350 aa  249  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0211333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2457  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.37 
 
 
351 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0809825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3002  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.79 
 
 
351 aa  246  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0905193 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2384  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.61 
 
 
351 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.25475  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54660  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.94 
 
 
367 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0415328  hitchhiker  0.0000113025 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1053  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.75 
 
 
368 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4776  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.21 
 
 
367 aa  242  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2132  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.03 
 
 
351 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00488418  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2195  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.5 
 
 
351 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2118  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.03 
 
 
351 aa  240  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2356  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.5 
 
 
351 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05486  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.75 
 
 
374 aa  239  8e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3652  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.34 
 
 
369 aa  238  9e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2375  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.96 
 
 
351 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4398  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.25 
 
 
368 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1412  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.21 
 
 
368 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.78202  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001549  enoyl-CoA hydratase [valine degradation]/enoyl-CoA hydratase (isoleucine degradation)  36.02 
 
 
379 aa  236  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.21 
 
 
368 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0249  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.68 
 
 
370 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0903  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.42 
 
 
413 aa  228  2e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.747224 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.5 
 
 
427 aa  226  3e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1514  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.07 
 
 
414 aa  226  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3491  enoly-coenzyme A hydratase/isomerase family protein  34.92 
 
 
357 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1082  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 
423 aa  223  4e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.363102 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1594  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.84 
 
 
375 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2280  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 
357 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.18 
 
 
360 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206594  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2437  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.84 
 
 
356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484905  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2864  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.46 
 
 
368 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.298251  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36 
 
 
350 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.615886  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5328  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.37 
 
 
379 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0116155  normal  0.0410318 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5131  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.98 
 
 
383 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.469917  normal  0.668037 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0089  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  36.11 
 
 
379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3409  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.37 
 
 
379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.37 
 
 
379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.260667 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4380  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.94 
 
 
379 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.12865 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2060  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  35.56 
 
 
356 aa  214  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2884  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.34 
 
 
356 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.16 
 
 
379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.0486568 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2022  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.18 
 
 
383 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195874 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0933  hypothetical protein  35.47 
 
 
352 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0719  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.11 
 
 
379 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.33689  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2887  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 
355 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115929 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0902  hypothetical protein  35.2 
 
 
352 aa  208  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2019  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.98 
 
 
360 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3591  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.81 
 
 
345 aa  207  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.52 
 
 
379 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.611777 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0616  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.47 
 
 
344 aa  206  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423335  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06844  mitochondrial 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12790)  34.94 
 
 
505 aa  205  8e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.608816 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4261  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.32 
 
 
376 aa  205  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 
346 aa  205  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.540353  hitchhiker  0.0000619803 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1131  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.98 
 
 
414 aa  202  9e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663045  normal  0.545416 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1455  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 
356 aa  202  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2495  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.64 
 
 
376 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1742  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.76 
 
 
374 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05575  putative enoyl-coenzyme A hydratase protein  36.11 
 
 
390 aa  199  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2183  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.07 
 
 
382 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0831  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.07 
 
 
382 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0923  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.07 
 
 
382 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451836  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1222  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  35.13 
 
 
369 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.9 
 
 
358 aa  196  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1298  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.56 
 
 
376 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0260936  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3978  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.78 
 
 
383 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7569  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.6 
 
 
352 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3300  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.97 
 
 
357 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2557  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  32.19 
 
 
357 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4091  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.78 
 
 
383 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0330576  normal  0.12055 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2037  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.8 
 
 
360 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.820992  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1089  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.75 
 
 
382 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0147418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>