More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0906 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0906  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  100 
 
 
283 aa  560  1e-158  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100399  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  36.47 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  33.08 
 
 
275 aa  165  8e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
274 aa  165  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2874  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
304 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0465217 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.95 
 
 
278 aa  161  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.15 
 
 
289 aa  159  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467109  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
277 aa  159  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000457855  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
298 aa  159  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
275 aa  158  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5710  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.56 
 
 
280 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.249557  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
280 aa  158  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.5 
 
 
275 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  33.33 
 
 
272 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
273 aa  156  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0255  ABC-type maltose transport system, permease component  30.14 
 
 
276 aa  156  3e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
272 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2510  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  29.96 
 
 
278 aa  155  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.686515 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
277 aa  155  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603353  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.09 
 
 
270 aa  155  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
270 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
309 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  33.33 
 
 
273 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0631  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  34.07 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.59 
 
 
290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0699  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  34.07 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0537  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease  33.7 
 
 
273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0479  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  33.7 
 
 
273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0481  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  33.7 
 
 
273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0568  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease protein  33.7 
 
 
273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0624  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  33.7 
 
 
273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0605  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
273 aa  152  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 
292 aa  152  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4734  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
273 aa  152  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
280 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0326071  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
270 aa  151  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1924  sugar ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 
271 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444482  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
297 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.714989  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
273 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  27.9 
 
 
297 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
301 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107146  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 
296 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.500307  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
293 aa  149  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
274 aa  149  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.610741  hitchhiker  0.000350702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.78 
 
 
722 aa  147  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0626826  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.92 
 
 
311 aa  145  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  31.5 
 
 
277 aa  145  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  29.48 
 
 
278 aa  145  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.97 
 
 
268 aa  145  8.000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.353997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  31.14 
 
 
277 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  30.12 
 
 
278 aa  144  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.04 
 
 
280 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.14397 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31 
 
 
304 aa  143  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 
288 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.34 
 
 
300 aa  143  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.385749  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
279 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2748  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.25 
 
 
306 aa  143  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925228  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3155  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.32 
 
 
283 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.599669  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 
297 aa  142  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0358856  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
302 aa  142  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.316897  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
312 aa  142  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
281 aa  142  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.302413  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
304 aa  142  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0194  MalG-type ABC sugar transport system permease component  35.04 
 
 
285 aa  142  7e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.3 
 
 
315 aa  142  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3301  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.15 
 
 
291 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000413276 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.81 
 
 
282 aa  141  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.37 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.4668 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  26.64 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709644  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
280 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1314  ABC transporter, permease protein  32.86 
 
 
273 aa  140  3e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
301 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  31.54 
 
 
281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17142  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.95 
 
 
290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.82 
 
 
297 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195165  normal  0.550162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.2 
 
 
295 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  hitchhiker  0.00173435 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5763  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.55 
 
 
350 aa  138  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.411796  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.96 
 
 
285 aa  138  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000816013  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.01 
 
 
294 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000583333  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.57 
 
 
315 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 
297 aa  137  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 
278 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.482027  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
300 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  0.306181 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.41 
 
 
298 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.15321  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
406 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0947722  normal  0.449211 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.97 
 
 
267 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705466  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.5 
 
 
275 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
283 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
268 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.09 
 
 
271 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 
278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.716321  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12076  sugar ABC transporter membrane protein  30.62 
 
 
280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1289  ABC transporter, permease protein  30.36 
 
 
303 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 
307 aa  136  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.556058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>