More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2556 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2556  major facilitator family transporter  100 
 
 		 430 aa  830    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2259  nitrite extrusion protein, putative  99.53 
 
 		 430 aa  828    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0170  major facilitator superfamily MFS_1  48.43 
 
 		 452 aa  368  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1586  major facilitator transporter  49.18 
 
 		 448 aa  326  6e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0030166  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0505  major facilitator transporter  42.27 
 
 		 437 aa  241  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0881  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 417 aa  228  1e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.58272 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1747  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  26.92 
 
 		 895 aa  136  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  26.49 
 
 		 912 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 417 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 389 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  31.46 
 
 		 389 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  31.46 
 
 		 389 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  31.46 
 
 		 389 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  31.46 
 
 		 389 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  31.46 
 
 		 389 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  31.46 
 
 		 389 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  31.46 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  31.46 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  25.4 
 
 		 905 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 426 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 389 aa  126  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 389 aa  126  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 425 aa  125  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  27.72 
 
 		 435 aa  123  8e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 413 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  26.92 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  27.21 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 441 aa  121  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 		 444 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  28.68 
 
 		 431 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 440 aa  120  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 416 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 		 443 aa  119  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 		 398 aa  119  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 435 aa  119  9e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  26.8 
 
 		 417 aa  119  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  28.42 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 418 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1630  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 422 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0458423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  25 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  25 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  24.76 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  26.8 
 
 		 436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 472 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 406 aa  114  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 460 aa  113  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  30.32 
 
 		 917 aa  113  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  28.53 
 
 		 893 aa  113  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 453 aa  113  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 460 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 472 aa  113  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  25.75 
 
 		 422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  25.85 
 
 		 431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 459 aa  111  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 394 aa  110  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  30.02 
 
 		 403 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 406 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 438 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 438 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0382  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.577765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1700  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 421 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194128  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  25 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  25.19 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  25 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  25 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 398 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  25 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0306  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 439 aa  104  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0350  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 419 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.222192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 422 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3526  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 421 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5000  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 429 aa  104  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81482  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  28.54 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1938  nitrate/nitrite transporter  24.57 
 
 		 424 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2640  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 424 aa  104  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148312  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  28.12 
 
 		 403 aa  103  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3690  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.762235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  28.71 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18730  nitrate/nitrite transporter  28.5 
 
 		 405 aa  101  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.781534  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1411  major facilitator superfamily transporter  27.27 
 
 		 433 aa  101  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 427 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 411 aa  100  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 406 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  26.87 
 
 		 406 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 406 aa  100  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 421 aa  99.8  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 421 aa  99.8  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 382 aa  99.4  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>