More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1450 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  100 
 
 		 445 aa  879    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  97.98 
 
 		 445 aa  840    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1855  magnesium transporter  43.79 
 
 		 450 aa  333  3e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647183  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0725  magnesium transporter  43.94 
 
 		 484 aa  332  1e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  38.96 
 
 		 452 aa  322  9.000000000000001e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  40.67 
 
 		 473 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  39.67 
 
 		 471 aa  315  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  39.95 
 
 		 471 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  40.8 
 
 		 482 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  37.7 
 
 		 450 aa  300  4e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  37.28 
 
 		 461 aa  295  8e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  37.28 
 
 		 461 aa  295  8e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  38.61 
 
 		 473 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  36.6 
 
 		 542 aa  292  6e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  35.83 
 
 		 442 aa  293  6e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  36.57 
 
 		 451 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  38.92 
 
 		 449 aa  289  6e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  36.9 
 
 		 481 aa  289  7e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  38.25 
 
 		 461 aa  289  8e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  38.3 
 
 		 470 aa  288  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  37.23 
 
 		 480 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  35.39 
 
 		 444 aa  288  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1619  magnesium transporter  38.26 
 
 		 481 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00438274  normal  0.116909 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  35.06 
 
 		 452 aa  283  5.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  37.21 
 
 		 479 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  36.19 
 
 		 462 aa  281  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  39 
 
 		 471 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  37.56 
 
 		 453 aa  281  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  40.05 
 
 		 470 aa  281  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  35.56 
 
 		 480 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  39 
 
 		 471 aa  280  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  35.56 
 
 		 480 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  35.56 
 
 		 480 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  39.1 
 
 		 476 aa  277  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  36.23 
 
 		 479 aa  277  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  36.91 
 
 		 453 aa  276  6e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  34.61 
 
 		 480 aa  275  9e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  36.51 
 
 		 462 aa  275  9e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  34.61 
 
 		 480 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  36.04 
 
 		 452 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3573  magnesium transporter  39.33 
 
 		 473 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433595  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2379  magnesium transporter  38.76 
 
 		 473 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  0.465291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  34.84 
 
 		 480 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4791  putative magnesium transporter MgtE-like (divalent cation transporter Mg2+/Ni2+/Co2+)  38.61 
 
 		 472 aa  272  9e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  35.73 
 
 		 482 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  35.73 
 
 		 482 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  37.47 
 
 		 471 aa  271  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  34.61 
 
 		 481 aa  271  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  34.37 
 
 		 480 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  39.1 
 
 		 461 aa  270  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  34.54 
 
 		 444 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  36.02 
 
 		 485 aa  266  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1722  magnesium transporter  37 
 
 		 462 aa  266  5e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  34.55 
 
 		 459 aa  266  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  34.3 
 
 		 453 aa  265  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3075  magnesium transporter  37.65 
 
 		 473 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1626  magnesium transporter  37.22 
 
 		 454 aa  264  2e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  33.18 
 
 		 491 aa  264  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  33.18 
 
 		 491 aa  264  3e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  34.68 
 
 		 454 aa  263  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  33.18 
 
 		 491 aa  264  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  35.66 
 
 		 453 aa  262  6.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0731  magnesium transporter  36.88 
 
 		 455 aa  262  1e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.22084  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  33.97 
 
 		 454 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1354  magnesium transporter  35.37 
 
 		 456 aa  262  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0828283  normal  0.438937 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  33.97 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  33.97 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  33.97 
 
 		 454 aa  261  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  35 
 
 		 480 aa  260  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  32.44 
 
 		 454 aa  260  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  35.56 
 
 		 480 aa  260  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  32.66 
 
 		 454 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  34.37 
 
 		 481 aa  259  6e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0523  magnesium transporter  34.88 
 
 		 467 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461011 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  34.92 
 
 		 454 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  34.92 
 
 		 454 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  34.92 
 
 		 454 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  34.68 
 
 		 454 aa  255  9e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  32.44 
 
 		 454 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  32.37 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  33.89 
 
 		 454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  30.64 
 
 		 452 aa  254  3e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0294  magnesium transporter  34.55 
 
 		 459 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  38.53 
 
 		 422 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  39.23 
 
 		 453 aa  253  6e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0681  transcriptional regulator  34.57 
 
 		 454 aa  252  9.000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  34.37 
 
 		 477 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1332  magnesium transporter  35.15 
 
 		 455 aa  251  1e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  31.93 
 
 		 460 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  36.27 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1832  magnesium transporter  35.71 
 
 		 460 aa  250  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0187947  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  33.7 
 
 		 465 aa  249  8e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2770  putative magnesium transporter  36.34 
 
 		 460 aa  249  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.304585 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  35.97 
 
 		 463 aa  246  8e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  32.4 
 
 		 466 aa  245  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2496  magnesium transporter  35.18 
 
 		 442 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  33.26 
 
 		 478 aa  245  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  34.11 
 
 		 450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  32.3 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  36.54 
 
 		 450 aa  244  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>