165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0876 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0876  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  210  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1129  hypothetical protein  58.42 
 
 		 108 aa  124  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0165  hypothetical protein  57.69 
 
 		 106 aa  123  9e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0163  hypothetical protein  57.69 
 
 		 106 aa  123  9e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000405251  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0426  hypothetical protein  58.42 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02090  hypothetical protein  53.47 
 
 		 104 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003712  hypothetical protein  51.43 
 
 		 105 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0194537  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1584  protein of unknown function DUF74  47.12 
 
 		 104 aa  114  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0452  protein of unknown function DUF74  50.5 
 
 		 107 aa  114  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0898419  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2180  hypothetical protein  52.48 
 
 		 144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.907346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1519  protein of unknown function DUF74  49.04 
 
 		 106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2458  hypothetical protein  50.5 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183821  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1853  hypothetical protein  52.63 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2142  hypothetical protein  52.63 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0381  hypothetical protein  51.49 
 
 		 105 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.251834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1015  protein of unknown function DUF74  50.5 
 
 		 104 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.512702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2460  protein of unknown function DUF74  53 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000201008  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2095  hypothetical protein  49.5 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1285  hypothetical protein  50.5 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.424427  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0176  hypothetical protein  52.38 
 
 		 106 aa  107  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.484532  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2241  hypothetical protein  48.08 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0837  hypothetical protein  49.5 
 
 		 106 aa  104  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.475243  normal  0.0169282 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1499  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1071  protein of unknown function DUF74  47.52 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1363  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  100  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1617  hypothetical protein  50.96 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.885217  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1624  hypothetical protein  45.54 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000293634  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1828  hypothetical protein  45.54 
 
 		 112 aa  95.9  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1099  hypothetical protein  45.71 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.261096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3926  hypothetical protein  43.27 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1021  hypothetical protein  37.5 
 
 		 120 aa  84.7  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0559796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3023  hypothetical protein  38.46 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.476002  normal  0.201979 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2109  hypothetical protein  43 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184022 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0904  hypothetical protein  41 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.645309  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1822  domain of unknown function, putative  41 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1433  hypothetical protein  41 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0446  hypothetical protein  41 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1644  hypothetical protein  41 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1667  hypothetical protein  41 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0715  hypothetical protein  41 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2426  protein of unknown function DUF74  36.89 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0498449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1006  hypothetical protein  43.56 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000354976  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0999  protein of unknown function DUF74  40.7 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0734  protein of unknown function DUF74  40.59 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.639133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2656  domain of unknown function, putative  39 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0491  hypothetical protein  38.46 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.358346 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0300  protein of unknown function DUF74  40.82 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2196  protein of unknown function DUF74  42.57 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3680  hypothetical protein  39 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.440681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0236  protein of unknown function DUF74  40.59 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0782023 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3901  protein of unknown function DUF74  39.81 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0255  hypothetical protein  36.27 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0329  protein of unknown function DUF74  43.4 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.905778 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3577  hypothetical protein  37.37 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.631965 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1368  protein of unknown function DUF74  41.58 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.629963  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0637  hypothetical protein  42.57 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.110235  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2650  protein of unknown function DUF74  41.51 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2788  hypothetical protein  37.96 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0253  hypothetical protein  35.29 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2411  protein of unknown function DUF74  37.96 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0034  protein of unknown function DUF74  40.19 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.347076  normal  0.179218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0709  protein of unknown function DUF74  39.22 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104904 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5217  hypothetical protein  36.19 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3365  hypothetical protein  38.61 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.148823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3300  hypothetical protein  36.19 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398932  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5068  hypothetical protein  36.19 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0239  hypothetical protein  34.62 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2464  hypothetical protein  39.6 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0990  hypothetical protein  39.42 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.880339  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0595  hypothetical protein  34.62 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2155  hypothetical protein  38.61 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0155  hypothetical protein  39.81 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012152 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02548  hypothetical protein  42.68 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0148  hypothetical protein  38.83 
 
 		 188 aa  67  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3855  protein of unknown function DUF74  41.25 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2231  protein of unknown function DUF74  38.89 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286972  normal  0.264106 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1287  protein of unknown function DUF74  35.29 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5002  hypothetical protein  34.34 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1243  hypothetical protein  34.31 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4477  hypothetical protein  34.34 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1281  hypothetical protein  40.96 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3728  hypothetical protein  34.91 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.015177  hitchhiker  0.00988934 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4261  hypothetical protein  39.6 
 
 		 103 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000396141 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2194  hypothetical protein  35.51 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3965  hypothetical protein  39.02 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0613428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3855  protein of unknown function DUF74  36.59 
 
 		 106 aa  62  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.7494e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3455  hypothetical protein  37.62 
 
 		 103 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177402  hitchhiker  4.0879300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0888  hypothetical protein  37.63 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1010  protein of unknown function DUF74  37.63 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.00000000062015 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0398  hypothetical protein  39.62 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000107451  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3636  hypothetical protein  34.62 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.517218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1969  hypothetical protein  40.24 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674161  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5583  hypothetical protein  39.6 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0052  hypothetical protein  37.62 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1095  hypothetical protein  38.61 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.172512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0912  hypothetical protein  38.61 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0921  hypothetical protein  38.61 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0904  hypothetical protein  38.61 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1357  hypothetical protein  36.89 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0206753  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1001  hypothetical protein  38.61 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>