154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4477 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4477  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  246  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5002  hypothetical protein  96.72 
 
 		 122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5217  hypothetical protein  87.5 
 
 		 120 aa  218  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3300  hypothetical protein  85.83 
 
 		 140 aa  215  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398932  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5068  hypothetical protein  85.83 
 
 		 140 aa  215  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3577  hypothetical protein  84.3 
 
 		 122 aa  209  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.631965 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0595  hypothetical protein  83.62 
 
 		 119 aa  203  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2656  domain of unknown function, putative  69.81 
 
 		 111 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0904  hypothetical protein  68.87 
 
 		 111 aa  163  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.645309  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1822  domain of unknown function, putative  68.87 
 
 		 111 aa  163  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1433  hypothetical protein  68.87 
 
 		 111 aa  163  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0446  hypothetical protein  68.87 
 
 		 111 aa  163  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1644  hypothetical protein  68.87 
 
 		 111 aa  163  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1667  hypothetical protein  68.87 
 
 		 111 aa  163  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0715  hypothetical protein  68.87 
 
 		 111 aa  163  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3680  hypothetical protein  70.19 
 
 		 111 aa  159  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.440681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3901  protein of unknown function DUF74  62.38 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1281  hypothetical protein  59.41 
 
 		 123 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0239  hypothetical protein  52.48 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3365  hypothetical protein  49.5 
 
 		 107 aa  113  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.148823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0491  hypothetical protein  46.23 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.358346 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0253  hypothetical protein  46.46 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0255  hypothetical protein  46.46 
 
 		 105 aa  97.1  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2426  protein of unknown function DUF74  44.23 
 
 		 119 aa  94.4  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0498449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1021  hypothetical protein  43.93 
 
 		 120 aa  92  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0559796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0300  protein of unknown function DUF74  43 
 
 		 114 aa  90.9  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0637  hypothetical protein  44.12 
 
 		 105 aa  90.1  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.110235  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2109  hypothetical protein  41.75 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184022 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2180  hypothetical protein  43.62 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.907346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0452  protein of unknown function DUF74  36.89 
 
 		 107 aa  84  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0898419  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0734  protein of unknown function DUF74  42.57 
 
 		 111 aa  84  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.639133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2142  hypothetical protein  40.21 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1853  hypothetical protein  40.43 
 
 		 158 aa  80.1  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3023  hypothetical protein  41.58 
 
 		 106 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.476002  normal  0.201979 
 
 
-
 
NC_002936  DET1617  hypothetical protein  36.63 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.885217  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1368  protein of unknown function DUF74  39.6 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.629963  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0837  hypothetical protein  38.61 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.475243  normal  0.0169282 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0165  hypothetical protein  39.81 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515735  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1519  protein of unknown function DUF74  38.61 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0163  hypothetical protein  39.81 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000405251  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2241  hypothetical protein  33.98 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0176  hypothetical protein  39.6 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.484532  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1363  hypothetical protein  36.84 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1129  hypothetical protein  35.64 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1499  hypothetical protein  33.66 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2788  hypothetical protein  38.39 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2411  protein of unknown function DUF74  38.39 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1584  protein of unknown function DUF74  39.78 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2460  protein of unknown function DUF74  41.67 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000201008  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1624  hypothetical protein  35.56 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000293634  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1828  hypothetical protein  32.69 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0236  protein of unknown function DUF74  36.63 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0782023 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1071  protein of unknown function DUF74  38.61 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0990  hypothetical protein  34.62 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.880339  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1285  hypothetical protein  35.64 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.424427  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0426  hypothetical protein  35.92 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1099  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.261096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1015  protein of unknown function DUF74  36.84 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.512702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0888  hypothetical protein  41.3 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1010  protein of unknown function DUF74  41.3 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.00000000062015 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0999  protein of unknown function DUF74  33.7 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02090  hypothetical protein  38 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0709  protein of unknown function DUF74  36.7 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104904 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1006  hypothetical protein  35.92 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000354976  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003712  hypothetical protein  36 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0194537  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1752  hypothetical protein  39.81 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.421305  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0876  hypothetical protein  34.34 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2095  hypothetical protein  35 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2458  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183821  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1321  hypothetical protein  36.45 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.643002  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0381  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.251834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3098  protein of unknown function DUF74  34.91 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0254551  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1357  hypothetical protein  35.51 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0206753  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3926  hypothetical protein  35.71 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2196  protein of unknown function DUF74  32.67 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1658  hypothetical protein  34.91 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.737691  normal  0.699985 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1969  hypothetical protein  33.96 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674161  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0148  hypothetical protein  32.35 
 
 		 188 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0155  hypothetical protein  32.35 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012152 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2375  protein of unknown function DUF74  34.91 
 
 		 108 aa  50.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.791935  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00871  hypothetical protein  33.02 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.265606  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2776  protein of unknown function DUF74  33.02 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111478  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00877  hypothetical protein  33.02 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.255052  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1852  hypothetical protein  34.72 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.943704 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2155  hypothetical protein  30.69 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2179  hypothetical protein  34.52 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.780072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0970  hypothetical protein  33.02 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0939  hypothetical protein  33.02 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.114029  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1027  hypothetical protein  33.02 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2730  hypothetical protein  33.02 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.731008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2465  hypothetical protein  33.02 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.486355  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1703  hypothetical protein  33.96 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.073089  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1926  protein of unknown function DUF74  31.73 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00341675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0895  hypothetical protein  34.34 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.879578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2464  hypothetical protein  33 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2141  hypothetical protein  32.88 
 
 		 178 aa  47  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1287  protein of unknown function DUF74  33.67 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0338  hypothetical protein  30.39 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0345405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0288  hypothetical protein  34.95 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.118688  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3728  hypothetical protein  31.68 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.015177  hitchhiker  0.00988934 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>