157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3300 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3300  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  282  9e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398932  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5068  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  282  9e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5217  hypothetical protein  98.33 
 
 
120 aa  241  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0595  hypothetical protein  90.52 
 
 
119 aa  216  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5002  hypothetical protein  86.67 
 
 
122 aa  216  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618954  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4477  hypothetical protein  85.83 
 
 
122 aa  215  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3577  hypothetical protein  85 
 
 
122 aa  208  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.631965 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2656  domain of unknown function, putative  72.82 
 
 
111 aa  164  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0904  hypothetical protein  71.84 
 
 
111 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.645309  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1822  domain of unknown function, putative  71.84 
 
 
111 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1433  hypothetical protein  71.84 
 
 
111 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0446  hypothetical protein  71.84 
 
 
111 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1644  hypothetical protein  71.84 
 
 
111 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1667  hypothetical protein  71.84 
 
 
111 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0715  hypothetical protein  71.84 
 
 
111 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3680  hypothetical protein  68.27 
 
 
111 aa  157  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.440681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3901  protein of unknown function DUF74  61.95 
 
 
126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1281  hypothetical protein  60.4 
 
 
123 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0239  hypothetical protein  56.44 
 
 
126 aa  125  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3365  hypothetical protein  53.47 
 
 
107 aa  122  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.148823  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0255  hypothetical protein  48.48 
 
 
105 aa  98.6  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0253  hypothetical protein  48.48 
 
 
105 aa  98.2  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0491  hypothetical protein  47.62 
 
 
123 aa  97.4  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.358346 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2426  protein of unknown function DUF74  46.46 
 
 
119 aa  95.9  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0498449  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2109  hypothetical protein  44.66 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.184022 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2180  hypothetical protein  45.74 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.907346  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0734  protein of unknown function DUF74  44.55 
 
 
111 aa  90.9  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.639133  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0452  protein of unknown function DUF74  40.59 
 
 
107 aa  90.1  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0898419  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0300  protein of unknown function DUF74  40 
 
 
114 aa  88.6  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1021  hypothetical protein  41.58 
 
 
120 aa  86.7  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0559796  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0637  hypothetical protein  38.83 
 
 
105 aa  84  7e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.110235  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1519  protein of unknown function DUF74  40.4 
 
 
106 aa  84  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1368  protein of unknown function DUF74  41.58 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.629963  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1853  hypothetical protein  39.36 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1499  hypothetical protein  36.63 
 
 
104 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2142  hypothetical protein  39.36 
 
 
158 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0165  hypothetical protein  39.81 
 
 
106 aa  81.6  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515735  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1129  hypothetical protein  37.62 
 
 
108 aa  82  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0163  hypothetical protein  39.81 
 
 
106 aa  81.6  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000405251  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1617  hypothetical protein  37.62 
 
 
104 aa  80.9  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.885217  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1584  protein of unknown function DUF74  40.86 
 
 
104 aa  80.1  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2460  protein of unknown function DUF74  43.01 
 
 
108 aa  80.1  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000201008  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0176  hypothetical protein  40.38 
 
 
106 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.484532  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0837  hypothetical protein  39.6 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.475243  normal  0.0169282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3023  hypothetical protein  41.58 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.476002  normal  0.201979 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2788  hypothetical protein  38.53 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0990  hypothetical protein  38.38 
 
 
114 aa  79  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.880339  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1363  hypothetical protein  37.89 
 
 
104 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2411  protein of unknown function DUF74  38.53 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0426  hypothetical protein  37.62 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1071  protein of unknown function DUF74  40.59 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523097  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1828  hypothetical protein  35.58 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1624  hypothetical protein  40.7 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000293634  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2241  hypothetical protein  33.98 
 
 
105 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0236  protein of unknown function DUF74  37.62 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0782023 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1006  hypothetical protein  36.94 
 
 
108 aa  73.6  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000354976  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1099  hypothetical protein  37 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.261096  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0999  protein of unknown function DUF74  34.78 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1285  hypothetical protein  33.66 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.424427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0709  protein of unknown function DUF74  38.68 
 
 
122 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104904 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1015  protein of unknown function DUF74  35.79 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.512702  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0876  hypothetical protein  36.19 
 
 
106 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2095  hypothetical protein  37 
 
 
107 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1010  protein of unknown function DUF74  38.71 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.00000000062015 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0888  hypothetical protein  38.71 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003712  hypothetical protein  37 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0194537  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02090  hypothetical protein  36 
 
 
104 aa  67  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0381  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  65.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.251834  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1321  hypothetical protein  37.38 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.643002  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2458  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3926  hypothetical protein  37.63 
 
 
103 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1752  hypothetical protein  36.89 
 
 
114 aa  61.2  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.421305  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2196  protein of unknown function DUF74  35.64 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3098  protein of unknown function DUF74  33.02 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0254551  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1969  hypothetical protein  34.62 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1095  hypothetical protein  32.67 
 
 
103 aa  52  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.172512  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0052  hypothetical protein  32.67 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0912  hypothetical protein  32.67 
 
 
103 aa  52  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0936  hypothetical protein  32.67 
 
 
103 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0921  hypothetical protein  32.67 
 
 
103 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3206  hypothetical protein  32.67 
 
 
103 aa  51.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000713419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0904  hypothetical protein  32.67 
 
 
103 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0039  hypothetical protein  32.67 
 
 
103 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1287  protein of unknown function DUF74  37.76 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1001  hypothetical protein  32.67 
 
 
103 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1891  hypothetical protein  32.67 
 
 
103 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00410284  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2464  hypothetical protein  34 
 
 
104 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1168  hypothetical protein  32.67 
 
 
103 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1042  hypothetical protein  32.67 
 
 
103 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3460  hypothetical protein  32.67 
 
 
103 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00419456  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1077  hypothetical protein  32.67 
 
 
103 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14878e-50 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1016  hypothetical protein  32.67 
 
 
103 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000549943  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2155  hypothetical protein  33.66 
 
 
103 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0148  hypothetical protein  30.28 
 
 
188 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2179  hypothetical protein  34.52 
 
 
163 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.780072  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00871  hypothetical protein  35.42 
 
 
107 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.265606  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2776  protein of unknown function DUF74  35.42 
 
 
107 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111478  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1027  hypothetical protein  35.42 
 
 
107 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0155  hypothetical protein  31.37 
 
 
154 aa  50.4  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012152 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2730  hypothetical protein  35.42 
 
 
107 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.731008  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>