168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02090 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02090  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  206  9e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003712  hypothetical protein  85.44 
 
 
105 aa  182  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0194537  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0381  hypothetical protein  83.5 
 
 
105 aa  174  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.251834  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2458  hypothetical protein  81.55 
 
 
105 aa  171  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183821  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2095  hypothetical protein  80.58 
 
 
107 aa  170  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0165  hypothetical protein  61.17 
 
 
106 aa  141  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0163  hypothetical protein  61.17 
 
 
106 aa  141  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000405251  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1129  hypothetical protein  60.58 
 
 
108 aa  140  9e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0426  hypothetical protein  55.34 
 
 
108 aa  130  7.999999999999999e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1015  protein of unknown function DUF74  54.37 
 
 
104 aa  122  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.512702  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2460  protein of unknown function DUF74  52.58 
 
 
108 aa  120  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000201008  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0876  hypothetical protein  53.47 
 
 
106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1285  hypothetical protein  53.85 
 
 
107 aa  118  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.424427  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2142  hypothetical protein  56.57 
 
 
158 aa  116  9e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0837  hypothetical protein  50.49 
 
 
106 aa  116  9e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.475243  normal  0.0169282 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1853  hypothetical protein  56.57 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2241  hypothetical protein  49.51 
 
 
105 aa  114  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1363  hypothetical protein  50.5 
 
 
104 aa  113  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0452  protein of unknown function DUF74  49.51 
 
 
107 aa  113  8.999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0898419  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2180  hypothetical protein  52.94 
 
 
144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.907346  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1617  hypothetical protein  50.5 
 
 
104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.885217  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1584  protein of unknown function DUF74  46.6 
 
 
104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1499  hypothetical protein  49.5 
 
 
104 aa  112  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0176  hypothetical protein  54.46 
 
 
106 aa  111  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.484532  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1624  hypothetical protein  51.46 
 
 
105 aa  108  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000293634  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1099  hypothetical protein  54.81 
 
 
108 aa  107  7.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.261096  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1519  protein of unknown function DUF74  46.53 
 
 
106 aa  106  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1828  hypothetical protein  51.46 
 
 
112 aa  103  5e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1071  protein of unknown function DUF74  49.49 
 
 
111 aa  102  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523097  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0999  protein of unknown function DUF74  43.18 
 
 
100 aa  91.3  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2109  hypothetical protein  47.57 
 
 
108 aa  90.5  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.184022 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3926  hypothetical protein  45.54 
 
 
103 aa  90.5  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0236  protein of unknown function DUF74  44.44 
 
 
141 aa  87  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0782023 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1021  hypothetical protein  40.59 
 
 
120 aa  85.9  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0559796  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3023  hypothetical protein  43.56 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.476002  normal  0.201979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2426  protein of unknown function DUF74  40.21 
 
 
119 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0498449  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0734  protein of unknown function DUF74  38.61 
 
 
111 aa  80.9  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.639133  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1368  protein of unknown function DUF74  42.57 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.629963  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0255  hypothetical protein  41.58 
 
 
105 aa  80.1  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0253  hypothetical protein  41.84 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3680  hypothetical protein  42.42 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.440681 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2196  protein of unknown function DUF74  40.78 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0990  hypothetical protein  40.59 
 
 
114 aa  76.3  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.880339  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0997  hypothetical protein  45.19 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.797199  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3098  protein of unknown function DUF74  42.72 
 
 
109 aa  75.5  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0254551  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0965  hypothetical protein  45.19 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1047  hypothetical protein  45.19 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0491  hypothetical protein  37.62 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.358346 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1028  hypothetical protein  45.19 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0930  hypothetical protein  45.19 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0300  protein of unknown function DUF74  38.14 
 
 
114 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1287  protein of unknown function DUF74  38.83 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1382  hypothetical protein  42.31 
 
 
107 aa  72.8  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35022  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3901  protein of unknown function DUF74  37.76 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2656  domain of unknown function, putative  37.37 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0637  hypothetical protein  39.81 
 
 
105 aa  71.6  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.110235  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0904  hypothetical protein  37.37 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.645309  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1822  domain of unknown function, putative  37.37 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1433  hypothetical protein  37.37 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0446  hypothetical protein  37.37 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1644  hypothetical protein  37.37 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1667  hypothetical protein  37.37 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0715  hypothetical protein  37.37 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3855  protein of unknown function DUF74  37.74 
 
 
106 aa  70.5  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.7494e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1281  hypothetical protein  43.02 
 
 
123 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0895  hypothetical protein  41.35 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.879578  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2650  protein of unknown function DUF74  37.86 
 
 
106 aa  70.1  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00871  hypothetical protein  41.35 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.265606  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2776  protein of unknown function DUF74  41.35 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111478  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2465  hypothetical protein  41.35 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.486355  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00877  hypothetical protein  41.35 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.255052  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1027  hypothetical protein  41.35 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2464  hypothetical protein  43.14 
 
 
104 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0970  hypothetical protein  41.35 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0939  hypothetical protein  41.35 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.114029  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3577  hypothetical protein  37 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.631965 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2730  hypothetical protein  41.35 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.731008  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1703  hypothetical protein  41.9 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.073089  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1926  protein of unknown function DUF74  40.23 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00341675  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2231  protein of unknown function DUF74  36.79 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286972  normal  0.264106 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3795  hypothetical protein  41.12 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.338239  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4477  hypothetical protein  38 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1006  hypothetical protein  37.86 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000354976  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5217  hypothetical protein  37 
 
 
120 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3365  hypothetical protein  34.95 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.148823  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0709  protein of unknown function DUF74  38.78 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104904 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5583  hypothetical protein  37.86 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1658  hypothetical protein  41.9 
 
 
107 aa  67.8  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.737691  normal  0.699985 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1321  hypothetical protein  36.45 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.643002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1095  hypothetical protein  38.83 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.172512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0912  hypothetical protein  38.83 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3728  hypothetical protein  40 
 
 
106 aa  67  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.015177  hitchhiker  0.00988934 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2275  protein of unknown function DUF74  40 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3300  hypothetical protein  36 
 
 
140 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398932  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5068  hypothetical protein  36 
 
 
140 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5002  hypothetical protein  37 
 
 
122 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618954  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0904  hypothetical protein  37.86 
 
 
103 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0595  hypothetical protein  35.71 
 
 
119 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1001  hypothetical protein  37.86 
 
 
103 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2411  protein of unknown function DUF74  34.65 
 
 
117 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>