157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3965 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3965  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  202  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0613428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0439  hypothetical protein  73.53 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.130742  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2093  hypothetical protein  73.53 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297611  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2361  hypothetical protein  72.55 
 
 		 103 aa  155  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.875715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3728  hypothetical protein  67.92 
 
 		 106 aa  145  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.015177  hitchhiker  0.00988934 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1926  protein of unknown function DUF74  64.49 
 
 		 108 aa  144  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00341675  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1628  UPF0145 protein  69.23 
 
 		 104 aa  144  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.546028  hitchhiker  0.00080679 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0734  hypothetical protein  66.04 
 
 		 106 aa  142  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.827812  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1243  hypothetical protein  72.28 
 
 		 104 aa  142  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3855  protein of unknown function DUF74  65.71 
 
 		 106 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.7494e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0288  hypothetical protein  66.98 
 
 		 106 aa  137  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.118688  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2464  hypothetical protein  67.65 
 
 		 104 aa  135  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1287  protein of unknown function DUF74  63.46 
 
 		 104 aa  134  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02548  hypothetical protein  59.62 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2155  hypothetical protein  67.96 
 
 		 103 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2275  protein of unknown function DUF74  64.76 
 
 		 109 aa  133  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2375  protein of unknown function DUF74  63.81 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.791935  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2194  hypothetical protein  60 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1969  hypothetical protein  60 
 
 		 107 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674161  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0034  protein of unknown function DUF74  59.43 
 
 		 107 aa  130  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.347076  normal  0.179218 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1658  hypothetical protein  60 
 
 		 107 aa  130  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.737691  normal  0.699985 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0895  hypothetical protein  63.46 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.879578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1703  hypothetical protein  60.95 
 
 		 107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.073089  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2231  protein of unknown function DUF74  62.96 
 
 		 111 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286972  normal  0.264106 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0997  hypothetical protein  62.5 
 
 		 107 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.797199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1891  hypothetical protein  60.19 
 
 		 103 aa  128  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00410284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2650  protein of unknown function DUF74  59.43 
 
 		 106 aa  128  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0936  hypothetical protein  60.19 
 
 		 103 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0921  hypothetical protein  60.19 
 
 		 103 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0904  hypothetical protein  60.19 
 
 		 103 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0039  hypothetical protein  60.19 
 
 		 103 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1042  hypothetical protein  60.19 
 
 		 103 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1001  hypothetical protein  60.19 
 
 		 103 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1016  hypothetical protein  60.19 
 
 		 103 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000549943  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1077  hypothetical protein  60.19 
 
 		 103 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14878e-50 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1047  hypothetical protein  61.54 
 
 		 107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0930  hypothetical protein  61.54 
 
 		 107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1028  hypothetical protein  61.54 
 
 		 107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1382  hypothetical protein  61.54 
 
 		 107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0965  hypothetical protein  61.54 
 
 		 107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1168  hypothetical protein  60.19 
 
 		 103 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00871  hypothetical protein  62.5 
 
 		 107 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.265606  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2776  protein of unknown function DUF74  62.5 
 
 		 107 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111478  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1095  hypothetical protein  59.22 
 
 		 103 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.172512  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00877  hypothetical protein  62.5 
 
 		 107 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.255052  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0970  hypothetical protein  62.5 
 
 		 107 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0939  hypothetical protein  62.5 
 
 		 107 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.114029  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1027  hypothetical protein  62.5 
 
 		 107 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0912  hypothetical protein  59.22 
 
 		 103 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2730  hypothetical protein  62.5 
 
 		 107 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.731008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2465  hypothetical protein  62.5 
 
 		 107 aa  127  8.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.486355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3206  hypothetical protein  59.22 
 
 		 103 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000713419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3460  hypothetical protein  59.22 
 
 		 103 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00419456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4261  hypothetical protein  59.22 
 
 		 103 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000396141 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0338  hypothetical protein  61.9 
 
 		 105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0345405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0545  protein of unknown function DUF74  58.49 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3855  protein of unknown function DUF74  57.14 
 
 		 105 aa  124  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3455  hypothetical protein  58.25 
 
 		 103 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177402  hitchhiker  4.0879300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5583  hypothetical protein  60.19 
 
 		 103 aa  122  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4973  hypothetical protein  59.22 
 
 		 103 aa  122  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5284  hypothetical protein  59.22 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1899  protein of unknown function DUF74  59.05 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000666194 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5297  hypothetical protein  59.22 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0788  hypothetical protein  57.28 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5342  hypothetical protein  58.25 
 
 		 103 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4859  hypothetical protein  58.25 
 
 		 103 aa  121  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4874  hypothetical protein  58.25 
 
 		 103 aa  121  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5267  hypothetical protein  58.25 
 
 		 103 aa  121  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0052  hypothetical protein  58.25 
 
 		 103 aa  120  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14850  hypothetical protein  56.6 
 
 		 108 aa  120  6e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.271966  normal  0.284352 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2196  protein of unknown function DUF74  56.73 
 
 		 105 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0329  protein of unknown function DUF74  57.55 
 
 		 106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.905778 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3654  hypothetical protein  54.72 
 
 		 111 aa  118  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.361374  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2791  hypothetical protein  65.09 
 
 		 106 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0398  hypothetical protein  53.77 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000107451  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1357  hypothetical protein  52.38 
 
 		 110 aa  113  8.999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0206753  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0819  hypothetical protein  56.44 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.186166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3795  hypothetical protein  46.73 
 
 		 108 aa  103  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.338239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3636  hypothetical protein  46.6 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.517218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0420  hypothetical protein  45.79 
 
 		 108 aa  97.4  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.932362  normal  0.0258218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1745  hypothetical protein  46.67 
 
 		 106 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.305232  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5029  hypothetical protein  57.75 
 
 		 85 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2988  hypothetical protein  42.45 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2816  hypothetical protein  48.11 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2909  hypothetical protein  47.17 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2873  hypothetical protein  48.11 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2377  hypothetical protein  48.11 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.191309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3790  hypothetical protein  36.67 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1519  protein of unknown function DUF74  40.38 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_002936  DET1617  hypothetical protein  40.38 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.885217  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0990  hypothetical protein  36.54 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.880339  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1499  hypothetical protein  38.46 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1363  hypothetical protein  40.38 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1584  protein of unknown function DUF74  40.38 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0452  protein of unknown function DUF74  36.89 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0898419  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0176  hypothetical protein  38.46 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.484532  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0876  hypothetical protein  39.02 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003712  hypothetical protein  37.86 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0194537  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02090  hypothetical protein  37.86 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1285  hypothetical protein  43.75 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.424427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>