154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1006 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1006  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  219  9e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000354976  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0734  protein of unknown function DUF74  51.85 
 
 
111 aa  120  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.639133  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0637  hypothetical protein  52.38 
 
 
105 aa  110  5e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.110235  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2109  hypothetical protein  50 
 
 
108 aa  110  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.184022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0236  protein of unknown function DUF74  51.89 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0782023 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1368  protein of unknown function DUF74  51.46 
 
 
107 aa  102  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.629963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0709  protein of unknown function DUF74  45 
 
 
122 aa  96.3  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104904 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1099  hypothetical protein  46.67 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.261096  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0165  hypothetical protein  42.45 
 
 
106 aa  85.1  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515735  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1499  hypothetical protein  42.31 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0163  hypothetical protein  42.45 
 
 
106 aa  85.1  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000405251  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2426  protein of unknown function DUF74  41.67 
 
 
119 aa  84  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0498449  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0426  hypothetical protein  42.45 
 
 
108 aa  84  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1617  hypothetical protein  42.31 
 
 
104 aa  83.6  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.885217  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1519  protein of unknown function DUF74  42.86 
 
 
106 aa  83.2  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3023  hypothetical protein  42.31 
 
 
106 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.476002  normal  0.201979 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2788  hypothetical protein  38.53 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2411  protein of unknown function DUF74  38.53 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0491  hypothetical protein  39.62 
 
 
123 aa  82.4  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.358346 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0452  protein of unknown function DUF74  40.95 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0898419  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1363  hypothetical protein  40.38 
 
 
104 aa  81.3  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1021  hypothetical protein  38.32 
 
 
120 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0559796  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0876  hypothetical protein  43.56 
 
 
106 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3365  hypothetical protein  38.68 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.148823  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2241  hypothetical protein  40.95 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1752  hypothetical protein  39.82 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.421305  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1129  hypothetical protein  40.78 
 
 
108 aa  77.8  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2656  domain of unknown function, putative  39.42 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0239  hypothetical protein  39.05 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0176  hypothetical protein  42.31 
 
 
106 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.484532  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3901  protein of unknown function DUF74  38.89 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003712  hypothetical protein  39.81 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0194537  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1015  protein of unknown function DUF74  38.83 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.512702  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3098  protein of unknown function DUF74  40.57 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0254551  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0904  hypothetical protein  38.46 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.645309  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1822  domain of unknown function, putative  38.46 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2095  hypothetical protein  38.83 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1433  hypothetical protein  38.46 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0446  hypothetical protein  38.46 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1644  hypothetical protein  38.46 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1667  hypothetical protein  38.46 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0715  hypothetical protein  38.46 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3300  hypothetical protein  36.94 
 
 
140 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398932  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5068  hypothetical protein  36.94 
 
 
140 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1285  hypothetical protein  40.78 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.424427  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1010  protein of unknown function DUF74  39.58 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.00000000062015 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0595  hypothetical protein  36.94 
 
 
119 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1071  protein of unknown function DUF74  40.95 
 
 
111 aa  70.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523097  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5217  hypothetical protein  35.14 
 
 
120 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2180  hypothetical protein  36.27 
 
 
144 aa  70.1  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.907346  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1584  protein of unknown function DUF74  39.42 
 
 
104 aa  70.1  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2458  hypothetical protein  36.19 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183821  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0381  hypothetical protein  36.19 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.251834  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5002  hypothetical protein  36.89 
 
 
122 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618954  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0888  hypothetical protein  38.14 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02090  hypothetical protein  37.86 
 
 
104 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3577  hypothetical protein  33.98 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.631965 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4477  hypothetical protein  35.92 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1624  hypothetical protein  37.14 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000293634  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0155  hypothetical protein  37.14 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012152 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1828  hypothetical protein  37.5 
 
 
112 aa  67  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1853  hypothetical protein  37.89 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2142  hypothetical protein  37.89 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0148  hypothetical protein  36.19 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3680  hypothetical protein  33.65 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.440681 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3926  hypothetical protein  37.38 
 
 
103 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1281  hypothetical protein  35.29 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2231  protein of unknown function DUF74  36.04 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286972  normal  0.264106 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0255  hypothetical protein  36.89 
 
 
105 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1243  hypothetical protein  36.89 
 
 
104 aa  61.6  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0990  hypothetical protein  33.64 
 
 
114 aa  61.2  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.880339  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14850  hypothetical protein  32.41 
 
 
108 aa  60.8  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.271966  normal  0.284352 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0034  protein of unknown function DUF74  36.45 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.347076  normal  0.179218 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0439  hypothetical protein  35.29 
 
 
103 aa  60.1  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.130742  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2093  hypothetical protein  35.29 
 
 
103 aa  60.1  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297611  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2460  protein of unknown function DUF74  38.2 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000201008  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0837  hypothetical protein  37.5 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.475243  normal  0.0169282 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3965  hypothetical protein  33.01 
 
 
103 aa  59.3  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0613428  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1321  hypothetical protein  33.94 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.643002  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0300  protein of unknown function DUF74  33.66 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0253  hypothetical protein  35.92 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1899  protein of unknown function DUF74  33.96 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000666194 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3455  hypothetical protein  35.92 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177402  hitchhiker  4.0879300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0788  hypothetical protein  38.32 
 
 
103 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2361  hypothetical protein  34.31 
 
 
103 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.875715  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2464  hypothetical protein  35.29 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4261  hypothetical protein  37.38 
 
 
103 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000396141 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1926  protein of unknown function DUF74  34.58 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00341675  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1357  hypothetical protein  32.71 
 
 
110 aa  55.1  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0206753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1016  hypothetical protein  37.38 
 
 
103 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000549943  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0999  protein of unknown function DUF74  35.92 
 
 
100 aa  53.5  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1168  hypothetical protein  36.45 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1095  hypothetical protein  36.45 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.172512  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0936  hypothetical protein  36.45 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0921  hypothetical protein  36.45 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0904  hypothetical protein  36.45 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0039  hypothetical protein  36.45 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1001  hypothetical protein  36.45 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1077  hypothetical protein  36.45 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14878e-50 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0912  hypothetical protein  36.45 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>