160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1071 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1071  protein of unknown function DUF74  100 
 
 		 111 aa  223  6e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0837  hypothetical protein  55.77 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.475243  normal  0.0169282 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0452  protein of unknown function DUF74  50.96 
 
 		 107 aa  116  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0898419  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1015  protein of unknown function DUF74  51 
 
 		 104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.512702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1584  protein of unknown function DUF74  51.49 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1285  hypothetical protein  52.43 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.424427  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1519  protein of unknown function DUF74  48.51 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_002936  DET1617  hypothetical protein  52.48 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.885217  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1363  hypothetical protein  52.48 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2458  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  107  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183821  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1499  hypothetical protein  50.5 
 
 		 104 aa  105  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0381  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.251834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0426  hypothetical protein  47.12 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2180  hypothetical protein  50 
 
 		 144 aa  103  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.907346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2241  hypothetical protein  48.08 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02090  hypothetical protein  49.49 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0876  hypothetical protein  47.52 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2095  hypothetical protein  46.6 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2142  hypothetical protein  50 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1853  hypothetical protein  50 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1129  hypothetical protein  42.72 
 
 		 108 aa  100  9e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1624  hypothetical protein  44.23 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000293634  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1828  hypothetical protein  47.06 
 
 		 112 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2460  protein of unknown function DUF74  43.4 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000201008  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0165  hypothetical protein  44.23 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0163  hypothetical protein  44.23 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000405251  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2426  protein of unknown function DUF74  46.08 
 
 		 119 aa  97.8  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0498449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003712  hypothetical protein  43.69 
 
 		 105 aa  97.8  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0194537  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0176  hypothetical protein  45.54 
 
 		 106 aa  98.2  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.484532  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1021  hypothetical protein  44.12 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0559796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0999  protein of unknown function DUF74  39.81 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2109  hypothetical protein  44.23 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184022 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3680  hypothetical protein  41.75 
 
 		 111 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.440681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0734  protein of unknown function DUF74  42.2 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.639133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0491  hypothetical protein  37.04 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.358346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3023  hypothetical protein  40.59 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.476002  normal  0.201979 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0255  hypothetical protein  39.6 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0253  hypothetical protein  40.59 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2656  domain of unknown function, putative  41.58 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3365  hypothetical protein  39.42 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.148823  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0904  hypothetical protein  40.59 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.645309  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1822  domain of unknown function, putative  40.59 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1099  hypothetical protein  39.81 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.261096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1433  hypothetical protein  40.59 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0446  hypothetical protein  40.59 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1644  hypothetical protein  40.59 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1667  hypothetical protein  40.59 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0715  hypothetical protein  40.59 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3901  protein of unknown function DUF74  39.81 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3300  hypothetical protein  40.59 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398932  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5068  hypothetical protein  40.59 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0236  protein of unknown function DUF74  38.46 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0782023 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1368  protein of unknown function DUF74  42.57 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.629963  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5217  hypothetical protein  39.6 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3577  hypothetical protein  38.61 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.631965 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4477  hypothetical protein  38.61 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3926  hypothetical protein  37.62 
 
 		 103 aa  72  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1006  hypothetical protein  40.95 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000354976  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5002  hypothetical protein  37.62 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0595  hypothetical protein  38.38 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0709  protein of unknown function DUF74  36.63 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104904 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1287  protein of unknown function DUF74  39.42 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2196  protein of unknown function DUF74  33.65 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0300  protein of unknown function DUF74  35.42 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3098  protein of unknown function DUF74  39.05 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0254551  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2788  hypothetical protein  31.25 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2411  protein of unknown function DUF74  31.25 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1281  hypothetical protein  39.29 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2275  protein of unknown function DUF74  38.46 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0637  hypothetical protein  36.89 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.110235  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0239  hypothetical protein  35 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2155  hypothetical protein  35.92 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1016  hypothetical protein  34.95 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000549943  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3965  hypothetical protein  37.08 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0613428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3455  hypothetical protein  35.92 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177402  hitchhiker  4.0879300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1095  hypothetical protein  34.95 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.172512  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0936  hypothetical protein  34.95 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0921  hypothetical protein  34.95 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3206  hypothetical protein  34.95 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000713419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0904  hypothetical protein  34.95 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0039  hypothetical protein  34.95 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1001  hypothetical protein  34.95 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1168  hypothetical protein  34.95 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1077  hypothetical protein  34.95 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14878e-50 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1042  hypothetical protein  34.95 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3460  hypothetical protein  34.95 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00419456  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0912  hypothetical protein  34.95 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1891  hypothetical protein  34.95 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00410284  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0034  protein of unknown function DUF74  32.04 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.347076  normal  0.179218 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0990  hypothetical protein  35.64 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.880339  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0052  hypothetical protein  34.95 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1926  protein of unknown function DUF74  36.36 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00341675  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3636  hypothetical protein  31.43 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.517218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0420  hypothetical protein  31.48 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.932362  normal  0.0258218 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3795  hypothetical protein  30.84 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.338239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2988  hypothetical protein  34.91 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4261  hypothetical protein  33.98 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000396141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2650  protein of unknown function DUF74  33.01 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5583  hypothetical protein  33.98 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2231  protein of unknown function DUF74  34.26 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286972  normal  0.264106 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>