166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0381 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0381  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  207  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.251834  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2458  hypothetical protein  93.33 
 
 
105 aa  195  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183821  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2095  hypothetical protein  88.35 
 
 
107 aa  184  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003712  hypothetical protein  80.58 
 
 
105 aa  176  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0194537  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02090  hypothetical protein  83.5 
 
 
104 aa  174  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0165  hypothetical protein  58.1 
 
 
106 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0163  hypothetical protein  58.1 
 
 
106 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000405251  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1129  hypothetical protein  57.28 
 
 
108 aa  130  5e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1617  hypothetical protein  57.43 
 
 
104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.885217  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0426  hypothetical protein  51.43 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1499  hypothetical protein  56.44 
 
 
104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1363  hypothetical protein  56.44 
 
 
104 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0837  hypothetical protein  50.96 
 
 
106 aa  121  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.475243  normal  0.0169282 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1015  protein of unknown function DUF74  51.92 
 
 
104 aa  121  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.512702  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1285  hypothetical protein  55.34 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.424427  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2241  hypothetical protein  49.52 
 
 
105 aa  118  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2460  protein of unknown function DUF74  49 
 
 
108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000201008  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2180  hypothetical protein  52.94 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.907346  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1853  hypothetical protein  53.54 
 
 
158 aa  114  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2142  hypothetical protein  53.54 
 
 
158 aa  114  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0452  protein of unknown function DUF74  48.57 
 
 
107 aa  115  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0898419  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1519  protein of unknown function DUF74  50.5 
 
 
106 aa  114  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1584  protein of unknown function DUF74  47.12 
 
 
104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0876  hypothetical protein  51.49 
 
 
106 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1071  protein of unknown function DUF74  50 
 
 
111 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523097  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1624  hypothetical protein  46.67 
 
 
105 aa  104  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000293634  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0176  hypothetical protein  49.5 
 
 
106 aa  104  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.484532  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1828  hypothetical protein  47.12 
 
 
112 aa  103  9e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1099  hypothetical protein  51.46 
 
 
108 aa  98.6  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.261096  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0999  protein of unknown function DUF74  45.45 
 
 
100 aa  94.4  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2109  hypothetical protein  45.71 
 
 
108 aa  91.3  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.184022 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3926  hypothetical protein  45.54 
 
 
103 aa  90.1  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0734  protein of unknown function DUF74  41.9 
 
 
111 aa  88.6  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.639133  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1368  protein of unknown function DUF74  44.55 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.629963  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2426  protein of unknown function DUF74  39.6 
 
 
119 aa  84  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0498449  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1021  hypothetical protein  40.59 
 
 
120 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0559796  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3098  protein of unknown function DUF74  44.34 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0254551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0236  protein of unknown function DUF74  40.59 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0782023 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2196  protein of unknown function DUF74  41.35 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5583  hypothetical protein  41.75 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0990  hypothetical protein  40.59 
 
 
114 aa  76.6  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.880339  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0255  hypothetical protein  36.63 
 
 
105 aa  74.3  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3455  hypothetical protein  38.83 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177402  hitchhiker  4.0879300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0997  hypothetical protein  42.99 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.797199  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3023  hypothetical protein  38.61 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.476002  normal  0.201979 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1891  hypothetical protein  38.83 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00410284  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1047  hypothetical protein  42.99 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0930  hypothetical protein  42.99 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0965  hypothetical protein  42.99 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1028  hypothetical protein  42.99 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1095  hypothetical protein  38.83 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.172512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0912  hypothetical protein  38.83 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00871  hypothetical protein  41.12 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.265606  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2776  protein of unknown function DUF74  41.12 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111478  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5284  hypothetical protein  37.86 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0936  hypothetical protein  37.86 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0921  hypothetical protein  37.86 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0904  hypothetical protein  37.86 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0039  hypothetical protein  37.86 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00877  hypothetical protein  41.12 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.255052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1001  hypothetical protein  37.86 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1077  hypothetical protein  37.86 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14878e-50 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5297  hypothetical protein  37.86 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5342  hypothetical protein  37.86 
 
 
103 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1027  hypothetical protein  41.12 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1168  hypothetical protein  37.86 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1042  hypothetical protein  37.86 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0970  hypothetical protein  41.12 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0939  hypothetical protein  41.12 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.114029  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3680  hypothetical protein  37.25 
 
 
111 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.440681 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4973  hypothetical protein  37.86 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2465  hypothetical protein  41.12 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.486355  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2730  hypothetical protein  41.12 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.731008  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3206  hypothetical protein  37.86 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000713419  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4859  hypothetical protein  37.86 
 
 
103 aa  72  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4874  hypothetical protein  37.86 
 
 
103 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0253  hypothetical protein  36.73 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5267  hypothetical protein  37.86 
 
 
103 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3460  hypothetical protein  37.86 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00419456  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1382  hypothetical protein  41.12 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35022  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4261  hypothetical protein  38.83 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000396141 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0895  hypothetical protein  41.12 
 
 
107 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.879578  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0300  protein of unknown function DUF74  36.08 
 
 
114 aa  72.8  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1016  hypothetical protein  36.89 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000549943  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0491  hypothetical protein  34.29 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.358346 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3365  hypothetical protein  35.24 
 
 
107 aa  72  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.148823  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1321  hypothetical protein  34.86 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.643002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0709  protein of unknown function DUF74  40 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104904 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3901  protein of unknown function DUF74  34.69 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0788  hypothetical protein  36.89 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0637  hypothetical protein  39.05 
 
 
105 aa  70.1  0.000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.110235  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0052  hypothetical protein  37.86 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1287  protein of unknown function DUF74  36.54 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1006  hypothetical protein  36.19 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000354976  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1658  hypothetical protein  42.99 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.737691  normal  0.699985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3728  hypothetical protein  39.62 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.015177  hitchhiker  0.00988934 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2231  protein of unknown function DUF74  36.11 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286972  normal  0.264106 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3795  hypothetical protein  40.19 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.338239  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2650  protein of unknown function DUF74  36.89 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2464  hypothetical protein  41.18 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>