80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0709 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0709  protein of unknown function DUF74  100 
 
 
122 aa  249  8.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104904 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2109  hypothetical protein  57.41 
 
 
108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.184022 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1368  protein of unknown function DUF74  60.4 
 
 
107 aa  122  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.629963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0236  protein of unknown function DUF74  60.42 
 
 
141 aa  119  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0782023 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0734  protein of unknown function DUF74  47.66 
 
 
111 aa  109  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.639133  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1519  protein of unknown function DUF74  49.52 
 
 
106 aa  96.7  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1006  hypothetical protein  45 
 
 
108 aa  96.3  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000354976  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3098  protein of unknown function DUF74  52.83 
 
 
109 aa  94.4  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0254551  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1021  hypothetical protein  39.29 
 
 
120 aa  85.9  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0559796  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0300  protein of unknown function DUF74  42.45 
 
 
114 aa  83.6  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0637  hypothetical protein  39.39 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.110235  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2656  domain of unknown function, putative  39.25 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1822  domain of unknown function, putative  38.32 
 
 
111 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1433  hypothetical protein  38.32 
 
 
111 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1644  hypothetical protein  38.32 
 
 
111 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0904  hypothetical protein  38.32 
 
 
111 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.645309  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0715  hypothetical protein  38.32 
 
 
111 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1667  hypothetical protein  38.32 
 
 
111 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0446  hypothetical protein  38.32 
 
 
111 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1853  hypothetical protein  38.68 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2426  protein of unknown function DUF74  38.78 
 
 
119 aa  79  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0498449  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2180  hypothetical protein  39.09 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.907346  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1129  hypothetical protein  32.71 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2411  protein of unknown function DUF74  38.68 
 
 
117 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0491  hypothetical protein  35.85 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.358346 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2788  hypothetical protein  38.68 
 
 
117 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2142  hypothetical protein  37.84 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1285  hypothetical protein  40.38 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.424427  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0176  hypothetical protein  40 
 
 
106 aa  77.4  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.484532  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0148  hypothetical protein  38.6 
 
 
188 aa  77  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0163  hypothetical protein  37 
 
 
106 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000405251  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0165  hypothetical protein  37 
 
 
106 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515735  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1828  hypothetical protein  41.41 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1099  hypothetical protein  38.46 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.261096  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0452  protein of unknown function DUF74  38 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0898419  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3577  hypothetical protein  37.74 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.631965 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2241  hypothetical protein  35.64 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2458  hypothetical protein  41.84 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183821  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3365  hypothetical protein  39.42 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.148823  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1584  protein of unknown function DUF74  41.24 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1617  hypothetical protein  37.62 
 
 
104 aa  74.3  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.885217  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0426  hypothetical protein  38 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0155  hypothetical protein  37.61 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012152 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1015  protein of unknown function DUF74  40.4 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.512702  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0239  hypothetical protein  34.62 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1499  hypothetical protein  35.29 
 
 
104 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0595  hypothetical protein  35.59 
 
 
119 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3195  protein of unknown function DUF74  40.91 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0223859  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3300  hypothetical protein  38.68 
 
 
140 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398932  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5217  hypothetical protein  36.28 
 
 
120 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1363  hypothetical protein  38.3 
 
 
104 aa  72  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5068  hypothetical protein  38.68 
 
 
140 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0381  hypothetical protein  40 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.251834  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0876  hypothetical protein  39.22 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2095  hypothetical protein  37.5 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1624  hypothetical protein  37.86 
 
 
105 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000293634  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5002  hypothetical protein  36.7 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618954  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003712  hypothetical protein  36 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0194537  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02090  hypothetical protein  38.78 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4477  hypothetical protein  36.7 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1071  protein of unknown function DUF74  36.63 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523097  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3901  protein of unknown function DUF74  36.54 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3680  hypothetical protein  38.24 
 
 
111 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.440681 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0253  hypothetical protein  34.95 
 
 
105 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3023  hypothetical protein  28.71 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.476002  normal  0.201979 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0990  hypothetical protein  33.64 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.880339  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3926  hypothetical protein  37.62 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0837  hypothetical protein  37.62 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.475243  normal  0.0169282 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0255  hypothetical protein  34.95 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1010  protein of unknown function DUF74  35.79 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.00000000062015 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1281  hypothetical protein  33.96 
 
 
123 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2460  protein of unknown function DUF74  34.69 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000201008  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1752  hypothetical protein  34.26 
 
 
114 aa  61.2  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.421305  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0888  hypothetical protein  36.26 
 
 
97 aa  60.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0999  protein of unknown function DUF74  32.94 
 
 
100 aa  50.4  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1507  hypothetical protein  30.43 
 
 
178 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1899  protein of unknown function DUF74  30 
 
 
107 aa  44.3  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000666194 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0296  protein of unknown function DUF74  35.63 
 
 
290 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.157183  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14850  hypothetical protein  23.15 
 
 
108 aa  40.4  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.271966  normal  0.284352 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3636  hypothetical protein  25.61 
 
 
105 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.517218  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>