168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2095 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2095  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  210  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0381  hypothetical protein  88.35 
 
 		 105 aa  184  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.251834  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2458  hypothetical protein  86.41 
 
 		 105 aa  182  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183821  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003712  hypothetical protein  81.55 
 
 		 105 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0194537  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02090  hypothetical protein  80.58 
 
 		 104 aa  170  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0165  hypothetical protein  57.28 
 
 		 106 aa  134  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0163  hypothetical protein  57.28 
 
 		 106 aa  134  5e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000405251  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1129  hypothetical protein  56.19 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1617  hypothetical protein  57.43 
 
 		 104 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.885217  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1499  hypothetical protein  56.44 
 
 		 104 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1363  hypothetical protein  56.44 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1285  hypothetical protein  55.14 
 
 		 107 aa  124  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.424427  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0426  hypothetical protein  49.51 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0837  hypothetical protein  50.49 
 
 		 106 aa  117  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.475243  normal  0.0169282 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1015  protein of unknown function DUF74  47.57 
 
 		 104 aa  117  7e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.512702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2460  protein of unknown function DUF74  49.48 
 
 		 108 aa  116  9e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000201008  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2241  hypothetical protein  49.51 
 
 		 105 aa  114  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1519  protein of unknown function DUF74  46.23 
 
 		 106 aa  113  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1853  hypothetical protein  50 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2142  hypothetical protein  50.51 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2180  hypothetical protein  50 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.907346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0452  protein of unknown function DUF74  45.63 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0898419  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0876  hypothetical protein  49.5 
 
 		 106 aa  107  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1584  protein of unknown function DUF74  44.66 
 
 		 104 aa  107  8.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0176  hypothetical protein  50.5 
 
 		 106 aa  106  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.484532  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1071  protein of unknown function DUF74  46.6 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1099  hypothetical protein  52.43 
 
 		 108 aa  102  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.261096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1828  hypothetical protein  44.66 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1624  hypothetical protein  43.69 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000293634  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3926  hypothetical protein  44.55 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2109  hypothetical protein  48.54 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184022 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0999  protein of unknown function DUF74  44.32 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1021  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0559796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1368  protein of unknown function DUF74  45.54 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.629963  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0734  protein of unknown function DUF74  38.1 
 
 		 111 aa  84.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.639133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2426  protein of unknown function DUF74  37.5 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0498449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0236  protein of unknown function DUF74  41.75 
 
 		 141 aa  80.1  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0782023 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3023  hypothetical protein  42.57 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.476002  normal  0.201979 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5583  hypothetical protein  42.72 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3901  protein of unknown function DUF74  38.46 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0990  hypothetical protein  36.45 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.880339  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3365  hypothetical protein  38.1 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.148823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3455  hypothetical protein  39.81 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177402  hitchhiker  4.0879300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1016  hypothetical protein  39.81 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000549943  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3098  protein of unknown function DUF74  41.75 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0254551  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1095  hypothetical protein  39.81 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.172512  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1891  hypothetical protein  39.81 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00410284  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0300  protein of unknown function DUF74  35.92 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0912  hypothetical protein  39.81 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0936  hypothetical protein  38.83 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0921  hypothetical protein  38.83 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0904  hypothetical protein  38.83 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0039  hypothetical protein  38.83 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1042  hypothetical protein  38.83 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1001  hypothetical protein  38.83 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1168  hypothetical protein  38.83 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1077  hypothetical protein  38.83 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14878e-50 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0491  hypothetical protein  37.14 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.358346 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4261  hypothetical protein  39.81 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000396141 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1006  hypothetical protein  38.83 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000354976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5284  hypothetical protein  38.83 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3206  hypothetical protein  38.83 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000713419  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5297  hypothetical protein  38.83 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3460  hypothetical protein  38.83 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00419456  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4973  hypothetical protein  38.83 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5342  hypothetical protein  38.83 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0255  hypothetical protein  37.62 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4859  hypothetical protein  38.83 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4874  hypothetical protein  38.83 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5267  hypothetical protein  38.83 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2464  hypothetical protein  43.14 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2196  protein of unknown function DUF74  37.86 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0788  hypothetical protein  37.86 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0052  hypothetical protein  38.83 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0253  hypothetical protein  37.76 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1281  hypothetical protein  39.36 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3680  hypothetical protein  38.38 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.440681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0709  protein of unknown function DUF74  37.5 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104904 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3300  hypothetical protein  37 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398932  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5068  hypothetical protein  37 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3855  protein of unknown function DUF74  40 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.7494e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00871  hypothetical protein  40.38 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.265606  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2776  protein of unknown function DUF74  40.38 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111478  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0997  hypothetical protein  41.35 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.797199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1027  hypothetical protein  40.38 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1321  hypothetical protein  34.55 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.643002  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00877  hypothetical protein  40.38 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.255052  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1382  hypothetical protein  40.38 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2465  hypothetical protein  40.38 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.486355  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0970  hypothetical protein  40.38 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0939  hypothetical protein  40.38 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.114029  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2730  hypothetical protein  40.38 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.731008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0930  hypothetical protein  41.35 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0595  hypothetical protein  35.92 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1047  hypothetical protein  41.35 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0965  hypothetical protein  41.35 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1028  hypothetical protein  41.35 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5217  hypothetical protein  37 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0034  protein of unknown function DUF74  35.92 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.347076  normal  0.179218 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1287  protein of unknown function DUF74  38.83 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.313359 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>