159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1321 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1321  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  220  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.643002  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0165  hypothetical protein  34.86 
 
 
106 aa  73.6  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0163  hypothetical protein  34.86 
 
 
106 aa  73.6  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000405251  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003712  hypothetical protein  38.32 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0194537  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0426  hypothetical protein  33.94 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0381  hypothetical protein  34.86 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.251834  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0491  hypothetical protein  35.78 
 
 
123 aa  70.1  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.358346 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2095  hypothetical protein  34.55 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1499  hypothetical protein  35.24 
 
 
104 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1363  hypothetical protein  36.19 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1617  hypothetical protein  37.14 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.885217  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2458  hypothetical protein  33.03 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183821  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1015  protein of unknown function DUF74  35.19 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.512702  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2788  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2411  protein of unknown function DUF74  33.33 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1584  protein of unknown function DUF74  37.17 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02090  hypothetical protein  36.45 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3901  protein of unknown function DUF74  35.19 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1010  protein of unknown function DUF74  36.84 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.00000000062015 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0888  hypothetical protein  36.84 
 
 
97 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0452  protein of unknown function DUF74  33.64 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0898419  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5217  hypothetical protein  38.32 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5002  hypothetical protein  37.96 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618954  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0595  hypothetical protein  37.96 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3300  hypothetical protein  37.38 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398932  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5068  hypothetical protein  37.38 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1828  hypothetical protein  34.69 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1129  hypothetical protein  35.51 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4477  hypothetical protein  36.45 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2180  hypothetical protein  35 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.907346  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2241  hypothetical protein  33.03 
 
 
105 aa  63.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1624  hypothetical protein  33.03 
 
 
105 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000293634  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3365  hypothetical protein  38.18 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.148823  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2231  protein of unknown function DUF74  36.79 
 
 
111 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286972  normal  0.264106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2650  protein of unknown function DUF74  37.14 
 
 
106 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3577  hypothetical protein  35.24 
 
 
122 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.631965 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0176  hypothetical protein  33.33 
 
 
106 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.484532  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3654  hypothetical protein  37.96 
 
 
111 aa  60.8  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.361374  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3023  hypothetical protein  35.24 
 
 
106 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.476002  normal  0.201979 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1752  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  60.5  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.421305  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0997  hypothetical protein  36.7 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.797199  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00871  hypothetical protein  35.78 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.265606  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2776  protein of unknown function DUF74  35.78 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111478  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0965  hypothetical protein  36.7 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1027  hypothetical protein  35.78 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1028  hypothetical protein  36.7 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00877  hypothetical protein  35.78 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.255052  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2426  protein of unknown function DUF74  33.63 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0498449  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0930  hypothetical protein  36.7 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1853  hypothetical protein  33 
 
 
158 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2142  hypothetical protein  33 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2465  hypothetical protein  35.78 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.486355  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0837  hypothetical protein  32.41 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.475243  normal  0.0169282 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1006  hypothetical protein  33.94 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000354976  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1047  hypothetical protein  36.7 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1382  hypothetical protein  36.7 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35022  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0970  hypothetical protein  35.78 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0939  hypothetical protein  35.78 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.114029  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2730  hypothetical protein  35.78 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.731008  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3795  hypothetical protein  29.91 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.338239  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0788  hypothetical protein  35.14 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1519  protein of unknown function DUF74  31.19 
 
 
106 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2109  hypothetical protein  31.25 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.184022 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1969  hypothetical protein  33.94 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674161  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0895  hypothetical protein  35.78 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.879578  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0876  hypothetical protein  31.43 
 
 
106 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0734  protein of unknown function DUF74  30.28 
 
 
111 aa  57  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.639133  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3680  hypothetical protein  35.45 
 
 
111 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.440681 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0999  protein of unknown function DUF74  31.11 
 
 
100 aa  56.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2375  protein of unknown function DUF74  35.78 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.791935  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0990  hypothetical protein  32.11 
 
 
114 aa  56.2  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.880339  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1368  protein of unknown function DUF74  29.91 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.629963  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0420  hypothetical protein  29.63 
 
 
108 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.932362  normal  0.0258218 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2460  protein of unknown function DUF74  37.36 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000201008  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1021  hypothetical protein  30.97 
 
 
120 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0559796  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1658  hypothetical protein  35.78 
 
 
107 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.737691  normal  0.699985 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0034  protein of unknown function DUF74  33.03 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.347076  normal  0.179218 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1703  hypothetical protein  33.03 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.073089  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1926  protein of unknown function DUF74  34.58 
 
 
108 aa  54.7  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00341675  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1095  hypothetical protein  34.23 
 
 
103 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.172512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4261  hypothetical protein  34.23 
 
 
103 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000396141 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0912  hypothetical protein  34.23 
 
 
103 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0936  hypothetical protein  34.23 
 
 
103 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0921  hypothetical protein  34.23 
 
 
103 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3206  hypothetical protein  34.23 
 
 
103 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000713419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0904  hypothetical protein  34.23 
 
 
103 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0904  hypothetical protein  35.45 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.645309  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0039  hypothetical protein  34.23 
 
 
103 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1822  domain of unknown function, putative  35.45 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1001  hypothetical protein  34.23 
 
 
103 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3460  hypothetical protein  34.23 
 
 
103 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00419456  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1077  hypothetical protein  34.23 
 
 
103 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14878e-50 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1433  hypothetical protein  35.45 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0446  hypothetical protein  35.45 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1644  hypothetical protein  35.45 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1667  hypothetical protein  35.45 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0715  hypothetical protein  35.45 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1042  hypothetical protein  34.23 
 
 
103 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1168  hypothetical protein  34.23 
 
 
103 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2656  domain of unknown function, putative  34.55 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>