162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1926 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1926  protein of unknown function DUF74  100 
 
 
108 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00341675  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2231  protein of unknown function DUF74  70.48 
 
 
111 aa  151  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286972  normal  0.264106 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1658  hypothetical protein  69.44 
 
 
107 aa  152  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.737691  normal  0.699985 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2375  protein of unknown function DUF74  70.09 
 
 
108 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.791935  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0930  hypothetical protein  71.43 
 
 
107 aa  150  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0965  hypothetical protein  71.43 
 
 
107 aa  150  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1028  hypothetical protein  71.43 
 
 
107 aa  150  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1047  hypothetical protein  71.43 
 
 
107 aa  150  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0895  hypothetical protein  71.43 
 
 
107 aa  150  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.879578  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00871  hypothetical protein  71.43 
 
 
107 aa  149  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.265606  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2776  protein of unknown function DUF74  71.43 
 
 
107 aa  149  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111478  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1027  hypothetical protein  71.43 
 
 
107 aa  149  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00877  hypothetical protein  71.43 
 
 
107 aa  149  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.255052  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0970  hypothetical protein  71.43 
 
 
107 aa  149  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0939  hypothetical protein  71.43 
 
 
107 aa  149  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.114029  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2465  hypothetical protein  71.43 
 
 
107 aa  149  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.486355  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2730  hypothetical protein  71.43 
 
 
107 aa  149  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.731008  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1703  hypothetical protein  68.22 
 
 
107 aa  149  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.073089  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1969  hypothetical protein  68.22 
 
 
107 aa  148  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674161  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1382  hypothetical protein  70.48 
 
 
107 aa  148  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35022  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3728  hypothetical protein  66.36 
 
 
106 aa  148  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.015177  hitchhiker  0.00988934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0997  hypothetical protein  70.48 
 
 
107 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.797199  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2361  hypothetical protein  68.52 
 
 
103 aa  146  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.875715  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0439  hypothetical protein  69.44 
 
 
103 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.130742  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2194  hypothetical protein  63.89 
 
 
108 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2093  hypothetical protein  69.44 
 
 
103 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297611  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3965  hypothetical protein  64.49 
 
 
103 aa  144  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0613428  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02548  hypothetical protein  64.76 
 
 
108 aa  143  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2275  protein of unknown function DUF74  66.67 
 
 
109 aa  143  8.000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3855  protein of unknown function DUF74  64.49 
 
 
106 aa  142  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.7494e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0288  hypothetical protein  63.55 
 
 
106 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.118688  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0734  hypothetical protein  61.68 
 
 
106 aa  136  7.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.827812  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0034  protein of unknown function DUF74  57.01 
 
 
107 aa  132  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.347076  normal  0.179218 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1243  hypothetical protein  59.81 
 
 
104 aa  131  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2650  protein of unknown function DUF74  59.43 
 
 
106 aa  130  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2464  hypothetical protein  62.04 
 
 
104 aa  130  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0819  hypothetical protein  61.76 
 
 
112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.186166  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1287  protein of unknown function DUF74  61.68 
 
 
104 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1628  UPF0145 protein  57.94 
 
 
104 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.546028  hitchhiker  0.00080679 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3855  protein of unknown function DUF74  56.07 
 
 
105 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2155  hypothetical protein  60.75 
 
 
103 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0788  hypothetical protein  57.94 
 
 
103 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0329  protein of unknown function DUF74  56.07 
 
 
106 aa  126  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.905778 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1095  hypothetical protein  57.01 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.172512  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0936  hypothetical protein  56.07 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0921  hypothetical protein  56.07 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3206  hypothetical protein  57.01 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000713419  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4859  hypothetical protein  57.94 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0904  hypothetical protein  56.07 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4874  hypothetical protein  57.94 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0039  hypothetical protein  56.07 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5267  hypothetical protein  57.94 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1001  hypothetical protein  56.07 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1891  hypothetical protein  57.01 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00410284  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0338  hypothetical protein  58.88 
 
 
105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0345405  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1168  hypothetical protein  56.07 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3460  hypothetical protein  57.01 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00419456  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1077  hypothetical protein  56.07 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14878e-50 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4261  hypothetical protein  57.01 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000396141 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5583  hypothetical protein  57.01 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0912  hypothetical protein  57.01 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1042  hypothetical protein  56.07 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5342  hypothetical protein  57.94 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1016  hypothetical protein  56.07 
 
 
103 aa  124  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000549943  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4973  hypothetical protein  57.01 
 
 
103 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5284  hypothetical protein  57.01 
 
 
103 aa  124  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5297  hypothetical protein  57.01 
 
 
103 aa  124  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3455  hypothetical protein  56.07 
 
 
103 aa  122  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177402  hitchhiker  4.0879300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2791  hypothetical protein  61.68 
 
 
106 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0052  hypothetical protein  55.14 
 
 
103 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0545  protein of unknown function DUF74  57.01 
 
 
106 aa  121  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14850  hypothetical protein  57.94 
 
 
108 aa  120  6e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.271966  normal  0.284352 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1899  protein of unknown function DUF74  56.07 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000666194 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0398  hypothetical protein  55.14 
 
 
106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000107451  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1357  hypothetical protein  52.78 
 
 
110 aa  114  5e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0206753  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2196  protein of unknown function DUF74  54.29 
 
 
105 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3636  hypothetical protein  54.21 
 
 
105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.517218  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3654  hypothetical protein  49.09 
 
 
111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.361374  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3795  hypothetical protein  49.07 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.338239  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0420  hypothetical protein  45.79 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.932362  normal  0.0258218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1745  hypothetical protein  50.48 
 
 
106 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.305232  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5029  hypothetical protein  54.93 
 
 
85 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2988  hypothetical protein  39.45 
 
 
113 aa  84.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2816  hypothetical protein  46.67 
 
 
106 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2909  hypothetical protein  47.62 
 
 
106 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2377  hypothetical protein  47.62 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.191309  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3790  hypothetical protein  35.58 
 
 
114 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2873  hypothetical protein  46.67 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0990  hypothetical protein  42.31 
 
 
114 aa  72.4  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.880339  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02090  hypothetical protein  40.23 
 
 
104 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003712  hypothetical protein  37.96 
 
 
105 aa  67  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0194537  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0381  hypothetical protein  40 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.251834  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5659  hypothetical protein  56.25 
 
 
53 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2458  hypothetical protein  38.1 
 
 
105 aa  62.8  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3926  hypothetical protein  36.14 
 
 
103 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2411  protein of unknown function DUF74  33.98 
 
 
117 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2788  hypothetical protein  33.98 
 
 
117 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2095  hypothetical protein  40 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1584  protein of unknown function DUF74  38.24 
 
 
104 aa  61.6  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1519  protein of unknown function DUF74  39.02 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>