88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0148 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0148  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  377  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0155  hypothetical protein  92.05 
 
 
154 aa  274  5e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012152 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1368  protein of unknown function DUF74  44.86 
 
 
107 aa  93.6  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.629963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0236  protein of unknown function DUF74  40.95 
 
 
141 aa  85.9  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0782023 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2109  hypothetical protein  44.55 
 
 
108 aa  83.6  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.184022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0709  protein of unknown function DUF74  38.6 
 
 
122 aa  77  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0734  protein of unknown function DUF74  40.37 
 
 
111 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.639133  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3195  protein of unknown function DUF74  37.19 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0223859  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1519  protein of unknown function DUF74  43.12 
 
 
106 aa  70.1  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1021  hypothetical protein  38.68 
 
 
120 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0559796  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0452  protein of unknown function DUF74  41.9 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0898419  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0176  hypothetical protein  41.35 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.484532  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0426  hypothetical protein  39.22 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3023  hypothetical protein  33.64 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.476002  normal  0.201979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3098  protein of unknown function DUF74  38.24 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0254551  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2411  protein of unknown function DUF74  40.54 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2788  hypothetical protein  40.54 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0876  hypothetical protein  38.83 
 
 
106 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1285  hypothetical protein  37.27 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.424427  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1129  hypothetical protein  31.82 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0163  hypothetical protein  38.1 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000405251  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1006  hypothetical protein  36.19 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000354976  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0165  hypothetical protein  38.1 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515735  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1099  hypothetical protein  39.05 
 
 
108 aa  62.4  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.261096  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0491  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  61.6  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.358346 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0637  hypothetical protein  38.1 
 
 
105 aa  61.2  0.000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.110235  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2460  protein of unknown function DUF74  34.31 
 
 
108 aa  60.8  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000201008  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0300  protein of unknown function DUF74  36.89 
 
 
114 aa  60.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0990  hypothetical protein  34.51 
 
 
114 aa  60.8  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.880339  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2142  hypothetical protein  30.07 
 
 
158 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3901  protein of unknown function DUF74  34.29 
 
 
126 aa  58.9  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2656  domain of unknown function, putative  33.66 
 
 
111 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2180  hypothetical protein  30.13 
 
 
144 aa  58.9  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.907346  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1853  hypothetical protein  31.71 
 
 
158 aa  58.9  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1584  protein of unknown function DUF74  35.29 
 
 
104 aa  58.9  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0446  hypothetical protein  32.67 
 
 
111 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1433  hypothetical protein  32.67 
 
 
111 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1644  hypothetical protein  32.67 
 
 
111 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1667  hypothetical protein  32.67 
 
 
111 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0715  hypothetical protein  32.67 
 
 
111 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0904  hypothetical protein  32.67 
 
 
111 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.645309  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3577  hypothetical protein  33.62 
 
 
122 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.631965 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1822  domain of unknown function, putative  32.67 
 
 
111 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1010  protein of unknown function DUF74  40.82 
 
 
152 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.00000000062015 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0888  hypothetical protein  40.62 
 
 
97 aa  56.6  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3680  hypothetical protein  37.62 
 
 
111 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.440681 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2426  protein of unknown function DUF74  30.48 
 
 
119 aa  56.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0498449  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02090  hypothetical protein  34.65 
 
 
104 aa  55.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2241  hypothetical protein  34.29 
 
 
105 aa  55.1  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1015  protein of unknown function DUF74  38.14 
 
 
104 aa  53.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.512702  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0595  hypothetical protein  30.77 
 
 
119 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0253  hypothetical protein  30.56 
 
 
105 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0381  hypothetical protein  34.65 
 
 
105 aa  52.8  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.251834  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0255  hypothetical protein  30.56 
 
 
105 aa  52.4  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0239  hypothetical protein  30.28 
 
 
126 aa  52  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3365  hypothetical protein  33.64 
 
 
107 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.148823  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5068  hypothetical protein  30.28 
 
 
140 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3300  hypothetical protein  30.28 
 
 
140 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398932  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1281  hypothetical protein  31.82 
 
 
123 aa  51.2  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2458  hypothetical protein  33.66 
 
 
105 aa  51.2  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183821  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1243  hypothetical protein  30.84 
 
 
104 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4477  hypothetical protein  32.35 
 
 
122 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1624  hypothetical protein  31.07 
 
 
105 aa  50.8  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000293634  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0837  hypothetical protein  32.04 
 
 
106 aa  50.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.475243  normal  0.0169282 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1071  protein of unknown function DUF74  33.33 
 
 
111 aa  50.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523097  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003712  hypothetical protein  29.52 
 
 
105 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0194537  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3795  hypothetical protein  30.91 
 
 
108 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.338239  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5217  hypothetical protein  29.36 
 
 
120 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1828  hypothetical protein  32.32 
 
 
112 aa  48.9  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2095  hypothetical protein  30.48 
 
 
107 aa  49.3  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1617  hypothetical protein  28.85 
 
 
104 aa  48.5  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.885217  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1499  hypothetical protein  29.81 
 
 
104 aa  48.5  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1752  hypothetical protein  36.7 
 
 
114 aa  47.8  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.421305  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0338  hypothetical protein  33.02 
 
 
105 aa  47.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0345405  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0999  protein of unknown function DUF74  33 
 
 
100 aa  47  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5002  hypothetical protein  30.19 
 
 
122 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618954  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1287  protein of unknown function DUF74  29.91 
 
 
104 aa  45.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1363  hypothetical protein  28.85 
 
 
104 aa  45.8  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3926  hypothetical protein  29.91 
 
 
103 aa  44.7  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3855  protein of unknown function DUF74  33.33 
 
 
105 aa  43.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02548  hypothetical protein  31.25 
 
 
108 aa  43.5  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2196  protein of unknown function DUF74  30.48 
 
 
105 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2155  hypothetical protein  29.52 
 
 
103 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0439  hypothetical protein  31.78 
 
 
103 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.130742  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1357  hypothetical protein  32.11 
 
 
110 aa  42.4  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0206753  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2093  hypothetical protein  31.78 
 
 
103 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297611  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1658  hypothetical protein  33.02 
 
 
107 aa  41.6  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.737691  normal  0.699985 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1628  UPF0145 protein  28.04 
 
 
104 aa  41.2  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.546028  hitchhiker  0.00080679 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>