158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0888 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0888  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  192  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1010  protein of unknown function DUF74  98.97 
 
 
152 aa  192  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.00000000062015 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2411  protein of unknown function DUF74  97.92 
 
 
117 aa  188  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2788  hypothetical protein  97.92 
 
 
117 aa  188  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1752  hypothetical protein  70.1 
 
 
114 aa  140  8e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.421305  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3901  protein of unknown function DUF74  44.33 
 
 
126 aa  87.4  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1021  hypothetical protein  47.37 
 
 
120 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0559796  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2426  protein of unknown function DUF74  44.21 
 
 
119 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0498449  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3023  hypothetical protein  45.65 
 
 
106 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.476002  normal  0.201979 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0491  hypothetical protein  42.11 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.358346 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3365  hypothetical protein  46.15 
 
 
107 aa  77.8  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.148823  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0734  protein of unknown function DUF74  42.27 
 
 
111 aa  77  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.639133  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0255  hypothetical protein  40.22 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2109  hypothetical protein  39.36 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.184022 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0253  hypothetical protein  41.11 
 
 
105 aa  73.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1519  protein of unknown function DUF74  43.16 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1099  hypothetical protein  43.33 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.261096  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1368  protein of unknown function DUF74  41.76 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.629963  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0595  hypothetical protein  39.36 
 
 
119 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2656  domain of unknown function, putative  40 
 
 
111 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0236  protein of unknown function DUF74  36.96 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0782023 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0990  hypothetical protein  42.11 
 
 
114 aa  70.5  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.880339  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1281  hypothetical protein  42.55 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4477  hypothetical protein  41.3 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1006  hypothetical protein  38.14 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000354976  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0904  hypothetical protein  38.89 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.645309  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1822  domain of unknown function, putative  38.89 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3300  hypothetical protein  38.71 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0398932  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5068  hypothetical protein  38.71 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1433  hypothetical protein  38.89 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0446  hypothetical protein  38.89 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1644  hypothetical protein  38.89 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1667  hypothetical protein  38.89 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0715  hypothetical protein  38.89 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3577  hypothetical protein  40.86 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.631965 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3680  hypothetical protein  43.18 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.440681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0239  hypothetical protein  40 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5217  hypothetical protein  38.71 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1321  hypothetical protein  36.84 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.643002  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0176  hypothetical protein  40 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.484532  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5002  hypothetical protein  38.04 
 
 
122 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618954  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0300  protein of unknown function DUF74  40.86 
 
 
114 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1584  protein of unknown function DUF74  39.56 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0637  hypothetical protein  40 
 
 
105 aa  65.1  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.110235  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0288  hypothetical protein  38.95 
 
 
106 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.118688  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1499  hypothetical protein  32.63 
 
 
104 aa  63.5  0.0000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1617  hypothetical protein  32.63 
 
 
104 aa  63.5  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.885217  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0837  hypothetical protein  36.67 
 
 
106 aa  62.8  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.475243  normal  0.0169282 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0999  protein of unknown function DUF74  31.52 
 
 
100 aa  62.8  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0452  protein of unknown function DUF74  37.08 
 
 
107 aa  62  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0898419  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0876  hypothetical protein  37.63 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2241  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1363  hypothetical protein  31.58 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3728  hypothetical protein  40 
 
 
106 aa  61.6  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.015177  hitchhiker  0.00988934 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0734  hypothetical protein  40 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.827812  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0165  hypothetical protein  36.56 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0163  hypothetical protein  36.56 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000405251  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0709  protein of unknown function DUF74  36.26 
 
 
122 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104904 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3195  protein of unknown function DUF74  41.67 
 
 
150 aa  60.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0223859  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1828  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2460  protein of unknown function DUF74  32.26 
 
 
108 aa  60.1  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000201008  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1853  hypothetical protein  34.12 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2142  hypothetical protein  34.12 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1624  hypothetical protein  32.26 
 
 
105 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000293634  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1015  protein of unknown function DUF74  37.63 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.512702  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02090  hypothetical protein  35.63 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1285  hypothetical protein  39.33 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.424427  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2180  hypothetical protein  31.76 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.907346  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0426  hypothetical protein  34.78 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003712  hypothetical protein  34.48 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0194537  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0155  hypothetical protein  40.62 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012152 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2095  hypothetical protein  31.52 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0381  hypothetical protein  31.52 
 
 
105 aa  57  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.251834  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0420  hypothetical protein  35.56 
 
 
108 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.932362  normal  0.0258218 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3795  hypothetical protein  32.95 
 
 
108 aa  56.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.338239  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0148  hypothetical protein  40.62 
 
 
188 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1899  protein of unknown function DUF74  40 
 
 
107 aa  55.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000666194 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1926  protein of unknown function DUF74  35.96 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00341675  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2458  hypothetical protein  31.11 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3926  hypothetical protein  32.61 
 
 
103 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0034  protein of unknown function DUF74  30.53 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.347076  normal  0.179218 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1129  hypothetical protein  32.22 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1071  protein of unknown function DUF74  32.95 
 
 
111 aa  55.1  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523097  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3636  hypothetical protein  32.58 
 
 
105 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.517218  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2650  protein of unknown function DUF74  34.74 
 
 
106 aa  54.3  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14850  hypothetical protein  35.87 
 
 
108 aa  54.3  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.271966  normal  0.284352 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0545  protein of unknown function DUF74  39.24 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1357  hypothetical protein  36.78 
 
 
110 aa  52.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0206753  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2231  protein of unknown function DUF74  34.44 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286972  normal  0.264106 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1243  hypothetical protein  34.83 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0895  hypothetical protein  33.7 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.879578  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0398  hypothetical protein  35.56 
 
 
106 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000107451  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3098  protein of unknown function DUF74  39.36 
 
 
109 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0254551  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2776  protein of unknown function DUF74  33.7 
 
 
107 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111478  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1027  hypothetical protein  33.7 
 
 
107 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3654  hypothetical protein  36.17 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.361374  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00877  hypothetical protein  33.7 
 
 
107 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.255052  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0970  hypothetical protein  33.7 
 
 
107 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0939  hypothetical protein  33.7 
 
 
107 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.114029  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2730  hypothetical protein  33.7 
 
 
107 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.731008  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>