24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0685 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0685  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 		 1686 aa  3431    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1136  hypothetical protein  31.7 
 
 		 1005 aa  402  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0566363 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2112  endo-alpha-N-acetylgalactosaminidase  28.96 
 
 		 1458 aa  393  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1258  Subtilisin-like serine protease  29.55 
 
 		 1937 aa  355  4e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.596545  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2113  endo-alpha-N-acetylgalactosaminidase  28.2 
 
 		 1172 aa  345  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1674  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.07 
 
 		 1970 aa  330  1.0000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0687  fibronectin type III domain-containing protein  96.88 
 
 		 159 aa  301  6e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1442  putative hyaluronidase  74.73 
 
 		 1001 aa  147  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.980629  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1248  fibronectin type III domain-containing protein  73.63 
 
 		 205 aa  146  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  70.53 
 
 		 2095 aa  145  8e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0859  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  70.53 
 
 		 2095 aa  143  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1472  putative alpha-N-acetylgalactosaminidase  59.2 
 
 		 1588 aa  140  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  52.99 
 
 		 1965 aa  137  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  68.13 
 
 		 1471 aa  135  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  64.84 
 
 		 1173 aa  127  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0815  glycosy hydrolase family protein  63.86 
 
 		 1127 aa  119  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1250  hypothetical protein  27.06 
 
 		 317 aa  92  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.434596  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0285  endo-beta-N-acetylglucosaminidase  39.74 
 
 		 1135 aa  56.6  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  30.36 
 
 		 1221 aa  51.2  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01090  Ig-like domain-containing protein  34.21 
 
 		 583 aa  50.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1841  hypothetical protein  21.64 
 
 		 571 aa  48.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2448  putative secreted protein  43.1 
 
 		 1363 aa  47.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.903982 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  37.14 
 
 		 1355 aa  45.8  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  29.27 
 
 		 598 aa  45.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>