34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ02720 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006679  CNJ02720  expressed protein  100 
 
 
553 aa  1129    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54126  conserved hypothetical protein  49.4 
 
 
468 aa  81.3  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216144  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10572  Leucine Rich Repeat domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02450)  45.68 
 
 
543 aa  67.4  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.262816  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  44.78 
 
 
1041 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  36.46 
 
 
863 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  43.04 
 
 
508 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  47.46 
 
 
761 aa  53.9  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  45 
 
 
886 aa  53.5  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  46.03 
 
 
354 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03790  conserved hypothetical protein  36.36 
 
 
744 aa  53.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.52 
 
 
1107 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  43.33 
 
 
416 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  36.36 
 
 
1263 aa  50.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  44.64 
 
 
892 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  35.44 
 
 
396 aa  48.9  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  35.29 
 
 
296 aa  48.5  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  43.55 
 
 
291 aa  48.5  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  35.71 
 
 
2324 aa  47.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  44.64 
 
 
1015 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  44.64 
 
 
482 aa  47  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  33.33 
 
 
1749 aa  46.2  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2065  leucine-rich repeat protein  33.7 
 
 
108 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  30.26 
 
 
1344 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  26.23 
 
 
713 aa  46.6  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  39.68 
 
 
867 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  32.05 
 
 
675 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  37.66 
 
 
421 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  44.07 
 
 
757 aa  45.8  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  41.27 
 
 
204 aa  44.7  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  33.33 
 
 
467 aa  44.7  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  32.47 
 
 
453 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  31.46 
 
 
446 aa  43.9  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  33.77 
 
 
436 aa  43.9  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  35.06 
 
 
438 aa  43.9  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>