More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG00590 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_02998  C1 tetrahydrofolate synthase C1-THFS Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UN8]  58.64 
 
 
1031 aa  1147    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00590  folic acid and derivative metabolism-related protein, putative  100 
 
 
1021 aa  2090    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.352533  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28303  predicted protein  57.49 
 
 
662 aa  732    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00317513  decreased coverage  0.000285759 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88119  tetrahydrofolate synthase  58.89 
 
 
946 aa  1104    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.226712  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_80013  mitochondrial C1- tetrahydrofolate synthase precursor  53.45 
 
 
995 aa  1019    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.959666  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49229  fomate-tetrahydrofolate ligase  59.87 
 
 
666 aa  728    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.167975  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0129  formate--tetrahydrofolate ligase  51.11 
 
 
567 aa  599  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000126752  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2057  Formate--tetrahydrofolate ligase  51.35 
 
 
567 aa  601  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0219  formate--tetrahydrofolate ligase  50.56 
 
 
564 aa  572  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0089  formate--tetrahydrofolate ligase  47.76 
 
 
566 aa  555  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.985231  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0109  formate--tetrahydrofolate ligase  49.21 
 
 
559 aa  555  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0231  Formate--tetrahydrofolate ligase  47.61 
 
 
567 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0671  formate--tetrahydrofolate ligase  47.38 
 
 
597 aa  549  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0705  formate--tetrahydrofolate ligase  47.38 
 
 
597 aa  549  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0640  formate--tetrahydrofolate ligase  45.02 
 
 
605 aa  546  1e-154  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_609  formate--tetrahydrofolate ligase  47.06 
 
 
597 aa  548  1e-154  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0932168  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3720  formate--tetrahydrofolate ligase  48.64 
 
 
570 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000981333  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0443  formate--tetrahydrofolate ligase  47.54 
 
 
564 aa  539  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.507159  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3314  formate--tetrahydrofolate ligase  49.12 
 
 
570 aa  538  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000257814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0149  formate--tetrahydrofolate ligase  47.53 
 
 
556 aa  538  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4339  formate--tetrahydrofolate ligase  47.36 
 
 
570 aa  533  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0520  formate--tetrahydrofolate ligase  48.27 
 
 
585 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238501  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000208  formate--tetrahydrofolate ligase  46.74 
 
 
582 aa  534  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3748  formate--tetrahydrofolate ligase  48.42 
 
 
580 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0522  formate--tetrahydrofolate ligase  46.72 
 
 
564 aa  530  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.897337  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3804  formate--tetrahydrofolate ligase  47.4 
 
 
585 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.038767  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1409  formate--tetrahydrofolate ligase  47.37 
 
 
555 aa  532  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000797787  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3930  formate--tetrahydrofolate ligase  47.96 
 
 
585 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0560  formate--tetrahydrofolate ligase  47.36 
 
 
570 aa  525  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0612  formate--tetrahydrofolate ligase  46.88 
 
 
570 aa  525  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0561  formate--tetrahydrofolate ligase  47.2 
 
 
570 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1499  formate--tetrahydrofolate ligase  46.2 
 
 
570 aa  523  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.441254  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0560  formate--tetrahydrofolate ligase  46.88 
 
 
570 aa  524  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1820  Formate--tetrahydrofolate ligase  47.37 
 
 
565 aa  521  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2752  formate--tetrahydrofolate ligase  46.74 
 
 
556 aa  521  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00362383  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3469  formate--tetrahydrofolate ligase  47.2 
 
 
569 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05943  formate--tetrahydrofolate ligase  45.15 
 
 
582 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0795  formate--tetrahydrofolate ligase  45.85 
 
 
555 aa  514  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00613459  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0766  formate--tetrahydrofolate ligase  46.23 
 
 
576 aa  513  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1568  formate--tetrahydrofolate ligase  46.23 
 
 
576 aa  512  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2519  formate--tetrahydrofolate ligase  46.07 
 
 
573 aa  512  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0118  formate--tetrahydrofolate ligase  44.9 
 
 
557 aa  505  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3146  formate--tetrahydrofolate ligase  46.96 
 
 
560 aa  503  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12980  formate--tetrahydrofolate ligase  46.74 
 
 
564 aa  504  1e-141  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.700503 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0556  formate--tetrahydrofolate ligase  46.9 
 
 
582 aa  499  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.124626  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2399  formate-tetrahydrofolate ligase  45.61 
 
 
556 aa  500  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0555  formate--tetrahydrofolate ligase  45.93 
 
 
558 aa  498  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2105  Formate--tetrahydrofolate ligase  45.3 
 
 
553 aa  499  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2687  formate--tetrahydrofolate ligase  44.39 
 
 
587 aa  499  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.162948  hitchhiker  0.00130588 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3059  formate--tetrahydrofolate ligase  45.03 
 
 
587 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000769965  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1296  formate--tetrahydrofolate ligase  44.68 
 
 
591 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24910  Formate-tetrahydrofolate ligase  45.45 
 
 
557 aa  494  9.999999999999999e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00600  Formate--tetrahydrofolate ligase  46.82 
 
 
554 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00136025  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3264  formate--tetrahydrofolate ligase  45.04 
 
 
561 aa  490  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1712  formate--tetrahydrofolate ligase  45.15 
 
 
558 aa  490  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.311565 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0024  Formate--tetrahydrofolate ligase  45.74 
 
 
572 aa  491  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2298  formate--tetrahydrofolate ligase  44.44 
 
 
559 aa  491  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2125  Formate--tetrahydrofolate ligase  44.11 
 
 
553 aa  492  1e-137  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1007  formate--tetrahydrofolate ligase  43.29 
 
 
555 aa  490  1e-137  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0866489  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1580  formate--tetrahydrofolate ligase  44.25 
 
 
555 aa  487  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0203021 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2187  formate--tetrahydrofolate ligase  46.03 
 
 
562 aa  489  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0200027  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1959  formate--tetrahydrofolate ligase  46.19 
 
 
562 aa  488  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1938  formate--tetrahydrofolate ligase  46.19 
 
 
562 aa  489  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1914  formate--tetrahydrofolate ligase  46.19 
 
 
562 aa  489  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.251904  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1383  formate--tetrahydrofolate ligase  46.08 
 
 
565 aa  486  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2107  formate--tetrahydrofolate ligase  46.19 
 
 
562 aa  488  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2201  formate--tetrahydrofolate ligase  46.19 
 
 
562 aa  489  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045703  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2141  formate--tetrahydrofolate ligase  46.19 
 
 
562 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1952  formate--tetrahydrofolate ligase  45.87 
 
 
583 aa  487  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0316175  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3272  formate--tetrahydrofolate ligase  44.59 
 
 
555 aa  488  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0484  Formate--tetrahydrofolate ligase  44.83 
 
 
557 aa  486  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2785  formate--tetrahydrofolate ligase  44.02 
 
 
556 aa  487  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2471  formate--tetrahydrofolate ligase  44.18 
 
 
556 aa  489  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1412  formate-tetrahydrofolate ligase  46.89 
 
 
556 aa  488  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.749382  hitchhiker  0.00000422387 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3197  formate--tetrahydrofolate ligase  45.87 
 
 
562 aa  488  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.780376  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2117  formate--tetrahydrofolate ligase  45.87 
 
 
583 aa  487  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.546563  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1317  formate--tetrahydrofolate ligase  44.25 
 
 
555 aa  487  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1009  formate-tetrahydrofolate ligase  44.41 
 
 
560 aa  485  1e-135  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.749229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4459  formate-tetrahydrofolate ligase FTHFS  44.92 
 
 
558 aa  484  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0477556  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4072  formate--tetrahydrofolate ligase  45.31 
 
 
557 aa  483  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0816  Formate--tetrahydrofolate ligase  44.73 
 
 
554 aa  483  1e-135  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0136585  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20990  Formate-tetrahydrofolate ligase  44.34 
 
 
556 aa  484  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0447  Formate--tetrahydrofolate ligase  44.52 
 
 
557 aa  481  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.391987 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2815  formate--tetrahydrofolate ligase  44.52 
 
 
559 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.90071  normal  0.0134554 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1052  formate--tetrahydrofolate ligase  44.27 
 
 
556 aa  480  1e-134  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3236  formate--tetrahydrofolate ligase  44.6 
 
 
558 aa  481  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.932652  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0414  formate--tetrahydrofolate ligase  44.67 
 
 
557 aa  482  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119816  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0083  Formate-tetrahydrofolate ligase  44.02 
 
 
556 aa  480  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.784091  normal  0.246286 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2184  formate--tetrahydrofolate ligase  44.94 
 
 
554 aa  477  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2864  Formate--tetrahydrofolate ligase  45.93 
 
 
555 aa  478  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0663  formate--tetrahydrofolate ligase  45.38 
 
 
557 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1654  formate--tetrahydrofolate ligase  46.09 
 
 
555 aa  476  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0498666 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2254  formate-tetrahydrofolate ligase  43.95 
 
 
557 aa  477  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000171666  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2316  formate--tetrahydrofolate ligase  45.38 
 
 
557 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.345965 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1283  formate--tetrahydrofolate ligase  44.66 
 
 
555 aa  475  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0499733  normal  0.578688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0569  formate--tetrahydrofolate ligase  45.37 
 
 
557 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134606  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1295  formate--tetrahydrofolate ligase  41.85 
 
 
555 aa  472  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.973248  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2204  formate--tetrahydrofolate ligase  44.04 
 
 
559 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.160817  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1756  formate--tetrahydrofolate ligase  42.08 
 
 
554 aa  469  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0981  formate--tetrahydrofolate ligase  44.5 
 
 
558 aa  468  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.911463  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>