165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF00730 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001303  ANIA_11125  glycyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_5G05920)  54.81 
 
 		 689 aa  751    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26972  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00730  glycine-tRNA ligase, putative  100 
 
 		 699 aa  1451    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64855  cyl-tRNA synthase  58.27 
 
 		 661 aa  763    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0270271 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12730  predicted protein  45.95 
 
 		 677 aa  572  1e-161  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.384524 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19761  predicted protein  44.07 
 
 		 702 aa  556  1e-157  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0271  glycyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 577 aa  430  1e-119  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.411942  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1294  glycyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 		 579 aa  431  1e-119  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1458  glycyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 		 575 aa  424  1e-117  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1227  glycyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 		 574 aa  425  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1214  glycyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 		 574 aa  426  1e-117  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.721399  normal  0.84137 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0741  glycyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 574 aa  422  1e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483491  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1209  glycyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 		 607 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0919  glycyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 		 581 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0734  glycyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 557 aa  383  1e-105  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0237887  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3710  glycyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 593 aa  375  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1989  glycyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 		 630 aa  374  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101763  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1707  glycyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 		 572 aa  372  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0814  glycyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 		 573 aa  370  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1488  glycyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 		 586 aa  369  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1156  glycyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 		 576 aa  367  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0293  glycyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 		 594 aa  369  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0367979  normal  0.30338 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0796  glycyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 		 589 aa  359  9.999999999999999e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0336  glycyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 590 aa  339  9.999999999999999e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1628  glycyl-tRNA synthetase  33.23 
 
 		 588 aa  336  7e-91  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1821  glycyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 		 585 aa  333  7.000000000000001e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.651121 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0895  glycyl-tRNA synthetase  33.44 
 
 		 585 aa  332  1e-89  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1433  glycyl-tRNA synthetase  32.5 
 
 		 583 aa  323  6e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1419  glycyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 576 aa  323  9.000000000000001e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1061  glycyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 573 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.238733  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2213  glycyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 		 571 aa  316  9.999999999999999e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.472902  hitchhiker  0.00000523773 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1420  glycyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 		 574 aa  275  3e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0288  glycyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 		 497 aa  240  6.999999999999999e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0063  glycyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 		 485 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.823142 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50885  predicted protein  32.68 
 
 		 602 aa  181  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1692  glycyl-tRNA synthetase  26.58 
 
 		 502 aa  178  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2477  glycyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 		 481 aa  173  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0775  glycyl-tRNA synthetase  31.43 
 
 		 466 aa  172  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0024  glycyl-tRNA synthetase  32.48 
 
 		 488 aa  170  9e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00479834  normal  0.0124989 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0024  glycyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 		 488 aa  169  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.757041 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0023  glycyl-tRNA synthetase  31.92 
 
 		 489 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0017  glycyl-tRNA synthetase  30.67 
 
 		 489 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.606258 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1861  glycyl-tRNA synthetase  27.82 
 
 		 508 aa  164  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1581  glycyl-tRNA synthetase  29.7 
 
 		 464 aa  161  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0036  glycyl-tRNA synthetase  32.06 
 
 		 489 aa  160  7e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.479025  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0505  glycyl-tRNA synthetase  24.35 
 
 		 456 aa  159  2e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0275239  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1774  glycyl-tRNA synthetase  31.28 
 
 		 525 aa  158  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.360257  normal  0.456837 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1348  glycyl-tRNA synthetase  29.77 
 
 		 462 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000102075  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1940  glycyl-tRNA synthetase  30.1 
 
 		 471 aa  157  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0293007  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2167  glycyl-tRNA synthetase  29.97 
 
 		 466 aa  157  6e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0746701  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2174  glycyl-tRNA synthetase  30.35 
 
 		 507 aa  157  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0798497  normal  0.636164 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3372  glycyl-tRNA synthetase  28.37 
 
 		 460 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000503575  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0030  glycyl-tRNA synthetase  31.42 
 
 		 491 aa  154  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0045  glycyl-tRNA synthetase  29.69 
 
 		 489 aa  154  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf348  glycyl-tRNA synthetase  27.63 
 
 		 463 aa  154  5e-36  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2779  glycyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 		 467 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2465  glycyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 		 467 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1312  glycyl-tRNA synthetase  29.16 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00852036  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0046  glycyl-tRNA synthetase  28.66 
 
 		 530 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5053  glycyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 458 aa  152  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4784  glycyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 458 aa  152  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.926667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0188  glycyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 458 aa  151  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4646  glycyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 458 aa  152  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5147  glycyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 458 aa  152  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5046  glycyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 458 aa  152  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5025  glycyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 458 aa  152  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5058  glycyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 458 aa  152  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3524  glycyl-tRNA synthetase  29.06 
 
 		 458 aa  151  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1667  glycyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 		 467 aa  150  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0149928  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4736  glycyl-tRNA synthetase  29.06 
 
 		 458 aa  150  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.16932  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3249  glycyl-tRNA synthetase  30.5 
 
 		 495 aa  150  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.281053  decreased coverage  0.00448945 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4624  glycyl-tRNA synthetase  29.06 
 
 		 458 aa  150  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.27496  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1716  glycyl-tRNA synthetase  27.77 
 
 		 504 aa  150  9e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.391991 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl268  glycyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000087846  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1654  glycyl-tRNA synthetase  31.22 
 
 		 551 aa  150  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2165  glycyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 		 515 aa  149  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1623  glycyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 		 463 aa  148  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1657  glycyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 		 463 aa  148  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0862  glycyl-tRNA synthetase  28.72 
 
 		 530 aa  147  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1367  glycyl-tRNA synthetase  29.44 
 
 		 461 aa  147  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000023951 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0796  glycyl-tRNA synthetase  30.2 
 
 		 513 aa  147  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.412856  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3489  glycyl-tRNA synthetase  29.67 
 
 		 504 aa  146  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0361  glycyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 		 496 aa  146  1e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.142453 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1000  glycyl-tRNA synthetase  29.06 
 
 		 509 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.450604  hitchhiker  0.00350123 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0564  glycyl-tRNA synthetase  29.97 
 
 		 473 aa  145  2e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.425616  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2743  glycyl-tRNA synthetase  28.89 
 
 		 478 aa  145  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1330  glycyl-tRNA synthetase  29.19 
 
 		 461 aa  144  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1132  glycyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 		 463 aa  144  5e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.404381  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1841  glycyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 		 457 aa  144  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1451  glycyl-tRNA synthetase  28.87 
 
 		 539 aa  144  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.269775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0648  glycyl-tRNA synthetase  28.13 
 
 		 462 aa  144  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3445  glycyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 		 468 aa  144  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3508  glycyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 		 468 aa  144  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11840  glycyl-tRNA synthetase  28.89 
 
 		 468 aa  144  7e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000800535  normal  0.839416 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1776  glycyl-tRNA synthetase  28.22 
 
 		 462 aa  143  9e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0539153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3494  glycyl-tRNA synthetase  28.79 
 
 		 460 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4906  glycyl-tRNA synthetase  30.46 
 
 		 494 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0719928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3456  glycyl-tRNA synthetase  27.76 
 
 		 468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.740599  normal  0.258272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7032  glycyl-tRNA synthetase  29.31 
 
 		 460 aa  141  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.761562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3818  glycyl-tRNA synthetase  27.94 
 
 		 468 aa  140  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196425  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0134  glycyl-tRNA synthetase  28.29 
 
 		 490 aa  140  6e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0139549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>