More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC06390 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC06390  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 474 aa  964    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05140  tetracycline transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07300)  40.52 
 
 		 454 aa  286  5.999999999999999e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 442 aa  165  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  25.66 
 
 		 424 aa  107  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 423 aa  99.4  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  24.39 
 
 		 391 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  25.97 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 407 aa  94.7  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 444 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  23.58 
 
 		 414 aa  90.1  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  23.58 
 
 		 414 aa  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29931  multidrug ABC transporter  24.03 
 
 		 435 aa  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.910726 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 		 424 aa  89.7  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 		 425 aa  87.4  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  25.27 
 
 		 417 aa  86.7  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19051  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  25.06 
 
 		 423 aa  86.7  8e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 		 421 aa  85.9  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 434 aa  83.6  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18861  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  24.81 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.899402  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 386 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1788  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  24.81 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  21.46 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  22.88 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3727  cold shock protein  35.65 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.664331 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 398 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 416 aa  79.7  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  21.73 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  20.32 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  21.05 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  33.63 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 395 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0530  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 415 aa  76.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308388  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  21.45 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3044  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  23.45 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  25 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 		 408 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  22.78 
 
 		 387 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  23.65 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  22.56 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  23.3 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  31.58 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  23.65 
 
 		 453 aa  67.8  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 421 aa  67  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0075  major facilitator transporter  25 
 
 		 343 aa  67  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.884221  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 397 aa  67  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  33.06 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  21.88 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  23.84 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18861  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  23.64 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.779737  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0813  class H tetracycline resistance efflux protein  23.5 
 
 		 449 aa  65.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2662  major facilitator superfamily permease  25 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  26.85 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  22.62 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  23.66 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  22.15 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  36.04 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  21.75 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  23.29 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 402 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 396 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0314  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0682  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0657  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  30.63 
 
 		 388 aa  59.7  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  30.63 
 
 		 388 aa  59.7  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  25.62 
 
 		 396 aa  59.7  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  20.27 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0731  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2776  major facilitator transporter  22.78 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.978343 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0047  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00890  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15490)  26.27 
 
 		 591 aa  57.4  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.525892 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04260  hypothetical protein  24.43 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.954801  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0278  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 399 aa  57  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>