More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1205 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1205  competence/damage-inducible domain-containing protein  100 
 
 		 362 aa  728    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1081  competence/damage-inducible domain-containing protein  98.9 
 
 		 362 aa  722    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0661  competence/damage-inducible domain-containing protein  98.07 
 
 		 362 aa  714    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1162  competence/damage-inducible protein, CinA family  57.78 
 
 		 363 aa  426  1e-118  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0975  competence/damage-inducible domain-containing protein  45.6 
 
 		 365 aa  336  3.9999999999999995e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0279  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.53 
 
 		 365 aa  318  7.999999999999999e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.374497  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0608  competence/damage-inducible domain-containing protein  38.95 
 
 		 363 aa  296  4e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000534602  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0905  competence/damage-inducible domain-containing protein  40.22 
 
 		 364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.37369  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0482  CinA domain protein  36.46 
 
 		 369 aa  239  4e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0781  CinA-like  32.04 
 
 		 362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00322218  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  38.07 
 
 		 408 aa  105  9e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  34.09 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4031  CinA domain-containing protein  36.02 
 
 		 160 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306417  unclonable  0.0000000000000327829 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  29.13 
 
 		 413 aa  97.4  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  35.88 
 
 		 184 aa  97.8  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  34.01 
 
 		 168 aa  96.7  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4089  CinA domain-containing protein  36.02 
 
 		 160 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  38.13 
 
 		 162 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1628  CinA domain-containing protein  36.02 
 
 		 160 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  38.13 
 
 		 162 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  30.77 
 
 		 433 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0712  CinA domain protein  37.41 
 
 		 162 aa  94.4  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  38.46 
 
 		 411 aa  94  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  39.72 
 
 		 371 aa  92.8  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  40 
 
 		 159 aa  93.2  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  38.35 
 
 		 166 aa  92  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  37.93 
 
 		 166 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  37.24 
 
 		 166 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  31.65 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  33.55 
 
 		 218 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  36.49 
 
 		 166 aa  90.5  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  40.16 
 
 		 411 aa  90.5  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  31.33 
 
 		 160 aa  90.1  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  35.81 
 
 		 165 aa  89.7  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  36.49 
 
 		 166 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  36.49 
 
 		 166 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  38.89 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  36.49 
 
 		 166 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  36.49 
 
 		 166 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  35.86 
 
 		 184 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  36.49 
 
 		 166 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  35.86 
 
 		 413 aa  88.6  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  36.49 
 
 		 166 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  36.49 
 
 		 166 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.46 
 
 		 433 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.88 
 
 		 424 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  28.65 
 
 		 412 aa  87  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1704  CinA domain protein  35 
 
 		 200 aa  87.4  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.28377  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2607  CinA domain-containing protein  34.46 
 
 		 166 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.095939 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  28.65 
 
 		 412 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  28.65 
 
 		 412 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0708  CinA domain-containing protein  34.75 
 
 		 163 aa  86.7  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  35.86 
 
 		 166 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1960  CinA domain-containing protein  35.14 
 
 		 164 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2477  CinA domain protein  41.84 
 
 		 156 aa  86.7  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  28.12 
 
 		 412 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  34.03 
 
 		 412 aa  86.3  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  35.86 
 
 		 166 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0781  CinA domain protein  35.81 
 
 		 165 aa  85.9  9e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000616829  normal  0.0277412 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  35.86 
 
 		 166 aa  85.9  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  35.86 
 
 		 166 aa  85.9  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1230  CinA domain-containing protein  34.78 
 
 		 160 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000125807 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  33.77 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  34.46 
 
 		 160 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  33.97 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  33.1 
 
 		 170 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0840  competence damage-inducible protein A  36.43 
 
 		 162 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0987514  hitchhiker  0.00000024761 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  37.59 
 
 		 165 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  33.97 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  37.4 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4034  cinA domain protein  36.49 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.344001  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2602  CinA domain-containing protein  32.86 
 
 		 163 aa  84.3  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  34.31 
 
 		 168 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  33.92 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  29.11 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  27.6 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1377  CinA, C-terminal  35.51 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.368331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  44.55 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1725  competence/damage inducible protein CinA  35.34 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2083  CinA domain-containing protein  37.04 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  36.84 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0385  competence/damage inducible protein CinA  31.69 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  36.84 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1287  CinA-like  36.17 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  29.41 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  33.11 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  36.84 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  28.65 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  28.65 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  29.93 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  30.41 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  32.39 
 
 		 208 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  34.04 
 
 		 169 aa  82.4  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  34.03 
 
 		 403 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  31.68 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  31.91 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  28.65 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  32.1 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  31.68 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>