40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0034 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0034  zinc-related peptidase  100 
 
 		 377 aa  764    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000203877  decreased coverage  0.0000849316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4250  DNA-binding protein  42.71 
 
 		 378 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1489  protein of unknown function DUF955  38.21 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 410 aa  72.8  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  22.36 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1805  XRE family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 396 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  20.95 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  23.42 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2518  protein of unknown function DUF955  24.42 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.010681 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  21.25 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  27.07 
 
 		 355 aa  53.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0095  protein of unknown function DUF955  28.57 
 
 		 273 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  22.18 
 
 		 347 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0265  XRE family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 400 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  21.28 
 
 		 367 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4067  helix-turn-helix domain-containing protein  32.32 
 
 		 125 aa  50.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.563451 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  38.89 
 
 		 147 aa  49.7  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  20.75 
 
 		 367 aa  49.7  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  27.88 
 
 		 390 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  27.84 
 
 		 175 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  20.8 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  28.46 
 
 		 165 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  26.38 
 
 		 355 aa  47.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02310  hypothetical protein  22.58 
 
 		 349 aa  47.4  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  25.58 
 
 		 399 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  20.47 
 
 		 367 aa  46.2  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  20.68 
 
 		 386 aa  46.6  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 505 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2466  protein of unknown function DUF955  28.88 
 
 		 257 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000413379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2636  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 496 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4770  protein of unknown function DUF955  21.93 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.166779  hitchhiker  0.00150402 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  21.93 
 
 		 352 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  25.79 
 
 		 356 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 223 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2566  hypothetical protein  26.01 
 
 		 285 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4660  hypothetical protein  36.11 
 
 		 289 aa  43.5  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0389  hypothetical protein  26.19 
 
 		 393 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0725053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  21.86 
 
 		 349 aa  43.5  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  30.86 
 
 		 182 aa  43.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  25.49 
 
 		 401 aa  43.1  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>