More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1255 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1255  DNA polymerase III subunit gamma/tau  100 
 
 
526 aa  1072    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0275  DNA polymerase III subunits gamma and tau  61.49 
 
 
553 aa  585  1e-166  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.01799  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1448  DNA polymerase III subunits gamma and tau  58.99 
 
 
554 aa  565  1e-160  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0128933  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1423  DNA polymerase III subunits gamma and tau  57.7 
 
 
529 aa  552  1e-156  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0470  DNA polymerase III subunits gamma and tau  49.06 
 
 
510 aa  502  1e-141  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1174  DNA polymerase III subunits gamma and tau  53.63 
 
 
509 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.630806  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1293  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.19 
 
 
509 aa  490  1e-137  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0442  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49 
 
 
546 aa  479  1e-134  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.717493  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0571  DNA polymerase III subunits gamma and tau  52.67 
 
 
509 aa  481  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.337724  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1557  DNA polymerase III subunits gamma and tau  51.63 
 
 
543 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.311213  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2219  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.06 
 
 
812 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373497  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1361  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.06 
 
 
825 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.926406  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2206  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.06 
 
 
826 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236828  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1123  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.06 
 
 
825 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.496963  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2373  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.06 
 
 
822 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1851  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.06 
 
 
825 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0281713  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0045  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.06 
 
 
825 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2244  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.06 
 
 
825 aa  297  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748475  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1613  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.64 
 
 
637 aa  296  6e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000410993  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0951  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.13 
 
 
793 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127107  normal  0.667155 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2361  DNA-directed DNA polymerase  41.57 
 
 
957 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.832917  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1826  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.57 
 
 
893 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.297137 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6252  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.13 
 
 
787 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.554361  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1827  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.13 
 
 
787 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203884  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5128  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.58 
 
 
791 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00417503  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1851  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.13 
 
 
793 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.51542  normal  0.226661 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1335  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.21 
 
 
690 aa  295  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0235479  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1572  DNA polymerase III, tau subunit  40.56 
 
 
572 aa  295  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13387  hitchhiker  0.00000463974 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1446  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.06 
 
 
821 aa  294  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223161  normal  0.14614 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0644  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.48 
 
 
558 aa  294  3e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.453293  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1073  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.64 
 
 
553 aa  293  5e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1738  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.85 
 
 
813 aa  293  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206235  normal  0.0482422 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1765  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.85 
 
 
824 aa  293  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3744  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  49.82 
 
 
715 aa  291  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0700  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.21 
 
 
553 aa  291  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0529  DNA-directed DNA polymerase  50.75 
 
 
696 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000324921  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1855  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.54 
 
 
587 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225715  normal  0.416564 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.11 
 
 
579 aa  288  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50 
 
 
685 aa  286  5.999999999999999e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.95549  normal  0.915026 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1200  DNA polymerase III subunits gamma and tau  54 
 
 
667 aa  286  7e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1805  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.51 
 
 
696 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1858  DNA-directed DNA polymerase  49.63 
 
 
580 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1055  DNA polymerase III, gamma subunit / DNA polymerase III, tau subunit  49.63 
 
 
631 aa  284  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0820336  normal  0.461674 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4269  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.45 
 
 
691 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2852  DNA-directed DNA polymerase  42.51 
 
 
955 aa  282  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00013426  hitchhiker  0.000000946714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1599  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.45 
 
 
692 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0852408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3587  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.45 
 
 
689 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.98 
 
 
569 aa  282  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19830  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.38 
 
 
694 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3834  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.45 
 
 
687 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.471872 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1458  DNA polymerase III subunits gamma and tau  52.48 
 
 
723 aa  281  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.04 
 
 
579 aa  281  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.36 
 
 
591 aa  281  3e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.775776  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.04 
 
 
582 aa  280  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0806  AAA ATPase, central region  47.39 
 
 
537 aa  280  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343257  unclonable  0.000000100554 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0857  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.16 
 
 
681 aa  280  4e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1793  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.77 
 
 
911 aa  280  5e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00315607  hitchhiker  0.000000397841 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.39 
 
 
939 aa  280  5e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000837393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  38.79 
 
 
579 aa  280  6e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44630  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.35 
 
 
701 aa  280  6e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522569  normal  0.208913 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2647  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.45 
 
 
692 aa  280  6e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.377545  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3801  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.35 
 
 
681 aa  280  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1508  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.29 
 
 
948 aa  279  8e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000466847  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3646  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.38 
 
 
743 aa  279  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1123  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.79 
 
 
543 aa  279  1e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.920332  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1825  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.38 
 
 
736 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02443  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.79 
 
 
698 aa  279  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2574  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.06 
 
 
1147 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000534901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.03 
 
 
582 aa  278  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2690  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.06 
 
 
1137 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00745534  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1217  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.79 
 
 
601 aa  278  2e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2615  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.69 
 
 
1137 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000443473  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.69 
 
 
1115 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000438447  hitchhiker  0.00599619 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2013  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  47.06 
 
 
1002 aa  276  6e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2254  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.69 
 
 
1071 aa  276  6e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000102262  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.69 
 
 
1045 aa  276  7e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00214919  hitchhiker  0.000897105 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1454  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.25 
 
 
751 aa  276  8e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325473  normal  0.0490605 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2129  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.23 
 
 
795 aa  276  9e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.25169  normal  0.3831 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1976  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.86 
 
 
650 aa  275  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0621035 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2381  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.07 
 
 
921 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000191992  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1191  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.91 
 
 
728 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.775033  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2446  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.32 
 
 
1040 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00022165  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3235  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.64 
 
 
690 aa  274  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00193084  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2235  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.17 
 
 
1113 aa  274  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00400296  decreased coverage  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1076  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.64 
 
 
685 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258766  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03087  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.64 
 
 
736 aa  273  5.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1510  DNA polymerase III, tau subunit / DNA polymerase III, gamma subunit  45.8 
 
 
648 aa  273  5.000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0569414  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.69 
 
 
664 aa  273  6e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176808  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1457  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.57 
 
 
647 aa  273  7e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2302  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.32 
 
 
957 aa  273  7e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000141755  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0511  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.69 
 
 
614 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  49.41 
 
 
774 aa  270  7e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2534  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.32 
 
 
752 aa  269  8e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.821414  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1135  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.86 
 
 
650 aa  269  8e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239786  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  44.41 
 
 
582 aa  269  8.999999999999999e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2897  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.01 
 
 
914 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.579528  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2112  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.06 
 
 
730 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635796  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2534  DNA-directed DNA polymerase  46.04 
 
 
614 aa  269  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.505064 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0796  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.36 
 
 
565 aa  269  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1399  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40 
 
 
716 aa  269  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>