32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1260 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1260  RDD protein  100 
 
 		 151 aa  308  2e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0950  RDD protein  53.69 
 
 		 150 aa  177  5.999999999999999e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0491  RDD family protein  50.66 
 
 		 149 aa  158  3e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.628984  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0598  RDD domain containing protein  50 
 
 		 151 aa  147  5e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0474  hypothetical protein  41.61 
 
 		 150 aa  120  6e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.647005  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1388  hypothetical protein  41.61 
 
 		 150 aa  120  8e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1267  hypothetical protein  41.61 
 
 		 150 aa  120  9e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  45.45 
 
 		 141 aa  116  7.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0425  RDD protein  39.6 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0505  conserved hypothetical protein, RDD family  40.4 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0542  RDD family protein  37.5 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  36.08 
 
 		 198 aa  52.8  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  28.57 
 
 		 258 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  35.29 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0793  hypothetical protein  27.33 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  37.97 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  35 
 
 		 166 aa  47.4  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  27.21 
 
 		 169 aa  46.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0445  hypothetical protein  29.68 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  37.31 
 
 		 195 aa  45.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  36.76 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  32.88 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  29.66 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1940  RDD domain-containing protein  27.63 
 
 		 246 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000546955  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  30.08 
 
 		 270 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  35.82 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  25.81 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  25.69 
 
 		 257 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  31.46 
 
 		 157 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  25.95 
 
 		 272 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  25.78 
 
 		 156 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  33.73 
 
 		 406 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>