More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1003 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1003  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 289 aa  583  1e-166  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1972  GTP-binding protein Era  62.46 
 
 		 289 aa  387  1e-106  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1223  GTP-binding protein Era  59.64 
 
 		 289 aa  363  2e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.225861  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0758  GTP-binding protein Era  56.84 
 
 		 290 aa  347  2e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.334312  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1060  GTP-binding protein Era  57.09 
 
 		 289 aa  346  2e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00411947  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0688  GTP-binding protein Era  57.19 
 
 		 291 aa  333  1e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0763  GTP-binding protein Era  56.49 
 
 		 291 aa  331  1e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1338  GTP-binding protein Era  54.74 
 
 		 291 aa  315  4e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.548125  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1032  GTP-binding protein Era  50.88 
 
 		 296 aa  312  3.9999999999999997e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.238  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1378  GTP-binding protein Era  45.96 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000347783  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  37.41 
 
 		 324 aa  209  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  36.11 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  37.28 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  32.06 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  36.18 
 
 		 297 aa  189  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  35.99 
 
 		 298 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  35.84 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  35.64 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  37.24 
 
 		 296 aa  186  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  35.23 
 
 		 303 aa  186  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  37.24 
 
 		 296 aa  185  7e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  34.84 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  35.07 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  35.07 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  35.4 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  35.07 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  35.07 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  35.07 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  36.59 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  35.07 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  35.07 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  34.86 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  36.01 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1731  GTP-binding protein Era  33.56 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  34.39 
 
 		 300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  35.07 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  33.56 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1011  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 299 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262432  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  34.72 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  34.95 
 
 		 301 aa  178  8e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  32.76 
 
 		 299 aa  178  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl266  GTP-binding protein Era  35.86 
 
 		 301 aa  178  9e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.59888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  32.76 
 
 		 299 aa  178  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0544  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  34.6 
 
 		 301 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2894  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4247  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2839  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2816  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.989072  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0655  GTP-binding protein Era  33.68 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2465  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 311 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1135  GTP-binding protein Era  33.68 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1788  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1064  GTP-binding protein Era  32.29 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0212543  normal  0.0907756 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2085  GTPase  30.53 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2778  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0597  GTP-binding protein Era  33.22 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117321 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  34.63 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  33.1 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  35.55 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0929  GTP-binding protein Era  31.6 
 
 		 312 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163867  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0994  GTP-binding protein Era  31.6 
 
 		 312 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307835  normal  0.0847852 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1015  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 287 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  33.79 
 
 		 303 aa  176  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  32.88 
 
 		 302 aa  175  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1093  GTP-binding protein Era  33.69 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2169  GTP-binding protein Era  33.68 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0368513  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  33.68 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1744  GTP-binding protein Era  32.89 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000728906  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0651  putative GTP-binding protein  32.07 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5260  GTP-binding protein Era  32.2 
 
 		 344 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.678388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  34.72 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  33.68 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  31.72 
 
 		 299 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0507  GTP-binding protein Era  37.93 
 
 		 301 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.000333853  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0864  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1008  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.028746 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  32.4 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  32.17 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  35.66 
 
 		 299 aa  171  9e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  32.17 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  29.77 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  31.12 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1387  GTP-binding protein Era  34.39 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.263237  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2251  GTP-binding protein Era  30.66 
 
 		 311 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.41102  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  32.43 
 
 		 468 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  33.92 
 
 		 449 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  35.74 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1069  GTP-binding protein Era  33.45 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  30.17 
 
 		 303 aa  169  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2417  GTP-binding protein Era  31.71 
 
 		 312 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.262207 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  32.18 
 
 		 298 aa  169  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  32.29 
 
 		 294 aa  169  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  32.39 
 
 		 295 aa  169  7e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1197  GTP-binding protein Era  32.2 
 
 		 344 aa  169  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2619  GTP-binding protein Era  32.77 
 
 		 337 aa  168  8e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3266  GTP-binding protein Era  32.77 
 
 		 337 aa  168  8e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0242334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0881  GTP-binding protein Era  33.91 
 
 		 332 aa  168  8e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.427391  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  34.26 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>