127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0475 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0475  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 		 304 aa  603  1.0000000000000001e-171  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.848355  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0090  mce related protein  39.94 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0575  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  41.18 
 
 		 288 aa  206  3e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1435  hypothetical protein  38.26 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  23.96 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0232  hypothetical protein  24.68 
 
 		 310 aa  97.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.22 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  27.65 
 
 		 579 aa  94.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  31.84 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  31.84 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  30.85 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  25.33 
 
 		 298 aa  87  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  24.84 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  24.52 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0297  Mammalian cell entry related domain protein  27.69 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  24.28 
 
 		 312 aa  79  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  20.86 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  25.35 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  22.26 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0177  Mammalian cell entry related domain protein  22.82 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0170  Mammalian cell entry related domain protein  23.83 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1526  hypothetical protein  25.62 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0265226  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0184  hypothetical protein  25 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.683235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  22.8 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  24.18 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0315  signal peptide protein  22.15 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2368  hypothetical protein  23.32 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.709282  normal  0.77833 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0172  Mce family protein  27.89 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0922  hypothetical protein  22.28 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  28.04 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  28.8 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  28.8 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3915  hypothetical protein  25.44 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0099  hypothetical protein  25.11 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447004  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  22.12 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4483  Mammalian cell entry related domain protein  27.55 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1983  hypothetical protein  25.26 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  33.05 
 
 		 458 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  24.06 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2002  hypothetical protein  23.68 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  23.96 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  23 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  23.78 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0249  ABC-type transport system periplasmic component  25.13 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.79889 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0493  Mammalian cell entry related domain protein  26.29 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  normal  0.0924288 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1895  ABC transporter substrate binding protein  33.9 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1208  hypothetical protein  28.48 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  28.77 
 
 		 456 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2275  Mammalian cell entry related domain protein  22.43 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1638  hypothetical protein  26.9 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  22.44 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  22.65 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  22.11 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.11 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  27.8 
 
 		 456 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1629  hypothetical protein  24.37 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.232196 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  23.73 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0252  hypothetical protein  20.67 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0686058 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  21.41 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  21.41 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0367  hypothetical protein  28.45 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4115  hypothetical protein  24.29 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0544388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0070  hypothetical protein  31.14 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0246  Mammalian cell entry related domain protein  21.53 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  23 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  23.62 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2843  hypothetical protein  23.95 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0064  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.74 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.702785  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0614  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.74 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399104  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2948  hypothetical protein  25.77 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.74 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1363  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.74 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.498606  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0433  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.74 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0452  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.74 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3199  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.74 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5555  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.6 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99193  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.08 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  23.46 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2810  hypothetical protein  25.77 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.177575 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  22.17 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1454  hypothetical protein  25.13 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0405  hypothetical protein  24.51 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0144565 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0207  hypothetical protein  24.55 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  21.52 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0375  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.84 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.747955  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0308  hypothetical protein  21.14 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  27.12 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  24.06 
 
 		 378 aa  57  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  23.36 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2284  hypothetical protein  28.57 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2899  hypothetical protein  28.57 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236087  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2908  hypothetical protein  25.26 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6241  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  29.37 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  22.17 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.15 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4223  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  25.26 
 
 		 320 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1317  hypothetical protein  24.88 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  23.68 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  21.66 
 
 		 312 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  28.48 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>