More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0413 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2198  ABC transporter ATP-binding protein  81.14 
 
 		 529 aa  866    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0113236  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0475  ABC transporter, ATP-binding protein  70.44 
 
 		 525 aa  758    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0281807  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1529  ABC transporter, ATP-binding protein  70.06 
 
 		 525 aa  756    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0413  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 527 aa  1068    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0187168  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  70.44 
 
 		 525 aa  761    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1507  ABC transporter-related protein  62.55 
 
 		 534 aa  669    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0432  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B (PPIase B; rotamase B)  82.8 
 
 		 529 aa  879    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0254  ABC transporter, ATP-binding protein  70.53 
 
 		 524 aa  764    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1696  ABC transporter related protein  67.36 
 
 		 531 aa  710    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2013  ABC transporter-related protein  49.24 
 
 		 541 aa  485  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000145808  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1453  ABC transporter related  49.15 
 
 		 533 aa  479  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2988  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 		 541 aa  481  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000213646  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3372  ABC transporter related  47.62 
 
 		 542 aa  481  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000385391  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2689  ABC transporter, ATP-binding protein  48.67 
 
 		 541 aa  479  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000011561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2667  ABC transporter, ATP-binding protein  48.67 
 
 		 541 aa  480  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000362923  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1482  ABC transporter related  49.15 
 
 		 533 aa  479  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2288  ABC transporter, ATP-binding protein  48.67 
 
 		 541 aa  478  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000589648  hitchhiker  1.14082e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2947  ABC transporter, ATP-binding protein  48.67 
 
 		 541 aa  480  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10459e-43 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2994  ABC transporter, ATP-binding protein  48.67 
 
 		 541 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000223296  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0962  ABC transporter, ATP-binding protein  48.96 
 
 		 535 aa  476  1e-133  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.6502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2738  ABC transporter ATP-binding protein  48.29 
 
 		 541 aa  475  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000394733  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1485  ABC transporter related  48.38 
 
 		 537 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2948  ABC transporter ATP-binding protein  48.29 
 
 		 541 aa  475  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000544577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2952  ABC transporter, ATP-binding protein  48.29 
 
 		 541 aa  476  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1592  ABC transporter, ATP-binding protein  46.98 
 
 		 550 aa  473  1e-132  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.717967  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2755  ABC transporter related  44.47 
 
 		 528 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2609  ABC transporter-like  45.04 
 
 		 528 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2003  ABC transporter related  45.04 
 
 		 528 aa  473  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118433  decreased coverage  0.00762466 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2936  ABC transporter ATP-binding protein  44.47 
 
 		 528 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.914866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2836  ABC transporter related  44.66 
 
 		 528 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104102  normal  0.187196 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1852  ABC transporter related protein  48.67 
 
 		 541 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2750  ABC transporter related  44.47 
 
 		 528 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.742675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0723  ABC transporter related protein  47.72 
 
 		 539 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1367  ABC transporter related  47.81 
 
 		 538 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.213728  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1559  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  44.92 
 
 		 531 aa  468  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03121  ABC transporter ATP-binding protein  45.35 
 
 		 530 aa  468  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2480  ABC transporter related  44.74 
 
 		 529 aa  468  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28710  ABC transporter, ATP binding component  43.69 
 
 		 521 aa  460  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3311  ABC transporter related  45.73 
 
 		 527 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.819079 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2634  ABC-type transport system, ATPase component  45.75 
 
 		 544 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285179  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2535  ABC transporter related  43.43 
 
 		 530 aa  461  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.776559  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1409  ABC transporter related  43.62 
 
 		 530 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2949  ABC transporter related  46.48 
 
 		 545 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000330729  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00787  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  43.43 
 
 		 530 aa  458  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2822  ABC transporter related protein  43.43 
 
 		 530 aa  458  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.596097  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2483  ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 		 531 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0169  ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 		 545 aa  458  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003501  ABC transporter ATP-binding protein  44.49 
 
 		 530 aa  456  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0877  ABC transporter, ATP-binding protein  43.43 
 
 		 530 aa  458  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0227  ABC transporter related  46.29 
 
 		 537 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198546  normal  0.0874322 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2823  ABC transporter related  43.43 
 
 		 530 aa  458  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0969  ABC transporter, ATP-binding protein  43.43 
 
 		 530 aa  458  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.12537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1434  ABC transporter related protein  46.11 
 
 		 543 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.36515 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2581  ABC transporter related  42.86 
 
 		 531 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0890  ABC transporter, ATP-binding protein  43.43 
 
 		 530 aa  458  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.725571  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2528  ABC transporter, ATP-binding protein  43.43 
 
 		 530 aa  458  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138533  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  43.43 
 
 		 530 aa  458  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00804  hypothetical protein  43.43 
 
 		 530 aa  458  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02269  hypothetical protein  44.49 
 
 		 530 aa  456  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1063  ABC transporter related  44 
 
 		 530 aa  455  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3332  ABC transporter ATP-binding protein  42.94 
 
 		 529 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2999  ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 		 587 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000839463 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2630  ABC transporter-related protein  45.33 
 
 		 545 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0906  ABC transporter ATP-binding protein  43.24 
 
 		 530 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.753314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3011  ABC transporter related  45.52 
 
 		 545 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00994639  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0969  ABC transporter ATP-binding protein  43.24 
 
 		 531 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0990  ABC transporter ATP-binding protein  43.24 
 
 		 531 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1386  ABC transporter, ATP-binding protein  42.59 
 
 		 531 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.65535  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2115  ABC transporter ATPase  45.09 
 
 		 549 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.199216  normal  0.196946 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0945  ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 		 530 aa  455  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.638605  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1311  ABC transporter related  42.86 
 
 		 531 aa  452  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3550  ABC transporter related  46.48 
 
 		 545 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000348085  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3458  ABC transporter, ATP-binding protein  45.25 
 
 		 538 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0161229 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0945  ABC transporter related  46.99 
 
 		 544 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000191472 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0936  ABC transporter ATP-binding protein  43.24 
 
 		 530 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0878  ABC transporter, ATP-binding protein  43.24 
 
 		 530 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.720445  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2525  ABC transporter, ATP-binding protein  44.47 
 
 		 533 aa  449  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2495  ABC transporter  43.1 
 
 		 529 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2753  ABC transporter related  43.24 
 
 		 530 aa  451  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3303  ABC transporter related protein  45.9 
 
 		 544 aa  450  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1560  ABC transporter related  45.14 
 
 		 554 aa  448  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046751  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0820  ABC transporter related  45.68 
 
 		 527 aa  449  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.354226  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1448  ABC transporter related  44.4 
 
 		 541 aa  449  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.126465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1127  ABC transporter, ATP-binding protein  44.19 
 
 		 530 aa  450  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1995  ABC transporter ATPase  46.2 
 
 		 540 aa  449  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.79953  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1839  ABC transporter related  43.83 
 
 		 536 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.645779  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11928  ABC transporter, ATP-binding protein  45.08 
 
 		 543 aa  445  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.680415  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2171  ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 		 539 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0650343  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2766  ABC transporter, ATP-binding protein  44.16 
 
 		 521 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0491169  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1517  ABC transporter related protein  42.78 
 
 		 530 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2882  ABC transporter related  42.26 
 
 		 528 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1606  ABC transporter related  43.05 
 
 		 528 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4180  ABC transporter related  43.73 
 
 		 534 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0101186  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2370  ABC transporter related  44.15 
 
 		 536 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1915  ABC transporter related  45.16 
 
 		 539 aa  446  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0601871  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06614  hypothetical protein  45.37 
 
 		 526 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4550  ABC transporter related  44.78 
 
 		 539 aa  444  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.767236  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3260  ABC transporter ATP-binding protein, two fused  44.29 
 
 		 523 aa  443  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0410854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1811  ABC transporter related  44.05 
 
 		 557 aa  444  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39130  putative ATP-binding component of ABC transporter  42.91 
 
 		 521 aa  445  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.288914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>