256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1480 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  100 
 
 
306 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  63.57 
 
 
294 aa  373  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  48.45 
 
 
307 aa  255  5e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  46.53 
 
 
302 aa  251  2e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1796  permeases of the drug/metabolite transporter  48.11 
 
 
292 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.16 
 
 
301 aa  224  1e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  34.58 
 
 
301 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.25 
 
 
302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  33.9 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  37.2 
 
 
292 aa  145  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  34.62 
 
 
286 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  34.24 
 
 
301 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  33.56 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  33.9 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  33.22 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  33.22 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  33.22 
 
 
303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  33.22 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  33.22 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  33.22 
 
 
303 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.36 
 
 
312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.68 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  31.1 
 
 
319 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.73 
 
 
294 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.9 
 
 
293 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  34.27 
 
 
296 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  31.16 
 
 
293 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 
283 aa  122  6e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.46 
 
 
308 aa  122  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  31.86 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  32.27 
 
 
288 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  31.79 
 
 
288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.34 
 
 
301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.72 
 
 
343 aa  119  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.81 
 
 
308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.34 
 
 
308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0053  hypothetical protein  32.18 
 
 
300 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.261978 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  30.1 
 
 
298 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  28.9 
 
 
298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.47 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.55 
 
 
300 aa  110  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  28.87 
 
 
305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  29 
 
 
294 aa  109  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.77 
 
 
252 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  26.54 
 
 
336 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  29.54 
 
 
312 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  29.47 
 
 
299 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.03 
 
 
290 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266368  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  28.47 
 
 
300 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  28.52 
 
 
307 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  29.39 
 
 
295 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 
290 aa  102  7e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  29.63 
 
 
288 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  29.63 
 
 
288 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  28.28 
 
 
307 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  25.32 
 
 
310 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.63 
 
 
315 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1883  hypothetical protein  28.81 
 
 
310 aa  100  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00906285  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0944  hypothetical protein  31.6 
 
 
279 aa  100  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  28.28 
 
 
307 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  27.89 
 
 
323 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  29.69 
 
 
305 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 
297 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  29.64 
 
 
277 aa  99.4  7e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  27.92 
 
 
311 aa  99  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  28.22 
 
 
297 aa  99  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.05 
 
 
289 aa  98.6  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  29.22 
 
 
309 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0052  hypothetical protein  31.48 
 
 
304 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  26.38 
 
 
317 aa  97.4  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  28.22 
 
 
308 aa  97.4  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0068  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.02 
 
 
304 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  27.53 
 
 
308 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26 
 
 
318 aa  96.3  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  26.46 
 
 
314 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0056  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.02 
 
 
304 aa  95.9  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  28.72 
 
 
307 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  27.95 
 
 
305 aa  95.5  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  26.73 
 
 
316 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  26.4 
 
 
358 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.94 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.5 
 
 
293 aa  94.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.373624  normal  0.289625 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  29.6 
 
 
307 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  26.78 
 
 
299 aa  94  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.87 
 
 
296 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  31.52 
 
 
299 aa  93.6  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.35 
 
 
290 aa  93.6  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.67 
 
 
295 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  32.91 
 
 
295 aa  93.2  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  29.04 
 
 
301 aa  93.2  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  31.46 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  31.22 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3301  hypothetical protein  24.37 
 
 
296 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00885964  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.14 
 
 
296 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  28.14 
 
 
292 aa  89.4  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  26.67 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  30.38 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.05 
 
 
295 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  32.05 
 
 
295 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  29.84 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>