216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1031 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1031  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 
350 aa  690    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0715097  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0782  flagellar basal body P-ring protein  78.69 
 
 
352 aa  556  1e-157  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0096  flagellar basal body P-ring protein  65.62 
 
 
349 aa  453  1.0000000000000001e-126  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1636  flagellar basal body P-ring protein  58.33 
 
 
348 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1143  flagellar P-ring protein  59.08 
 
 
350 aa  404  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1455  flagellar basal body P-ring protein  58.33 
 
 
348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0400  flagellar basal body P-ring protein  57.51 
 
 
348 aa  402  1e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.574855  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1810  flagellar basal body P-ring protein  58.05 
 
 
348 aa  403  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0562  flagellar basal body P-ring protein  51.57 
 
 
351 aa  358  9.999999999999999e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  43.97 
 
 
368 aa  276  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  41.05 
 
 
364 aa  263  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  42.49 
 
 
365 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  43.55 
 
 
363 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  42.53 
 
 
368 aa  258  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  40.8 
 
 
398 aa  255  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  41.95 
 
 
371 aa  255  8e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  40.69 
 
 
398 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  45.61 
 
 
386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  41.96 
 
 
365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  40.05 
 
 
391 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  40.05 
 
 
391 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  42.61 
 
 
376 aa  250  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  39.79 
 
 
391 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16540  flagellar P-ring protein  40.8 
 
 
383 aa  249  6e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000030523  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3964  flagellar basal body P-ring protein  43.52 
 
 
370 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  41.69 
 
 
380 aa  248  8e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  39.28 
 
 
369 aa  248  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2926  flagellar basal body P-ring protein  41.18 
 
 
351 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.625309  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  41.43 
 
 
367 aa  247  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  42.62 
 
 
363 aa  247  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  42.28 
 
 
361 aa  247  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  41.84 
 
 
369 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  41.92 
 
 
371 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  41.6 
 
 
386 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3461  flagellar basal body P-ring protein  43.47 
 
 
372 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  41.58 
 
 
369 aa  246  6e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  42.03 
 
 
374 aa  245  9e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  43.38 
 
 
362 aa  245  9e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0349  flagellar basal body P-ring protein  44.66 
 
 
369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  40.86 
 
 
369 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  40.41 
 
 
370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0626  flagellar basal body P-ring protein  41.53 
 
 
382 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  39.68 
 
 
392 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  40.11 
 
 
394 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  42.07 
 
 
372 aa  242  5e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  40.97 
 
 
369 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  40.97 
 
 
369 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  40.11 
 
 
392 aa  242  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  39.05 
 
 
390 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  41.36 
 
 
373 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  41.99 
 
 
374 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  42.12 
 
 
378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  42.98 
 
 
369 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  42.98 
 
 
369 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  40.75 
 
 
373 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2509  flagellar basal body P-ring protein  38.16 
 
 
370 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.296708  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  40.5 
 
 
377 aa  239  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  40.65 
 
 
377 aa  239  6.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  40.92 
 
 
371 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  40.96 
 
 
377 aa  238  8e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  42.34 
 
 
392 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  41.69 
 
 
380 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1348  flagellar basal body P-ring protein  39.31 
 
 
371 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0028496  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  41.16 
 
 
373 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  41.69 
 
 
380 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  39.68 
 
 
369 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  39.52 
 
 
371 aa  238  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  40.95 
 
 
366 aa  238  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  40.5 
 
 
378 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  39.55 
 
 
370 aa  236  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  38.51 
 
 
401 aa  237  3e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  41.64 
 
 
363 aa  237  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3093  flagellar basal body P-ring protein  41.76 
 
 
363 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1423  flagellar basal body P-ring protein  41.76 
 
 
363 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.769389  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2940  flagellar basal body P-ring protein  41.76 
 
 
363 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2955  flagellar basal body P-ring protein  41.76 
 
 
363 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.667376  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  41.64 
 
 
363 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2331  flagellar basal body P-ring protein  42.31 
 
 
373 aa  236  5.0000000000000005e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  43.01 
 
 
392 aa  236  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  39.5 
 
 
401 aa  235  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2605  flagellar basal body P-ring protein  38.46 
 
 
372 aa  235  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0976186  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  40.7 
 
 
378 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3576  flagellar P-ring protein  39.56 
 
 
362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1310  flagellar basal body P-ring protein  39.94 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  41.03 
 
 
363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  41.83 
 
 
363 aa  233  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  38.95 
 
 
397 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  38.95 
 
 
397 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  38.95 
 
 
401 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1665  flagellar basal body P-ring protein  36.56 
 
 
371 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.231572  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2955  flagellar basal body P-ring protein  39.04 
 
 
395 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.468199 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1653  flagellar P-ring protein  38.61 
 
 
363 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  43.06 
 
 
376 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  38.95 
 
 
401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  38.95 
 
 
400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  38.95 
 
 
400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  38.95 
 
 
394 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06161  flagellar basal body P-ring protein  41.26 
 
 
372 aa  233  5e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0591048  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01005  flagellar basal body P-ring protein  41.26 
 
 
372 aa  233  5e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1168  flagellar basal body P-ring protein  41.74 
 
 
368 aa  233  5e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0244391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>