More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0511 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0511  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  100 
 
 
331 aa  665    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0473  rod shape-determining protein RodA  88.82 
 
 
368 aa  607  1e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.936553  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1222  cell cycle protein  70.39 
 
 
368 aa  491  9.999999999999999e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0638  cell cycle protein  70.91 
 
 
368 aa  486  1e-136  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0608  rod shape-determining protein  68.67 
 
 
369 aa  458  9.999999999999999e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1290  cell cycle protein  64.55 
 
 
366 aa  432  1e-120  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436983  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1297  rod shape-determining protein RodA, putative  64.81 
 
 
366 aa  429  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1417  rod shape-determining protein RodA, putative  64.81 
 
 
366 aa  429  1e-119  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0782  cell cycle protein  59.38 
 
 
382 aa  389  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0209575  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  38.75 
 
 
372 aa  206  7e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  39.87 
 
 
403 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  39.75 
 
 
364 aa  195  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  37.9 
 
 
372 aa  192  9e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  37.46 
 
 
372 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1485  rod shape-determining protein RodA  38.55 
 
 
380 aa  191  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140754  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0929  putative rod shape determining protein  39.14 
 
 
380 aa  189  4e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  38.86 
 
 
373 aa  189  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0500  rod shape-determining protein RodA  37.73 
 
 
384 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107532 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  39.93 
 
 
384 aa  189  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  37.06 
 
 
379 aa  187  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  37.15 
 
 
389 aa  185  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3371  rod shape-determining protein RodA  38.7 
 
 
384 aa  185  8e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2495  rod shape-determining protein RodA  42.41 
 
 
364 aa  185  8e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  38.2 
 
 
366 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  39.39 
 
 
380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  39.38 
 
 
382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3647  rod shape-determining protein RodA  37.74 
 
 
390 aa  183  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2957  rod shape-determining protein RodA  37.74 
 
 
390 aa  183  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.539996  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08400  rod shape-determining protein RodA  39.81 
 
 
382 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41497  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  40.06 
 
 
368 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  38.67 
 
 
368 aa  182  7e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  38.46 
 
 
362 aa  182  8.000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  40.07 
 
 
370 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  39.45 
 
 
368 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  42.45 
 
 
373 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  42.45 
 
 
373 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  39.09 
 
 
372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  35.93 
 
 
376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  37.04 
 
 
383 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  38.44 
 
 
379 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0316  rod shape-determining protein RodA  41.86 
 
 
366 aa  179  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  38.44 
 
 
379 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  39.82 
 
 
368 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  37.96 
 
 
374 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  39.33 
 
 
367 aa  179  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  41.61 
 
 
366 aa  178  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  38.2 
 
 
384 aa  178  9e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2710  rod shape-determining protein RodA  37.35 
 
 
361 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.217076  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  39.33 
 
 
367 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  39.33 
 
 
367 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  40.26 
 
 
368 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  40.26 
 
 
368 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  38.91 
 
 
371 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  40.26 
 
 
368 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  40.26 
 
 
368 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  40.43 
 
 
366 aa  177  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1546  rod shape-determining protein RodA  37.46 
 
 
381 aa  176  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.317218  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  35.67 
 
 
371 aa  176  4e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  38.3 
 
 
366 aa  176  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  38.84 
 
 
368 aa  176  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  39.02 
 
 
373 aa  176  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0846  rod shape-determining protein RodA  37.42 
 
 
386 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0813507 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  38.53 
 
 
370 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1270  rod shape-determining protein RodA  36.86 
 
 
402 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.681615  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1786  rod shape-determining protein RodA  36.47 
 
 
380 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1091  rod shape-determining protein RodA  39.13 
 
 
384 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  37 
 
 
370 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  37.31 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  37.31 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  37.31 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  37.31 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0941  rod shape-determining protein RodA  37.12 
 
 
384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  37.31 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  37.31 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  37.31 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  36.56 
 
 
373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  37.31 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  40.37 
 
 
368 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0079  putative rod shape-determining transmembrane protein  37.31 
 
 
385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  36.06 
 
 
374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0469  rod shape-determining protein RodA  36.01 
 
 
379 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  40.21 
 
 
366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  40.93 
 
 
366 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  36.78 
 
 
373 aa  172  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  37.61 
 
 
370 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  37.61 
 
 
370 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  37.61 
 
 
370 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  37.61 
 
 
370 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  37.61 
 
 
370 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  38.27 
 
 
369 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  37.31 
 
 
370 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  35.28 
 
 
380 aa  172  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  35.85 
 
 
382 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  37.15 
 
 
365 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6465  rod shape-determining protein RodA  35.22 
 
 
382 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.848347  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0496  rod shape-determining protein RodA  37.82 
 
 
366 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0674851  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  35.85 
 
 
382 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  35.85 
 
 
382 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  37.31 
 
 
370 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  37.31 
 
 
370 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>