More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12658 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_12658  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
263 aa  543  1e-154  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.325622  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1575  gamma-glutamyl kinase  39.37 
 
 
363 aa  189  4e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730383 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1101  gamma-glutamyl kinase  39.92 
 
 
362 aa  181  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0894  gamma-glutamyl kinase  39.29 
 
 
361 aa  179  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1096  gamma-glutamyl kinase  38.49 
 
 
362 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.510371  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1683  gamma-glutamyl kinase  38.34 
 
 
359 aa  171  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0321844  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1477  gamma-glutamyl kinase  37.5 
 
 
368 aa  168  6e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1864  gamma-glutamyl kinase  35.83 
 
 
362 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  36.9 
 
 
363 aa  166  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  37.5 
 
 
366 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1575  gamma-glutamyl kinase  36.96 
 
 
356 aa  156  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  35.69 
 
 
372 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1414  gamma-glutamyl kinase  36.96 
 
 
356 aa  155  7e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1645  glutamate 5-kinase  35.57 
 
 
266 aa  155  9e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  36.05 
 
 
370 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  36.19 
 
 
367 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  35 
 
 
367 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  35 
 
 
367 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  35 
 
 
367 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  35 
 
 
367 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  35 
 
 
367 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  35 
 
 
367 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  35 
 
 
367 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  35 
 
 
367 aa  151  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  35 
 
 
367 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  35 
 
 
367 aa  151  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  35 
 
 
367 aa  151  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  35 
 
 
367 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  35.57 
 
 
376 aa  150  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  35.52 
 
 
367 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  35 
 
 
367 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  35 
 
 
367 aa  151  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  36.4 
 
 
372 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  34.5 
 
 
393 aa  149  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1372  glutamate 5-kinase  35.88 
 
 
277 aa  149  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.388495  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1913  gamma-glutamyl kinase  35.71 
 
 
369 aa  148  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000486066  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  33.97 
 
 
374 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1649  glutamate 5-kinase  35.2 
 
 
393 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.287377  hitchhiker  0.000355488 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  34.11 
 
 
367 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3393  glutamate 5-kinase  34.73 
 
 
282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.495803  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  35.86 
 
 
378 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2603  glutamate 5-kinase  36.96 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2904  gamma-glutamyl kinase  33.71 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2583  gamma-glutamyl kinase  33.71 
 
 
269 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3420  gamma-glutamyl kinase  38.19 
 
 
384 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  33.86 
 
 
373 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  35.18 
 
 
367 aa  145  9e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1015  gamma-glutamyl kinase  34.39 
 
 
369 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379535  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0986  gamma-glutamyl kinase  34.39 
 
 
369 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  34.51 
 
 
372 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  36.65 
 
 
372 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  34.13 
 
 
376 aa  144  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  35.18 
 
 
371 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2877  gamma-glutamyl kinase  33.33 
 
 
272 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.518001  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1766  gamma-glutamyl kinase  33.95 
 
 
277 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000141606  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  33.73 
 
 
372 aa  143  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  36.47 
 
 
372 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  36.47 
 
 
372 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  36.47 
 
 
372 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  33.73 
 
 
374 aa  143  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2689  gamma-glutamyl kinase  35.6 
 
 
379 aa  142  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0068  gamma-glutamyl kinase  36.4 
 
 
368 aa  142  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  36.47 
 
 
372 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2280  glutamate 5-kinase  35.43 
 
 
382 aa  142  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.000593596 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  35.52 
 
 
377 aa  142  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  36.08 
 
 
372 aa  141  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  35.69 
 
 
372 aa  141  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  34.13 
 
 
376 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  35.69 
 
 
372 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  34.52 
 
 
373 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0283  gamma-glutamyl kinase  34.38 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  35.69 
 
 
372 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  34.9 
 
 
372 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1538  glutamate 5-kinase  35.8 
 
 
393 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419897  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2872  gamma-glutamyl kinase  34.92 
 
 
374 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  35.69 
 
 
372 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2010  glutamate 5-kinase  32.95 
 
 
382 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00026672  hitchhiker  0.000000000000558815 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  35.69 
 
 
372 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2208  glutamate 5-kinase  34 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  35.69 
 
 
394 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  35.69 
 
 
372 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  35.69 
 
 
372 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2388  gamma-glutamyl kinase  34.26 
 
 
390 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059895  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  35.18 
 
 
373 aa  140  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  32.94 
 
 
379 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  36.29 
 
 
378 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2016  gamma-glutamyl kinase  33.46 
 
 
374 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.131983  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  34.38 
 
 
373 aa  139  6e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  31.87 
 
 
373 aa  139  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  35.69 
 
 
372 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2501  glutamate 5-kinase  32.82 
 
 
369 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.330929  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  32.95 
 
 
369 aa  138  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  35.69 
 
 
372 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  36.08 
 
 
374 aa  139  7e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  35.38 
 
 
372 aa  138  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  34.6 
 
 
369 aa  138  8.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3431  glutamate 5-kinase  34.8 
 
 
253 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  34.51 
 
 
373 aa  138  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  33.2 
 
 
372 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  33.2 
 
 
372 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>