More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03410 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  55.6 
 
 		 565 aa  634    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1951  glutaminyl-tRNA synthetase  61.01 
 
 		 566 aa  713    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03410  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 555 aa  1155    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  57.38 
 
 		 565 aa  639    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  55.66 
 
 		 564 aa  645    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  58.59 
 
 		 562 aa  667    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  60.33 
 
 		 556 aa  670    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00970277  normal  0.785784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4241  glutaminyl-tRNA synthetase  61.33 
 
 		 564 aa  696    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2363  glutaminyl-tRNA synthetase  60.51 
 
 		 570 aa  686    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.621285 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6655  glutaminyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 583 aa  639    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204769  normal  0.445852 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  58.47 
 
 		 580 aa  658    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  56.52 
 
 		 563 aa  661    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  58.12 
 
 		 572 aa  668    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 		 553 aa  638    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  56.96 
 
 		 568 aa  657    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3486  glutaminyl-tRNA synthetase  56.39 
 
 		 565 aa  639    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  58.02 
 
 		 561 aa  671    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0242  glutaminyl-tRNA synthetase  61.98 
 
 		 555 aa  715    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1133  glutaminyl-tRNA synthetase  69.53 
 
 		 579 aa  857    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.613915  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 		 569 aa  657    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1012  glutaminyl-tRNA synthetase  70.81 
 
 		 705 aa  839    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  55.43 
 
 		 557 aa  634  1e-180  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  56.36 
 
 		 564 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 		 589 aa  634  1e-180  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 570 aa  634  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 		 554 aa  631  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  56.1 
 
 		 569 aa  631  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  56.02 
 
 		 568 aa  628  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  55.42 
 
 		 565 aa  630  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 		 555 aa  626  1e-178  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  53.53 
 
 		 587 aa  625  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  55.52 
 
 		 552 aa  625  1e-178  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  55.52 
 
 		 552 aa  627  1e-178  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  55.37 
 
 		 567 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 566 aa  622  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  55.01 
 
 		 567 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  54.97 
 
 		 556 aa  622  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  54.58 
 
 		 558 aa  624  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 		 556 aa  623  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  55.19 
 
 		 567 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 		 565 aa  619  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  55.52 
 
 		 555 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 		 555 aa  618  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  55.52 
 
 		 555 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  55.7 
 
 		 556 aa  620  1e-176  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  54.01 
 
 		 576 aa  619  1e-176  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  55.52 
 
 		 555 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  55.52 
 
 		 555 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  55.19 
 
 		 567 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 		 565 aa  615  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 		 555 aa  618  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 		 555 aa  617  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1902  glutaminyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 		 590 aa  616  1e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000991205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 		 555 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  54.59 
 
 		 552 aa  617  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 		 555 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  55.37 
 
 		 556 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 		 554 aa  612  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1205  glutaminyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 		 552 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  55.01 
 
 		 561 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  55.52 
 
 		 554 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 		 557 aa  612  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 552 aa  614  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 		 554 aa  610  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 		 554 aa  610  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 		 554 aa  610  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 		 554 aa  610  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4500  glutaminyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 		 563 aa  608  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23520  glutaminyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 		 555 aa  609  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01892  glutaminyl-tRNA synthetase  53.89 
 
 		 555 aa  609  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00449379  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  55.33 
 
 		 554 aa  610  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 		 554 aa  610  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2184  glutaminyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 558 aa  610  1e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 		 554 aa  610  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4882  glutaminyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 		 540 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 		 609 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1843  glutaminyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 559 aa  606  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311784  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 		 554 aa  605  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0682  glutaminyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 		 582 aa  606  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  normal  0.476969 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3294  glutaminyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 565 aa  606  9.999999999999999e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000133432  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3126  glutaminyl-tRNA synthetase  53.69 
 
 		 552 aa  606  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0016183  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  53.87 
 
 		 552 aa  607  9.999999999999999e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  54.61 
 
 		 548 aa  605  9.999999999999999e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  53.28 
 
 		 556 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2811  glutaminyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 		 561 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 558 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2841  glutaminyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 561 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 582 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  51.91 
 
 		 560 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1482  glutaminyl-tRNA synthetase  53.96 
 
 		 556 aa  600  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0492  glutaminyl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 553 aa  601  1e-170  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.607402 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0922  glutaminyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 		 559 aa  597  1e-169  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2452  glutaminyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 		 559 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930191  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0907  glutaminyl-tRNA synthetase  52.43 
 
 		 573 aa  595  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47238  normal  0.116742 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1845  glutaminyl-tRNA synthetase  53.76 
 
 		 559 aa  598  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1270  glutaminyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 		 551 aa  593  1e-168  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1269  glutaminyl-tRNA synthetase  51 
 
 		 551 aa  592  1e-168  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3475  glutaminyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 580 aa  594  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.675011  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2669  glutaminyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 		 556 aa  593  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0864702  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 		 556 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0137132  hitchhiker  0.0018216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>