64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3551 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3551  HCOMODA decarboxylase (CmtD)  100 
 
 		 244 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161109  normal  0.205223 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2893  class II aldolase/adducin family protein  76.35 
 
 		 243 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.582162 
 
 
-
 
NC_003296  RS01660  decarboxylase protein  54.09 
 
 		 222 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.552729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1062  class II aldolase/adducin family protein  36.19 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138135  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6491  putative class II aldolase/adducin-like protein  27.91 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.800795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2138  class II aldolase/adducin family protein  30.48 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4371  class II aldolase/adducin-like  32.04 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  32.17 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02740  class II aldolase/adducin domain protein  32.17 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0288967 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1000  class II aldolase/adducin domain protein  30.08 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1007  class II aldolase/adducin domain protein  30.08 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1161  class II aldolase/adducin domain protein  30.08 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0868  class II aldolase/adducin domain protein  31.82 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0957  class II aldolase/adducin domain protein  31.82 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0280  class II aldolase/adducin domain protein  31.82 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.594918  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1957  class II aldolase/adducin domain protein  31.82 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4893  class II aldolase/adducin domain protein  31.36 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0507067 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5443  class II aldolase/adducin domain protein  31.36 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00180883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  26.43 
 
 		 253 aa  52  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5614  class II aldolase/adducin domain protein  30.51 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0752724  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4349  class II aldolase/adducin family protein  30.39 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1369  class II aldolase/adducin family protein  26.67 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5245  class II aldolase/adducin domain protein  30.51 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0804  class II aldolase/adducin domain protein  30.43 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.864607  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0077  class II aldolase/adducin domain protein  30.51 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0421444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4438  class II aldolase/adducin domain protein  26.96 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4614  class II aldolase/adducin domain protein  30.51 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100188  hitchhiker  0.00381472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4135  class II aldolase/adducin family protein  27.78 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  23.97 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1308  class II aldolase/adducin domain protein  28.45 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0451  class II aldolase/adducin domain protein  29.63 
 
 		 261 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1547  hypothetical protein  27.5 
 
 		 274 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4708  class II aldolase/adducin-like  25.79 
 
 		 247 aa  48.9  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  24.89 
 
 		 259 aa  48.9  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2684  class II aldolase/adducin family protein  26.13 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  0.449845 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0882  class II aldolase/adducin domain protein  29.09 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  28.73 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2887  class II aldolase/adducin family protein  31.22 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3705  class II aldolase/adducin domain protein  29.57 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.993154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2037  class II aldolase/adducin domain protein  29.57 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1569  class II aldolase/adducin domain protein  29.57 
 
 		 260 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0283  class II aldolase/adducin domain protein  28.07 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.711177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5234  hypothetical protein  25.85 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379746  normal  0.233824 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3224  aldolase II superfamily protein  27.14 
 
 		 264 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4108  class II aldolase/adducin domain protein  25.32 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4368  class II aldolase/adducin family protein  28.25 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.5996  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3215  class II aldolase/adducin family protein  25.68 
 
 		 216 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.549465  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0523  L-fuculose-phosphate aldolase  26.94 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  27.27 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0849  hypothetical protein  27.43 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  25.7 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2516  hypothetical protein  26.82 
 
 		 326 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  26.46 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4303  class II aldolase/adducin domain protein  28.18 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3663  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.27 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  25.34 
 
 		 282 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  25.34 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  23.71 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  23.28 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  26.7 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  25 
 
 		 298 aa  43.1  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.943174 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  22.88 
 
 		 271 aa  43.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2487  class II aldolase/adducin domain protein  26.7 
 
 		 271 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0255579  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2271  class II aldolase/adducin-like  27.5 
 
 		 197 aa  42  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.453989  hitchhiker  0.000307852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>