15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3023 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3023  hypothetical protein  100 
 
 
827 aa  1722    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.279445 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5198  hypothetical protein  25.35 
 
 
776 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0389721  normal  0.380084 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  23.89 
 
 
776 aa  73.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5203  hypothetical protein  35.4 
 
 
359 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02037  hypothetical protein  38.79 
 
 
751 aa  64.7  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.909171  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  34.33 
 
 
743 aa  59.3  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  33.06 
 
 
989 aa  55.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3426  hypothetical protein  29.41 
 
 
425 aa  52  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  31.18 
 
 
964 aa  52  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  32.97 
 
 
1054 aa  52  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3251  hypothetical protein  30.57 
 
 
931 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.09086  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3253  hypothetical protein  30.48 
 
 
889 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0734  M23 peptidase domain-containing protein  28.79 
 
 
740 aa  46.6  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6125  peptidase M23B  31.58 
 
 
746 aa  45.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0146574  normal  0.37839 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  29.66 
 
 
875 aa  45.4  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>