58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1385 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1385  putative extracellular nuclease  100 
 
 		 751 aa  1489    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14292  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2428  hypothetical protein  36.52 
 
 		 302 aa  145  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0451472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  32.4 
 
 		 692 aa  114  9e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  47.75 
 
 		 1838 aa  95.1  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  33.33 
 
 		 4697 aa  93.2  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  41.86 
 
 		 1933 aa  86.7  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5589  hypothetical protein  24.59 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5110  SdiA-regulated  25.41 
 
 		 326 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48290  hypothetical protein  27.73 
 
 		 305 aa  73.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5290  hypothetical protein  26.83 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.842454  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  37.11 
 
 		 2796 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.82 
 
 		 1372 aa  66.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4848  SdiA-regulated  25.1 
 
 		 317 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4229  SdiA-regulated domain-containing protein  25.83 
 
 		 317 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.57 
 
 		 2346 aa  62.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.12 
 
 		 1052 aa  60.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.95 
 
 		 3977 aa  58.2  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  31.48 
 
 		 2852 aa  58.2  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04270  putative transcriptional regulator  24.3 
 
 		 321 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.510674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  34.59 
 
 		 3089 aa  55.5  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4227  SdiA-regulated domain-containing protein  25.3 
 
 		 303 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3272  SdiA-regulated protein  23.71 
 
 		 325 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  31.49 
 
 		 1590 aa  55.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5204  SdiA-regulated domain-containing protein  23.23 
 
 		 300 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5151  SdiA-regulated domain protein  23.23 
 
 		 300 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.965879  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0314  SdiA-regulated domain-containing protein  22.13 
 
 		 303 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0418  hypothetical protein  24.9 
 
 		 321 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  31.9 
 
 		 1587 aa  54.3  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5058  SdiA-regulated domain-containing protein  23.23 
 
 		 300 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0993064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07110  hypothetical protein  30.71 
 
 		 317 aa  53.5  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187526  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5383  SdiA-regulated  23.36 
 
 		 305 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02449 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  25.66 
 
 		 4379 aa  53.1  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22840  SdiA-regulated domain-containing protein  23.89 
 
 		 308 aa  52.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0239521  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4933  hypothetical protein  19.33 
 
 		 323 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  26.12 
 
 		 2839 aa  50.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  38.39 
 
 		 685 aa  50.4  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04165  hypothetical protein  19.33 
 
 		 322 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00151161  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04202  hypothetical protein  19.33 
 
 		 322 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38420  hypothetical protein  24.6 
 
 		 309 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224716 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3663  SdiA-regulated domain protein  19.33 
 
 		 323 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000154748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3731  SdiA-regulated domain-containing protein  18.91 
 
 		 286 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00663861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4772  conserved hypothetical protein yjiK  18.91 
 
 		 323 aa  49.3  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5082  sdiA-regulated domain protein  22.53 
 
 		 272 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.142061 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31 
 
 		 1284 aa  48.5  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2154  peptidase C11 clostripain  28.78 
 
 		 766 aa  48.9  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.372371  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  20.58 
 
 		 3320 aa  47  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0412  putatitve transcriptional regulator  23.36 
 
 		 310 aa  47.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  30.56 
 
 		 693 aa  47  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04160  putatitve transcriptional regulator  22.95 
 
 		 329 aa  47.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2427  hypothetical protein  28.95 
 
 		 231 aa  47.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0532981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4878  SdiA-regulated protein  20.17 
 
 		 329 aa  46.6  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.60346 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  38.53 
 
 		 767 aa  46.2  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  30.15 
 
 		 1289 aa  46.2  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  30.22 
 
 		 1627 aa  45.8  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1341  hypothetical protein  26.23 
 
 		 967 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.274019  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4561  hypothetical protein  18.49 
 
 		 323 aa  45.4  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2866  hypothetical protein  30.25 
 
 		 277 aa  45.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  35.79 
 
 		 16311 aa  44.7  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>