More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4925 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007949  Bpro_4925  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
409 aa  827    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1956  glycosyl transferase group 1  57.28 
 
 
443 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3818  glycosyl transferase group 1  56.1 
 
 
413 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0700  glycosyltransferase  53.64 
 
 
407 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2355  glycosyl transferase, group 1  53.88 
 
 
407 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.359383  normal  0.146668 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0530  glycosyl transferase, group 1  54.17 
 
 
407 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.307998 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1254  glycosyl transferase group 1  48.04 
 
 
413 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0559  glycosyl transferase, group 1  46.9 
 
 
420 aa  386  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.34709 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1625  glycosyltransferase  48.79 
 
 
407 aa  382  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764414  normal  0.185019 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2318  glycosyl transferase, group 1  47.07 
 
 
406 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0552  glycosyl transferase, group 1  48.88 
 
 
455 aa  372  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410076  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1066  glycosyl transferase, group 1  49.13 
 
 
453 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1739  glycosyl transferase, group 1  49.12 
 
 
402 aa  369  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1873  glycosyl transferase group 1  47.2 
 
 
428 aa  360  2e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113427  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1803  glycosyl transferase, group 1  48.54 
 
 
405 aa  358  9e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2591  glycosyl transferase group 1  47.73 
 
 
410 aa  356  5e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0447  hypothetical protein  46.96 
 
 
412 aa  354  2e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.607814  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3962  glycosyl transferase group 1  46.08 
 
 
411 aa  351  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114116  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0629  glycosyl transferase group 1  47.99 
 
 
408 aa  345  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21031  glycosyltransferase  40 
 
 
407 aa  341  2e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0219  putative glycosyltransferase  44.33 
 
 
415 aa  338  9.999999999999999e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0078  glycosyl transferase, group 1  41.26 
 
 
432 aa  320  3e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.938289  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1248  glycosyl transferase group 1  43.72 
 
 
405 aa  318  9e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4715  glycosyl transferase group 1  45.26 
 
 
415 aa  318  9e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0188107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3088  glycosyl transferase, group 1  41.86 
 
 
402 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.708464  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2766  putative glycosyltransferase  43.44 
 
 
437 aa  317  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1356  glycosyl transferase, group 1  41.1 
 
 
423 aa  315  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.699846  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4003  glycosyl transferase, group 1  40.93 
 
 
406 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01271  glycosyltransferase  43.46 
 
 
385 aa  300  4e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3439  glycosyl transferase group 1  42.75 
 
 
406 aa  295  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0503  glycosyl transferase group 1  39.51 
 
 
403 aa  294  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0365  hypothetical protein  45.51 
 
 
369 aa  288  9e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309757  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1893  glycosyl transferase, group 1  41.85 
 
 
460 aa  285  7e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2888  glycosyl transferase group 1  44.68 
 
 
425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378477  normal  0.0208188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2376  glycosyl transferase group 1  42.23 
 
 
412 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3858  glycosyl transferase, group 1  39.41 
 
 
417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2683  glycosyl transferase group 1  42.05 
 
 
412 aa  273  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0578  glycosyl transferase, group 1  42.56 
 
 
518 aa  272  6e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.941896  normal  0.221198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2461  glycosyl transferase group 1  44.51 
 
 
390 aa  253  6e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0109  glycosyltransferase  36.18 
 
 
401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.927996  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0111  glycosyltransferase  33.42 
 
 
401 aa  209  5e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451915  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0638  glycosyl transferase group 1  33.08 
 
 
406 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01261  hypothetical protein  28.61 
 
 
412 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4431  glycosyl transferase group 1  53.64 
 
 
188 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4495  glycosyl transferase group 1  53.64 
 
 
188 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0991  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.55 
 
 
421 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
407 aa  73.6  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
416 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 
406 aa  70.1  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0299  glycosyl transferase, group 1  22.49 
 
 
384 aa  69.7  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120418  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2061  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
418 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  32.27 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 
439 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  22.83 
 
 
419 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
410 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 
450 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 
392 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3803  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
406 aa  63.9  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.551552 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 
360 aa  64.3  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  22.88 
 
 
410 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  22.75 
 
 
536 aa  63.9  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 
395 aa  63.2  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0851  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 
416 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  24.54 
 
 
426 aa  62.4  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  32.29 
 
 
426 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
426 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 
417 aa  61.6  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0185  glycosyl transferase, group 1  37.86 
 
 
385 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.634207 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  27.41 
 
 
396 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 
406 aa  60.8  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
371 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 
370 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 
413 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  25.11 
 
 
385 aa  60.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  28.57 
 
 
427 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1527  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
384 aa  60.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.161562  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.39 
 
 
365 aa  60.1  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
393 aa  59.7  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 
377 aa  59.7  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
414 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  21.92 
 
 
359 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.56 
 
 
402 aa  59.7  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  28.43 
 
 
414 aa  59.3  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 
405 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
387 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  26.43 
 
 
745 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07315  glycosyltransferase  21.9 
 
 
377 aa  58.9  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.160223  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  24.88 
 
 
446 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 
357 aa  58.9  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 
401 aa  58.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
414 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
415 aa  57.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 
377 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  22.62 
 
 
385 aa  57.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
376 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  20.57 
 
 
420 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 
375 aa  57.4  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 
415 aa  57.4  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  25.11 
 
 
411 aa  57.4  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>