54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3305 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3305  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  553  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1370  hypothetical protein  67.55 
 
 		 278 aa  341  8e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2767  hypothetical protein  59.85 
 
 		 272 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2153  hypothetical protein  59.85 
 
 		 272 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6097  hypothetical protein  58.65 
 
 		 271 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.592335 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3926  hypothetical protein  54.31 
 
 		 275 aa  286  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0314  hypothetical protein  55.51 
 
 		 267 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4186  hypothetical protein  55.47 
 
 		 267 aa  281  6.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0938  hypothetical protein  55.02 
 
 		 271 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.867884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0795  hypothetical protein  55.02 
 
 		 271 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.985574  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0426  hypothetical protein  55.64 
 
 		 273 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.812935  normal  0.569744 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2819  hypothetical protein  57.52 
 
 		 272 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2686  hypothetical protein  57.14 
 
 		 272 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.209191 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3993  hypothetical protein  51.53 
 
 		 266 aa  261  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0302  hypothetical protein  55.51 
 
 		 267 aa  257  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2754  hypothetical protein  57.81 
 
 		 269 aa  244  8e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0925  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  52.83 
 
 		 266 aa  236  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1325  hypothetical protein  50.39 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0146355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3985  hypothetical protein  48.29 
 
 		 264 aa  225  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.927066  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2240  hypothetical protein  39.48 
 
 		 294 aa  186  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0474  hypothetical protein  38.72 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.985859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0261  hypothetical protein  41.77 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02882  hypothetical protein  42.31 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1246  hypothetical protein  37.62 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1216  hypothetical protein  37.62 
 
 		 259 aa  119  6e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0441  hypothetical protein  35.06 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4376  hypothetical protein  30.43 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.464948 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3886  hypothetical protein  30.36 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.707997  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5091  hypothetical protein  30.92 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0439  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.855778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0888  hypothetical protein  33.55 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3509  hypothetical protein  32.03 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.243823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4594  hypothetical protein  27.16 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000322165 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1160  hypothetical protein  38.95 
 
 		 225 aa  54.7  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000752472  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0327  hypothetical protein  31.58 
 
 		 238 aa  52.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0109  hypothetical protein  26.27 
 
 		 250 aa  52.4  0.000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3925  hypothetical protein  28 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3674  hypothetical protein  26.02 
 
 		 245 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0654839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0352  hypothetical protein  26.02 
 
 		 245 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2171  hypothetical protein  29.3 
 
 		 222 aa  49.7  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3884  hypothetical protein  29.53 
 
 		 240 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0344  hypothetical protein  25.77 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3377  hypothetical protein  27.67 
 
 		 227 aa  47  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2748  hypothetical protein  31.25 
 
 		 237 aa  45.8  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3873  hypothetical protein  29.87 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.451161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0926  hypothetical protein  35.71 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4797  beta-ketoacyl synthase domain protein  33.62 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0349  hypothetical protein  25.26 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.849457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0346  hypothetical protein  25 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00594188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0354  hypothetical protein  26.21 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0689  hypothetical protein  33.86 
 
 		 234 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004062  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  26.35 
 
 		 242 aa  43.5  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0352  hypothetical protein  25.26 
 
 		 244 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000422268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0342  hypothetical protein  25.26 
 
 		 244 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>