28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2642 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2642  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  449  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1509  hypothetical protein  32.64 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.473574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4274  hypothetical protein  32.32 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.373723 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0259  hypothetical protein  32.31 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4588  hypothetical protein  26.25 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0596  hypothetical protein  34.62 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0292  hypothetical protein  33.09 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2232  hypothetical protein  26.7 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.762787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2170  hypothetical protein  26.7 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0817  hypothetical protein  33.94 
 
 		 467 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00165108  unclonable  0.0000072103 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2117  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00801725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2117  hypothetical protein  30.77 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0310585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12631  hypothetical protein  22.11 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2919  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 597 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1295  hypothetical protein  29.63 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2186  hypothetical protein  28.1 
 
 		 249 aa  53.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.576025 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2678  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 480 aa  52  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 503 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02816  TPR domain protein  24.5 
 
 		 604 aa  49.7  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.36083  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18241  hypothetical protein  24.39 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.10096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1296  hypothetical protein  32.76 
 
 		 231 aa  48.9  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.482431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0738  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00463376  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0490  hypothetical protein  34.31 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1883  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 457 aa  45.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00380027  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1811  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 596 aa  44.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.541585  normal  0.135887 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1253  hypothetical protein  27.01 
 
 		 593 aa  42.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.177752  unclonable  0.0000127054 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6246  hypothetical protein  25.81 
 
 		 230 aa  42.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.300943  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>