More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2256 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2256  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 233 aa  462  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  0.407318 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2202  phosphate uptake regulator, PhoU  91.42 
 
 		 234 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2315  phosphate uptake regulator, PhoU  83.69 
 
 		 233 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0579  phosphate uptake regulator, PhoU  82.4 
 
 		 233 aa  391  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2630  phosphate uptake regulator, PhoU  82.33 
 
 		 233 aa  391  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608204  normal  0.109033 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1289  phosphate uptake regulator, PhoU  81.47 
 
 		 233 aa  384  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.498595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2368  phosphate uptake regulator, PhoU  80.17 
 
 		 233 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1490  phosphate uptake regulator, PhoU  79.74 
 
 		 233 aa  377  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4914  phosphate uptake regulator, PhoU  80.17 
 
 		 233 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24576 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2810  phosphate uptake regulator, PhoU  69.53 
 
 		 234 aa  331  7.000000000000001e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1276  phosphate uptake regulator, PhoU  67.66 
 
 		 235 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1658  phosphate uptake regulator, PhoU  67.95 
 
 		 235 aa  322  3e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2163  phosphate uptake regulator, PhoU  63.76 
 
 		 234 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125702  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1270  phosphate uptake regulator, PhoU  64.19 
 
 		 234 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482464  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2854  phosphate uptake regulator, PhoU  63.32 
 
 		 234 aa  299  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2016  phosphate uptake regulator, PhoU  63.32 
 
 		 234 aa  299  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.83984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2181  phosphate uptake regulator PhoU  62.01 
 
 		 234 aa  298  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1181  phosphate uptake regulator, PhoU  62.88 
 
 		 234 aa  297  8e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449533  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1193  phosphate uptake regulator, PhoU  62.88 
 
 		 234 aa  297  8e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.132592  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2769  phosphate transport system regulatory protein PhoU  62.45 
 
 		 234 aa  296  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.338608  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1275  phosphate uptake regulator, PhoU  62.88 
 
 		 234 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0823  phosphate uptake regulator, PhoU  62.88 
 
 		 234 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1304  phosphate uptake regulator, PhoU  62.88 
 
 		 234 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0784  phosphate transport system regulatory protein PhoU  62.83 
 
 		 234 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1489  phosphate transport system regulatory protein PhoU  62.83 
 
 		 234 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1622  phosphate transport system regulatory protein PhoU  62.83 
 
 		 234 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1295  phosphate transport system regulatory protein PhoU  62.83 
 
 		 234 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.617631  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1519  phosphate transport system regulatory protein PhoU  62.83 
 
 		 234 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0578  phosphate transport system regulatory protein PhoU  62.83 
 
 		 234 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0573  phosphate transport system regulatory protein PhoU  62.83 
 
 		 234 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1533  phosphate transporter PhoU  62.07 
 
 		 235 aa  294  8e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0886  phosphate uptake regulator, PhoU  62.45 
 
 		 234 aa  294  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257388  normal  0.0383148 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4447  phosphate uptake regulator, PhoU  62.01 
 
 		 234 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1714  phosphate uptake regulator, PhoU  60.34 
 
 		 237 aa  288  6e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0605857  normal  0.609426 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2022  phosphate uptake regulator, PhoU  59.91 
 
 		 237 aa  286  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1598  phosphate uptake regulator, PhoU  59.91 
 
 		 235 aa  277  9e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1148  phosphate uptake regulator, PhoU  55.7 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0480407 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7239  phosphate uptake regulator, PhoU  48.03 
 
 		 235 aa  238  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal  0.639643 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  52.36 
 
 		 233 aa  238  8e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  50.45 
 
 		 229 aa  231  7.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  50.45 
 
 		 235 aa  231  7.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  48.47 
 
 		 235 aa  229  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  49.57 
 
 		 236 aa  222  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1541  transcriptional regulator PhoU  48.48 
 
 		 236 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1536  transcriptional regulator PhoU  48.48 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.726746  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1569  transcriptional regulator PhoU  48.48 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289815  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2815  transcriptional regulator PhoU  48.48 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  47.39 
 
 		 236 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1437  transcriptional regulator PhoU  47.62 
 
 		 236 aa  215  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2557  transcriptional regulator PhoU  47.41 
 
 		 236 aa  215  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2624  transcriptional regulator PhoU  47.41 
 
 		 236 aa  215  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2731  transcriptional regulator PhoU  47.41 
 
 		 236 aa  215  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2448  phosphate transport system protein PhoU  46.96 
 
 		 242 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71201  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1726  transcriptional regulator PhoU  46.98 
 
 		 236 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  48.28 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1360  transcriptional regulator PhoU  46.93 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3165  transcriptional regulator PhoU  47.58 
 
 		 236 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  45.92 
 
 		 237 aa  211  9e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  45.92 
 
 		 237 aa  211  9e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  44.81 
 
 		 240 aa  209  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1701  transcriptional regulator PhoU  46.98 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1504  transcriptional regulator PhoU  46.26 
 
 		 236 aa  209  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.682781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  47.14 
 
 		 241 aa  208  7e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2742  transcriptional regulator PhoU  46.49 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.498773  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  47.37 
 
 		 243 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  43.17 
 
 		 241 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  45.02 
 
 		 253 aa  205  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03608  negative regulator of PhoR/PhoB two-component regulator  47.14 
 
 		 241 aa  204  7e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4243  phosphate uptake regulator, PhoU  47.14 
 
 		 241 aa  204  7e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4204  transcriptional regulator PhoU  47.14 
 
 		 241 aa  204  7e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03552  hypothetical protein  47.14 
 
 		 241 aa  204  7e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3939  transcriptional regulator PhoU  47.14 
 
 		 241 aa  204  7e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5153  transcriptional regulator PhoU  47.14 
 
 		 241 aa  204  7e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.543817 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4235  transcriptional regulator PhoU  47.14 
 
 		 241 aa  204  7e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4270  transcriptional regulator PhoU  47.14 
 
 		 241 aa  204  7e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4088  transcriptional regulator PhoU  47.14 
 
 		 241 aa  204  7e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  46.7 
 
 		 241 aa  204  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  46.7 
 
 		 241 aa  204  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  46.7 
 
 		 241 aa  204  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  46.7 
 
 		 241 aa  204  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  46.7 
 
 		 241 aa  204  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  46.09 
 
 		 236 aa  204  9e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  46.93 
 
 		 238 aa  204  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  45.02 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  46.93 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  46.93 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  47.37 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  46.93 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1138  phosphate uptake regulator, PhoU  44.44 
 
 		 240 aa  201  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  45.02 
 
 		 253 aa  201  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  45.22 
 
 		 232 aa  201  8e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  44.16 
 
 		 256 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  44.16 
 
 		 256 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  44.16 
 
 		 256 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  46.7 
 
 		 244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  43.72 
 
 		 256 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  45.22 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  43.48 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  45.29 
 
 		 247 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  46.7 
 
 		 242 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>