More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2128 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  100 
 
 
397 aa  813    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  44.23 
 
 
396 aa  302  8.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.511935 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  44.88 
 
 
400 aa  301  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  43.53 
 
 
402 aa  296  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  44.47 
 
 
402 aa  295  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  41.64 
 
 
397 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  41.64 
 
 
397 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  41.64 
 
 
397 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  41.64 
 
 
397 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  41.64 
 
 
397 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  41.64 
 
 
397 aa  293  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  42.98 
 
 
400 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  42.16 
 
 
402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  43.13 
 
 
427 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  42.15 
 
 
402 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  41.87 
 
 
402 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  42.54 
 
 
401 aa  276  6e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  41.9 
 
 
402 aa  276  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5805  salicylate hydroxylase  42.7 
 
 
403 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  39.38 
 
 
413 aa  270  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  41.9 
 
 
404 aa  270  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  40.69 
 
 
401 aa  268  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  40.53 
 
 
414 aa  263  6e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  41.27 
 
 
421 aa  257  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  39.62 
 
 
416 aa  250  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  40 
 
 
397 aa  248  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  37.84 
 
 
425 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  37.1 
 
 
402 aa  246  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  38.68 
 
 
395 aa  240  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  38.82 
 
 
395 aa  239  8e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  39.35 
 
 
412 aa  238  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  37 
 
 
398 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  36.84 
 
 
398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  38.97 
 
 
399 aa  233  5e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1067  monooxygenase FAD-binding  38.27 
 
 
414 aa  233  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265786  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1146  monooxygenase, FAD-binding  38.27 
 
 
414 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263204  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  36.93 
 
 
400 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  38.52 
 
 
395 aa  231  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1445  monooxygenase FAD-binding  38.58 
 
 
394 aa  230  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  40 
 
 
430 aa  229  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  37.47 
 
 
396 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  38.15 
 
 
404 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  34.76 
 
 
400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1345  monooxygenase, FAD-binding  35.95 
 
 
444 aa  223  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  38.06 
 
 
397 aa  222  9e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  37.82 
 
 
389 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  35.73 
 
 
395 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  36.72 
 
 
412 aa  219  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  36.99 
 
 
412 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  35.28 
 
 
403 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  34.97 
 
 
399 aa  206  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7505  monooxygenase FAD-binding  37.7 
 
 
407 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  37.85 
 
 
399 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6758  monooxygenase FAD-binding  38.68 
 
 
406 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242699  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  39.48 
 
 
400 aa  201  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  36.54 
 
 
385 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  33.78 
 
 
391 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  38.05 
 
 
387 aa  193  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2546  salicylate hydroxylase  33.93 
 
 
408 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3920  monooxygenase FAD-binding  36.36 
 
 
397 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0746  salicylate hydroxylase  34.44 
 
 
401 aa  187  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  36.56 
 
 
386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0740  salicylate hydroxylase  34.18 
 
 
401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  35.24 
 
 
402 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  32.3 
 
 
384 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1762  monooxygenase FAD-binding  32.82 
 
 
384 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.638414  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  37.05 
 
 
373 aa  179  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  34.48 
 
 
377 aa  179  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  33.52 
 
 
426 aa  177  4e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  35.65 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  36.08 
 
 
389 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  33.52 
 
 
411 aa  173  3.9999999999999995e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  32.53 
 
 
420 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  33.16 
 
 
406 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  32.2 
 
 
385 aa  169  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  33.94 
 
 
383 aa  169  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  30.77 
 
 
413 aa  168  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  34.83 
 
 
382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  31.9 
 
 
385 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  31.9 
 
 
385 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  34.53 
 
 
382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  31.6 
 
 
385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  32.9 
 
 
421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  35.65 
 
 
384 aa  165  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  31.4 
 
 
378 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  33.03 
 
 
382 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  36.09 
 
 
381 aa  163  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0871  salicylate hydroxylase  28 
 
 
422 aa  162  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457769  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  34.06 
 
 
390 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  34.6 
 
 
391 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  34.6 
 
 
391 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07684  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01680)  31.77 
 
 
506 aa  159  9e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  32.42 
 
 
385 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  32.42 
 
 
386 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  31.43 
 
 
404 aa  157  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  35.33 
 
 
395 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  33 
 
 
373 aa  155  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  31.82 
 
 
385 aa  154  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30.31 
 
 
447 aa  150  3e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  33.04 
 
 
389 aa  149  8e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>