More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2049 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5594  acetate/CoA ligase  68.75 
 
 		 658 aa  975    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3063  acetate--CoA ligase  73.08 
 
 		 658 aa  1022    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3218  acetate--CoA ligase  78.13 
 
 		 664 aa  1107    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  54.09 
 
 		 656 aa  717    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3835  acetyl-CoA synthetase  51.93 
 
 		 652 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.415539  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5151  acetyl-CoA synthetase  74.44 
 
 		 664 aa  1047    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  76.75 
 
 		 660 aa  1065    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1938  acetyl-CoA synthetase  74.36 
 
 		 660 aa  1047    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1708  acetyl-CoA synthetase  53 
 
 		 657 aa  696    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.224049  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2691  acetyl-CoA synthetase  52.4 
 
 		 649 aa  639    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.217498  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  53.77 
 
 		 644 aa  654    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2562  acetyl-CoA synthetase  52.21 
 
 		 649 aa  644    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.732738  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  75.08 
 
 		 660 aa  1053    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5891  acetyl-CoA synthetase  75.04 
 
 		 664 aa  1061    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  50.53 
 
 		 660 aa  682    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  73.72 
 
 		 654 aa  1011    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  51.13 
 
 		 656 aa  650    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  56.3 
 
 		 658 aa  730    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  76.6 
 
 		 660 aa  1073    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  71.08 
 
 		 655 aa  945    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  56.15 
 
 		 658 aa  724    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  55.07 
 
 		 657 aa  721    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  75.08 
 
 		 660 aa  1053    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  59.94 
 
 		 657 aa  803    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  50.75 
 
 		 654 aa  645    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1761  acetate--CoA ligase  70.12 
 
 		 660 aa  957    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  75.08 
 
 		 657 aa  1050    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  75.99 
 
 		 660 aa  1057    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  51.66 
 
 		 667 aa  649    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  56.17 
 
 		 673 aa  736    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  50.08 
 
 		 666 aa  646    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  56.78 
 
 		 657 aa  734    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  54.46 
 
 		 661 aa  687    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  61.7 
 
 		 653 aa  823    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  54.75 
 
 		 651 aa  721    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  51.44 
 
 		 660 aa  680    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  56.36 
 
 		 656 aa  755    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  53.1 
 
 		 646 aa  649    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  74.77 
 
 		 660 aa  1051    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  75.08 
 
 		 660 aa  1053    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  75.08 
 
 		 660 aa  1053    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  53.02 
 
 		 654 aa  648    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  51.9 
 
 		 649 aa  657    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03257  acetyl-CoA synthetase  52.84 
 
 		 647 aa  654    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2581  acetate--CoA ligase  81.48 
 
 		 665 aa  1154    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.322874  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5598  acetyl-CoA synthetase  52.84 
 
 		 648 aa  642    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.438623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2216  acetyl-CoA synthetase  75.53 
 
 		 660 aa  1050    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  67.68 
 
 		 654 aa  919    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2049  acetyl-coenzyme A synthetase  100 
 
 		 665 aa  1375    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0296505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1862  acetyl-coenzyme A synthetase  71.16 
 
 		 658 aa  983    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  73.48 
 
 		 660 aa  1037    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  54.89 
 
 		 658 aa  738    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2109  acetyl-CoA synthetase  76.29 
 
 		 660 aa  1040    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1889  acetyl-CoA synthetase  52.84 
 
 		 657 aa  689    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  52.36 
 
 		 649 aa  637    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1385  acetyl-coenzyme A synthetase  73.26 
 
 		 633 aa  997    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  50.68 
 
 		 660 aa  673    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  75.84 
 
 		 660 aa  1061    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  55.17 
 
 		 652 aa  715    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  54.24 
 
 		 655 aa  672    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  75.08 
 
 		 660 aa  1053    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  52.13 
 
 		 645 aa  645    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  74.74 
 
 		 664 aa  1050    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  75.38 
 
 		 660 aa  1048    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2747  acetate--CoA ligase  78.95 
 
 		 666 aa  1114    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  53.92 
 
 		 644 aa  650    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1399  acetate--CoA ligase  51.58 
 
 		 653 aa  635    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570682  normal  0.412853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2494  acetyl-CoA synthetase  52.84 
 
 		 649 aa  650    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.274585 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  53.73 
 
 		 655 aa  707    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1479  acetyl-CoA synthetase  52.36 
 
 		 651 aa  637    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.341037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1331  acetate--CoA ligase  51.29 
 
 		 647 aa  637    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000184836 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  51.9 
 
 		 645 aa  641    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  51.27 
 
 		 660 aa  642    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1416  acetyl-CoA synthetase  73.18 
 
 		 660 aa  1036    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280293  normal  0.0852056 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  76.44 
 
 		 660 aa  1065    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  75.04 
 
 		 664 aa  1061    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0297  acetyl-CoA synthetase  54.33 
 
 		 652 aa  646    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.447688  hitchhiker  0.000249841 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2099  acetyl-CoA synthetase  77.2 
 
 		 660 aa  1074    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478226  normal  0.645954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3921  acetyl-CoA synthetase  51.93 
 
 		 652 aa  646    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1085  acetyl-CoA synthetase  76.29 
 
 		 660 aa  1047    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  75.38 
 
 		 660 aa  1048    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  74.74 
 
 		 664 aa  1050    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1522  acetyl-CoA synthetase  53.15 
 
 		 657 aa  698    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  51.77 
 
 		 650 aa  642    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  75.08 
 
 		 660 aa  1053    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  51.45 
 
 		 644 aa  635    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5976  acetyl-CoA synthetase  75.15 
 
 		 680 aa  1033    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0371909 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  52.25 
 
 		 657 aa  639    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  50.3 
 
 		 667 aa  652    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  75.08 
 
 		 660 aa  1053    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  50.98 
 
 		 660 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  56.61 
 
 		 658 aa  744    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2079  acetyl-CoA synthetase  52.16 
 
 		 650 aa  647    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3947  acetyl-CoA synthetase  52.23 
 
 		 652 aa  649    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.903736  normal  0.891151 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3120  acetate--CoA ligase  51.45 
 
 		 649 aa  641    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  50.97 
 
 		 661 aa  640    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0756  acetate--CoA ligase  74.48 
 
 		 634 aa  993    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  52.87 
 
 		 661 aa  652    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1499  acetyl-coenzyme A synthetase  82.35 
 
 		 664 aa  1155    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11302 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2880  acetate--CoA ligase  89.17 
 
 		 664 aa  1255    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287628  normal  0.570573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>