25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0461 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0461  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  720    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0315  hypothetical protein  83.24 
 
 		 352 aa  570  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.392755 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1870  hypothetical protein  69.14 
 
 		 347 aa  457  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5075  hypothetical protein  71.64 
 
 		 352 aa  452  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3145  hypothetical protein  71.64 
 
 		 386 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3872  hypothetical protein  69.38 
 
 		 386 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4487  hypothetical protein  69.89 
 
 		 376 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073446 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0542  hypothetical protein  61.67 
 
 		 374 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884235 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0769  hypothetical protein  53.24 
 
 		 351 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3936  hypothetical protein  40.41 
 
 		 350 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2306  hypothetical protein  38.04 
 
 		 360 aa  226  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0973  hypothetical protein  38.37 
 
 		 360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.500079  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3857  hypothetical protein  37.68 
 
 		 356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2084  hypothetical protein  38.19 
 
 		 360 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5880  hypothetical protein  38.53 
 
 		 356 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0647392 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2140  hypothetical protein  38.67 
 
 		 360 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0419324  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2272  hypothetical protein  38.67 
 
 		 360 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.143558  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0212  hypothetical protein  37.05 
 
 		 380 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3230  hypothetical protein  39.66 
 
 		 169 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4140  hypothetical protein  25.55 
 
 		 408 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.23808 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  40 
 
 		 388 aa  43.9  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  32.53 
 
 		 433 aa  43.9  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0619  putative protein serine/threonine phosphatase  37.25 
 
 		 733 aa  43.1  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163625  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  42 
 
 		 1105 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0354  putative protein serine/threonine phosphatase  41.18 
 
 		 680 aa  42.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.526454 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>