More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7134 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7134  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 404 aa  827    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.713185 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7257  threonyl-tRNA synthetase, class IIA  71.39 
 
 		 477 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5039  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  60.8 
 
 		 402 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 644 aa  461  1e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 		 635 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2196  threonyl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 640 aa  442  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.163846  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 		 635 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 		 635 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 		 635 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 		 635 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 		 635 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 		 635 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 		 635 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2417  threonyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 		 644 aa  443  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00010604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  53.73 
 
 		 635 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2149  threonyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 641 aa  442  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  53.73 
 
 		 635 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 		 635 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1577  threonyl-tRNA synthetase  53.57 
 
 		 635 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704052  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 		 640 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 		 640 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2098  threonyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 		 644 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000824061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2668  threonyl-tRNA synthetase  51.59 
 
 		 652 aa  441  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.107403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 635 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 635 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 635 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 635 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  53.47 
 
 		 635 aa  441  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 		 640 aa  437  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 635 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3487  threonyl-tRNA synthetase  52.41 
 
 		 643 aa  437  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 635 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 635 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 635 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10531  threonyl-tRNA synthetase  49.73 
 
 		 638 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.487806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2465  threonyl-tRNA synthetase  52.93 
 
 		 640 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  53.99 
 
 		 638 aa  433  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3481  threonyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 640 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800828  normal  0.0249513 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  52.82 
 
 		 640 aa  431  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3225  threonyl-tRNA synthetase  52.93 
 
 		 640 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.529889 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  51.39 
 
 		 644 aa  434  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0385  threonyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 		 646 aa  428  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.752042  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4525  threonyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 659 aa  430  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.082511 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1721  threonyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 		 648 aa  431  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1967  threonyl-tRNA synthetase  52.66 
 
 		 640 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134711  normal  0.0132251 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0851  threonyl-tRNA synthetase  50.88 
 
 		 646 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  50.89 
 
 		 640 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  50.65 
 
 		 641 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2504  threonyl-tRNA synthetase  51.15 
 
 		 640 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2039  threonyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 		 646 aa  428  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0934  threonyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 		 633 aa  425  1e-118  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.026136  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2805  threonyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 		 633 aa  427  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 		 636 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1010  threonyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 640 aa  427  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1090  threonyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 585 aa  424  1e-117  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  52.67 
 
 		 638 aa  422  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0978  threonyl-tRNA synthetase  49.11 
 
 		 633 aa  423  1e-117  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06531  threonyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 		 640 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2597  threonyl-tRNA synthetase  50.13 
 
 		 645 aa  423  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000186587  hitchhiker  0.000386738 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2219  threonyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 635 aa  423  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00166056  normal  0.0562711 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2099  threonyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 		 635 aa  421  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0942  threonyl-tRNA synthetase  49.73 
 
 		 642 aa  419  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484442  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0033  threonyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 641 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.611945  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20420  threonyl-tRNA synthetase  52.04 
 
 		 640 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18621  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 640 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003716  threonyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 642 aa  421  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000263633  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 635 aa  418  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2020  threonyl-tRNA synthetase  51.28 
 
 		 635 aa  421  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0006  threonyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 633 aa  420  1e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.999215  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02079  threonyl-tRNA synthetase  49.73 
 
 		 642 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01688  threonyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 642 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1923  threonyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 642 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000181503  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06531  threonyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 638 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.218915  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1937  threonyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 642 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227542  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2299  threonyl-tRNA synthetase  49.87 
 
 		 642 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1724  threonyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 642 aa  415  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0116827  normal  0.392039 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01677  hypothetical protein  49.1 
 
 		 642 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0538316  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2053  threonyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 642 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.22159  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1800  threonyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 642 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000021107  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1951  threonyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 642 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250897  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06231  threonyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 638 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  51.15 
 
 		 638 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 635 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 635 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 635 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1961  threonyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 642 aa  415  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000224309  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1472  threonyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 642 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000205456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2437  threonyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 		 642 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00126815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01383  threonyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 		 649 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1913  threonyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 642 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.121147  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0844  threonyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 		 642 aa  416  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1955  threonyl-tRNA synthetase  49.87 
 
 		 642 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000861339  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2021  threonyl-tRNA synthetase  49.87 
 
 		 642 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0151437  normal  0.0679206 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2043  threonyl-tRNA synthetase  49.87 
 
 		 642 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000275607  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06621  threonyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 638 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.296705  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0955  threonyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 		 648 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.843203  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2909  threonyl-tRNA synthetase  49.73 
 
 		 636 aa  412  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2625  threonyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 		 642 aa  414  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000821618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1478  threonyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 660 aa  412  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000148351  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1712  threonyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 		 642 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000703633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>