More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1090 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  55.32 
 
 		 635 aa  672    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 635 aa  654    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 		 635 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 		 640 aa  666    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1090  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 585 aa  1221    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2400  threonyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 639 aa  648    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459202  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 638 aa  653    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0978  threonyl-tRNA synthetase  54.74 
 
 		 633 aa  648    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1577  threonyl-tRNA synthetase  55.92 
 
 		 635 aa  654    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2196  threonyl-tRNA synthetase  53.67 
 
 		 640 aa  645    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.163846  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1071  threonyl-tRNA synthetase  53 
 
 		 658 aa  635    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 640 aa  639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  53.87 
 
 		 640 aa  661    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 		 640 aa  637    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 		 635 aa  676    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 640 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  53.38 
 
 		 638 aa  647    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  54.72 
 
 		 635 aa  659    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1007  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  54.61 
 
 		 637 aa  639    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.245371  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 		 635 aa  682    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 		 635 aa  676    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 		 635 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 		 635 aa  677    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 		 635 aa  679    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 		 635 aa  676    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  52.89 
 
 		 642 aa  645    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2149  threonyl-tRNA synthetase  56.33 
 
 		 641 aa  661    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0777  threonyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 		 654 aa  638    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.795013  normal  0.073481 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 		 635 aa  676    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  53.26 
 
 		 638 aa  662    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3487  threonyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 		 643 aa  689    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  55.85 
 
 		 635 aa  677    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 		 635 aa  667    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 669 aa  657    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 636 aa  664    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1448  threonyl-tRNA synthetase  52.6 
 
 		 639 aa  645    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  54.28 
 
 		 635 aa  663    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  54.65 
 
 		 635 aa  646    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  54.97 
 
 		 635 aa  672    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  56.02 
 
 		 635 aa  680    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  55.42 
 
 		 635 aa  670    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 		 635 aa  676    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1721  threonyl-tRNA synthetase  55.06 
 
 		 648 aa  659    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 		 635 aa  675    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3025  threonyl-tRNA synthetase  55.34 
 
 		 638 aa  657    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1745  threonyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 637 aa  662    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239329 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0844  threonyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 642 aa  638    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1010  threonyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 		 640 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  55.32 
 
 		 635 aa  672    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 		 641 aa  679    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 		 644 aa  651    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  55.32 
 
 		 635 aa  672    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 		 635 aa  675    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4616  threonyl-tRNA synthetase  53.46 
 
 		 643 aa  656    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213357 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 		 635 aa  666    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 641 aa  659    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2154  threonyl-tRNA synthetase  53.25 
 
 		 661 aa  632  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18621  threonyl-tRNA synthetase  52.82 
 
 		 640 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3089  threonyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 		 639 aa  632  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.345995  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2668  threonyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 		 652 aa  632  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.107403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1888  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  53.53 
 
 		 635 aa  634  1e-180  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150098 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1638  threonyl-tRNA synthetase  52.04 
 
 		 660 aa  633  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.360122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1035  threonyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 693 aa  630  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.233676  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1098  threonyl-tRNA synthetase  52.04 
 
 		 648 aa  629  1e-179  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00129909  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2219  threonyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 		 635 aa  629  1e-179  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00166056  normal  0.0562711 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2321  threonyl-tRNA synthetase  52.78 
 
 		 675 aa  625  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.313721 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2504  threonyl-tRNA synthetase  52.11 
 
 		 640 aa  626  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2276  threonyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 675 aa  627  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.644859 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  50.97 
 
 		 644 aa  625  1e-178  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3538  threonyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 648 aa  625  1e-178  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.211804 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  52.11 
 
 		 640 aa  627  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0641  threonyl-tRNA synthetase  53.5 
 
 		 658 aa  627  1e-178  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2465  threonyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 		 640 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2032  threonyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 642 aa  622  1e-177  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0621532  hitchhiker  0.0000404638 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0934  threonyl-tRNA synthetase  51.77 
 
 		 633 aa  622  1e-177  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.026136  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3225  threonyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 		 640 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.529889 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0385  threonyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 646 aa  622  1e-177  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.752042  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1760  threonyl-tRNA synthetase  51.04 
 
 		 642 aa  622  1e-177  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000746645  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10531  threonyl-tRNA synthetase  51.5 
 
 		 638 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.487806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0006  threonyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 		 633 aa  622  1e-177  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.999215  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3886  threonyl-tRNA synthetase  52.55 
 
 		 687 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2039  threonyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 646 aa  622  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2598  threonyl-tRNA synthetase  52.78 
 
 		 675 aa  624  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.311261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3481  threonyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 640 aa  621  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800828  normal  0.0249513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2263  threonyl-tRNA synthetase  51.41 
 
 		 642 aa  619  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2299  threonyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 		 642 aa  619  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 637 aa  621  1e-176  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 637 aa  621  1e-176  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1931  threonyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 		 640 aa  618  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1054  threonyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 		 660 aa  619  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290687  normal  0.56724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6323  threonyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 		 670 aa  621  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103626 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1799  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  50.26 
 
 		 632 aa  618  1e-176  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.302616  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2597  threonyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 645 aa  620  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000186587  hitchhiker  0.000386738 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0851  threonyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 646 aa  619  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2368  threonyl-tRNA synthetase  52.91 
 
 		 644 aa  620  1e-176  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.642893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1967  threonyl-tRNA synthetase  51.05 
 
 		 640 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134711  normal  0.0132251 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1765  threonyl-tRNA synthetase  51.66 
 
 		 642 aa  620  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0145935  normal  0.0322125 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2909  threonyl-tRNA synthetase  50.69 
 
 		 636 aa  617  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0033  threonyl-tRNA synthetase  52.14 
 
 		 641 aa  618  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.611945  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0294  threonyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 637 aa  615  1e-175  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>