24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3706 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3706  protein of unknown function DUF1504  100 
 
 
420 aa  820    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6366  protein of unknown function DUF1504  66.9 
 
 
419 aa  537  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4249  hypothetical protein  66.43 
 
 
418 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0262824 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2221  hypothetical protein  58.35 
 
 
416 aa  449  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.870446  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1031  protein of unknown function DUF1504  58.75 
 
 
419 aa  445  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2982  hypothetical protein  56.53 
 
 
430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2290  hypothetical protein  55.95 
 
 
420 aa  442  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1151  hypothetical protein  56.11 
 
 
416 aa  443  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3081  hypothetical protein  55.45 
 
 
416 aa  434  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00617658  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2148  hypothetical protein  56.66 
 
 
416 aa  431  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000425071 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1134  hypothetical protein  56.4 
 
 
416 aa  431  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.045317  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4450  hypothetical protein  58.03 
 
 
419 aa  425  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.1095 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0367  hypothetical protein  58.29 
 
 
419 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0028  hypothetical protein  53.24 
 
 
419 aa  412  1e-114  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0036  hypothetical protein  53 
 
 
419 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3959  hypothetical protein  60.25 
 
 
425 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0651947  normal  0.676574 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1858  hypothetical protein  50.71 
 
 
420 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.810653  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1562  protein of unknown function DUF1504  50.6 
 
 
420 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3627  hypothetical protein  46.07 
 
 
509 aa  327  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1617  protein of unknown function DUF1504  41.44 
 
 
537 aa  311  1e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3403  hypothetical protein  45.61 
 
 
447 aa  273  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3486  protein of unknown function DUF1504  44.88 
 
 
486 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3550  protein of unknown function DUF1504  44.63 
 
 
486 aa  263  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0189  hypothetical protein  27.59 
 
 
450 aa  180  4.999999999999999e-44  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00928338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>